辽宁省教育厅科学基金(2009A464)
- 作品数：1 被引量：4H指数：1
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- 相关机构：中国科学院辽宁医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金辽宁省教育厅科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学理学更多>>
- 中蜂囊状幼虫病毒结构蛋白预测与鉴定被引量：4
- 2011年
- 采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法、生物信息学软件和质谱分析对中蜂囊状幼虫病毒(CSBV)辽宁株(CSBV-LN)全基因组进行了分子克隆、序列测定、分子生物学特性分析及结构蛋白预测和鉴定.结果表明,CSBV-LN全基因组序列长度为8863个核苷酸,编码一个大的开放阅读框,其中包括178 nt的5'非编码区的前导序列和79 nt的3'非编码区,后面跟着一个poly(A)的尾巴.通过软件分析表明,CSBV-LN蛋白序列类似于哺乳动物的小RNA病毒蛋白序列,预计存在VP1,VP2,VP3和VP4等4个小的结构蛋白;系统进化分析表明,CSBV、囊状幼虫病毒(SBV)和残翅病毒(DWV)的起源相同,推测CSBV有着类似DWV的结构蛋白序列5'-VP2-VP4VP1VP3-3.基于此,根据PAGE蛋白条带的大小,利用NetPicoRNA软件预测结构蛋白的裂解位点.在此基础上,对纯化后的CSBV进行SDS-PAGE分离,对分离到的4个蛋白进行质谱分析,结果鉴定出VP1,VP3和VP0 3个蛋白.
- 马鸣潇马臣程健谢振声李明费东亮
- 关键词：反转录聚合酶链反应结构蛋白质谱分析
