江苏省自然科学基金(BK2008335)
- 作品数：11 被引量：110H指数：8
- 相关作者：章元明李广军李河南汪霞徐宇更多>>
- 相关机构：南京农业大学临沂师范学院更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”江苏省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 利用Bayes分层广义线性模型剖析大豆籽粒性状的遗传基础被引量：4
- 2013年
- 以溧水中子黄豆（P1）和南农493-1（P2）组合的504个正反交F2：3~F2：7家系群体为材料, 调查大豆粒长、粒宽、粒厚、长宽比、长厚比、宽厚比和百粒重性状在2007—2011年的表型观测值, 扫描F2群体SSR分子标记信息, 用Bayes分层广义线性模型方法检测了上述性状的主效QTL、QTL′环境（QE）互作、QTL′细胞质（QC）互作和QTL′QTL（QQ）互作。共检测到89个主效QTL、33对QE、20对QC和35对QQ互作。上述7个性状的主效QTL分别有7、10、10、19、19、17和7个; QQ互作分别有1、10、6、0、6、9和3对, 没有检测到显性′显性互作; QE互作分别有5、7、6、3、6、2和4对; QC互作分别有2、1、3、8、4、2和0对。主效、QQ互作、QC互作和QE互作QTL的总贡献率分别为12.42%~61.79%、0~23.21%、0.35%~1.51%和0~14.16%, 表明主效QTL贡献最大, QQ互作次之, QE互作最小。各类QTL都有一因多效现象, 同一基因座可通过不同方式影响性状表达。这些结果揭示了大豆粒形性状的遗传基础, 为标记辅助育种提供了参考信息。
- 闫宁谢尚潜耿青春徐宇李广军刘兵汪霞李其刚章元明
- 关键词：大豆上位性
- 大豆粒形性状QTL的精细定位被引量：13
- 2013年
- 在溧水中子黄豆×南农493-1衍生的504个F2:6家系中选择Satt331～Satt592目标区间7个杂合单株和168个重组单株,衍生成356株RHL-F2个体(群体Ⅰ)和168个重组体家系(群体Ⅱ)。群体Ⅱ来自142个F2:6家系,若每个F2:6家系只保留1个重组家系则构成群体Ⅲ。采用lasso和复合区间作图(CIM)法检测3个群体粒形性状2种指标的QTL。结果表明,lasso法检测到的粒长关联标记是O19和S21/Satt331,而CIM检测到的QTL区间是S21～S22和O23～O19;lasso法检测到的粒宽关联标记是O19/O21,而CIM检测到的QTL区间是O23～O19/O19～O21;长宽比与S21～S22关联是由于粒长QTL引起的,与O23～O19/O19～O21关联是由于粒长和粒宽QTL引起的。将原Satt331～Satt592目标区间的粒长QTL剖分为与标记S21～S22和O23～O19/O19～O21关联的2个多效性QTL。根据大豆基因注释数据库,Glyma10g35240和Glyma10g34980可能是控制粒形性状发育的候选基因。
- 牛远谢芳腾布素红谢尚潜韩世凤耿青刘兵章元明
- 关键词：大豆粒形数量性状基因座候选基因
- 大豆百粒重QTL定位被引量：11
- 2010年
- 大豆百粒重是产量构成的重要因素之一,与产量呈正相关。本研究以溧水中子黄豆和南农493-1的504个F2正反交单株及其亲本间具有多态性的150个SSR标记信息构建连锁图谱,2008年分别在江苏南京和山东临沂两地种植其衍生的正反交F2:4家系,鉴定其百粒重,应用Win QTL CartographerV2.5复合区间作图法和两地正反交联合分析进行QTL定位。结果表明,复合区间作图法检测到16个主效QTL,联合分析检测到24个主效QTL、环境效应与细胞质效应、1个环境×QTL互作和12个细胞质×QTL互作。其中,两方法共同检测到10个主效QTL,正反交群体在两地中共同检测到3个主效QTL;Meta分析发现与其他研究一致的4个QTL。这些结果为大豆产量遗传与标记辅助育种实践提供理论基础。
- 汪霞徐宇李广军李河南艮文全章元明
- 关键词：大豆百粒重数量性状基因座质核互作META分析
- 中国栽培大豆群体结构不同分类方法的比较被引量：22
- 2011年
- 利用215个大豆品种的135个分子标记数据,用STRUCTURE软件、PowerMarker软件和地理生态类型3种分类方法研究了大豆品种的群体遗传结构,以探索适宜的分类方法。结果表明:用STRUCTURE软件分类时,亚群间成对分化系数(Fst)的平均值最大,为0.108 3,含有相同最高频率等位基因的位点数最小,为85,说明各亚群间遗传差异最大;亚群内遗传多样度(Hs)为0.491,多态性信息含量(PIC)为0.737 6,群体内分化系数(Fis)为0.974,均为最小,说明亚群内个体间遗传相似性最高。因此,用STRUCTURE软件研究群体遗传结构最适宜。
- 魏世平刘晓芬杨胜先吕海燕牛远章元明
- 关键词：聚类分析大豆
- 大豆株高QTL定位及Meta分析被引量：9
- 2011年
- 以溧水中子黄豆和南农493-1杂交衍生的504个正反交F2:4家系为研究对象,于2008年在江苏南京和山东临沂两地种植,鉴定其株高表型。采用多QTL联合分析方法进行QTL分析,检测到株高存在环境效应和细胞质效应,定位了15个主效QTL、2个与环境互作的QTL和6个与细胞质互作的QTL。将Soybase数据库中信息完全的90个株高QTL和本研究检测的株高QTL映射到大豆公共图谱soymap 2上,利用BioMercator 2.1软件进行Meta分析。结果表明:分布于C2、F、L和M染色体上的18个较小置信区间存在一致性QTL,其中包括本研究发现的C2染色体上的qPH-6-2、qPH-6-3和M染色体上的qPH-7-1、qPH-7-2、qPH-7-3共5个QTL。
- 汪霞徐宇李广军李河南章元明
- 关键词：大豆株高数量性状基因座META分析
- 大豆粒形的主基因＋多基因混合遗传被引量：10
- 2009年
- 大豆粒形直接与产量相关,对其粒长、粒宽的遗传规律分析可以为其数量性状基因座定位、分子标记辅助选择育种和基因克隆奠定基础。调查大豆杂交组合溧水中子黄豆(P1)×南农493-1(P2)正反交的P1、P2、F1和F2:3四个世代的粒长和粒宽的表型资料,运用四个世代联合的主基因+多基因混合遗传分析方法,对这两个性状分别进行了遗传分析。结果表明:正反交杂种F1粒长和粒宽有显著差异,存在母性效应;粒长性状受一对加性-显性主基因和加性-显性-上位性多基因共同控制;粒宽受多基因控制。
- 李河南汪霞李广军程利国何小红张国政章元明
- 关键词：粒长粒宽
- 大豆叶绿素含量动态表达的QTL分析被引量：12
- 2010年
- 叶绿素是光合作用中最重要的色素,与大豆籽粒产量密切相关。本研究采用溧水中子黄豆×南农493-1后代衍生的244个F2单株及筛选的150个SSR分子标记构建的连锁遗传图谱,在苗期至开花期测定F2衍生F2:3和F2:4家系生长正常单株的倒3复叶功能叶(非离体)的叶绿素含量13次,通过Windows QTL Cartographer v2.5软件包的复合区间法,动态定位了大豆叶绿素含量的QTL。结果表明,不同时间点共检测到20个QTL,其中,不同发育阶段间、年份间和地点间共同的QTL较少,不同时间点上的QTL差异较大,重复出现在N、D1a、F和K连锁群的QTL有3～4次。这些结果为叶绿素含量的遗传剖析和标记辅助育种提供理论依据。
- 李广军李河南程利国章元明
- 关键词：大豆叶绿素含量QTL
- 大豆对豆卷叶螟抗性的QTL定位被引量：3
- 2009年
- 豆卷叶螟是南京地区的主要食叶性害虫。以抗性亲本溧水中子黄豆和感性亲本南农493-1杂交组合正交F2群体为材料,在田间自然虫源条件下F2单株叶片损失率为抗性指标,利用已构建的SSR分子标记图谱和Windows QTL Cartographer V2.5软件包的复合区间作图法和多区间作图法,定位大豆对豆卷叶螟抗性的QTL。结果表明:利用复合区间作图法检测到位于D1b和K连锁群上的2个QTL;利用多区间作图法则检测到位于A2、D1b、K和N连锁群上的4个QTL和6个互作QTL;其中有两个共同的QTL,至少解释表型变异的19.2%。这些结果为抗性性状的遗传剖析和标记辅助育种提供理论依据。
- 李广军李河南程利国章元明
- 关键词：豆卷叶螟QTL大豆
- 关联图分析:一种基于连锁图的QTL综合分析方法被引量：1
- 2010年
- 通过统合分析整合多个独立实验QTL(quantitative trait locus)定位结果获得的一致性QTL,可为标记辅助育种和基因图位克隆提供坚实基础.但是这种方法没有充足的生物学背景支撑,而且遗传图谱间不同映射会严重影响分析结果.为此,本文提出一种基于连锁图的QTL综合分析法,简称关联图分析.首先,利用连锁群构建图模型;然后,利用非监督分类法来寻找基因组间具有模式性共分离趋势的标记区间;最后,通过频繁集挖掘法对这些标记区间挖掘以获得与QTL紧密连锁的分子标记(区间).新方法通过Monte Carlo模拟研究和3个棉花QTL定位结果的综合分析予以证实.新方法的优点在于:不需要构建参考图谱;利用基因组间的分子标记模式性共分离趋势来查找特异性QTL,在一定程度上排除了初始QTL的干扰;通过非特异性QTL获得的具有潜在育种价值的分子标记,在作物育种上更有利用价值.
- 匡峰磊汪霞周玲章元明
- 关键词：连锁图数量性状基因座
- 植物数量遗传学的建立、发展与展望被引量：24
- 2012年
- 论述了植物数量遗传学的建立、发展与展望。重点介绍了南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室在植物数量遗传方面的研究进展,包括学科建立、主基因+多基因混合遗传分析的拓展、纯系品种群体和遗传交配设计群体的基因挖掘及基因的分子进化研究。展望了植物数量遗传的可能发展方向,包括遗传分析与作物育种和生物信息学相结合,以及海量信息分析与云计算相结合。目的在于引导植物遗传工作者的思考。
- 章元明
- 关键词：多基因基因进化
