国家自然科学基金(30260116)
- 作品数：4 被引量：8H指数：2
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- 相关机构：广西壮族自治区人民医院复旦大学更多>>
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- 相关领域：医药卫生更多>>
- 基因指纹法预测鼻咽癌放射敏感性初步研究被引量：3
- 2007年
- 目的:研究放射敏感与放射抵抗的鼻咽癌组织基因表达差异,寻找预测鼻咽癌放射敏感性基因指纹。方法:采用BioStarH-141s(2004)型含14112点的人类全长基因cDNA表达谱芯片,对19例不同放射敏感性鼻咽癌组织进行检测,其中放射敏感8例,放射抵抗11例,用T-test检验、聚类、LOOCV等方法进行生物信息分析。结果:放射抵抗组与放射敏感组比较,表达差异的基因P<0.5有923条,P<0.01有164条,P<0.001有17条;与慢性炎症组织相比,放射敏感组70%以上病例有2倍以上表达差异的基因267条,明显高于放射抵抗组106条。这些基因包括已知的与放射敏感性密切相关的基因PRKD,DCK等;还有大部分以前没有描述与放射敏感性相关的基因,如SIRT1,RABAC1,PPP1CC,ZNF638,APPBP1,RABAC1等,它们主要与细胞周期、S期和M期调控点、细胞凋亡、细胞生长、DNA绑定,RNA绑定等功能有关;还有一些新发现的,功能尚未明确的基因,如CUTA,ZNF148,Sep15,TMTC3,TOP1等。取P<0.01的差异表达基因98条进行聚类分析,19例患者能分成放射敏感与抵抗二类,除1例外,所有病例敏感性的分类均与临床结果相符。用LOOCV验证,准确率100%。结论:不同放射敏感性的鼻咽癌组织,基因表达存在明显差异,与炎症组织比较,放射敏感组的基因表达差异更大,可利用差异基因簇进行放射敏感性分类,提示可利用基因指纹法进行鼻咽癌放射敏感性预测。
- 陈甲信郭懿李瑶张政司勇锋冯国生程金建邓卓霞
- 关键词：鼻咽癌基因表达谱
- 鼻咽癌组织照射2 Gy前后基因表达差异研究被引量：2
- 2007年
- 目的研究鼻咽癌组织照射2 Gy后基因表达谱的变化。方法采用B ioStarH-141 s(2004)型含14 112点的人类全长基因cDNA表达谱芯片,对1例放射敏感的鼻咽癌组织进行放疗前及放疗2 Gy后检测,并分析它们之间的基因表达差异。结果鼻咽癌放疗2 Gy后与放疗前比较,组织表达差异基因共38个,其中上调28个,下调10个。表达差异基因中改变最明显的功能群是免疫系统相关的基因,如IGLV 1-44、SLPI、CXCL 14、IL1RN、HLA-DQA 1、HLA-DOA等上调。细胞增殖、细胞调亡、细胞周期、DNA修复系统也有部分基因发生明显变化,如MLL 5上调、POLR2B下调等。结论提示对鼻咽癌组织照射2 Gy后基因表达谱改变的研究可以更好地阐明放射敏感性差异机理,为放疗前或放疗早期寻找到预测放射敏感性分子标志提供理论依据。
- 陈甲信郭懿冯国生陈可和司勇锋周薇亚刘时才张政韦海明程金健李瑶
- 关键词：鼻咽癌基因表达谱
- 基因表达谱芯片筛选鼻咽癌相关基因被引量：4
- 2007年
- 背景与目的:基因表达谱芯片是一种高通量,快速的检测基因表达量的手段。本研究利用这种新兴技术来研究鼻咽癌组织与鼻咽慢性炎症组织基因表达差异,以寻找鼻咽癌新的肿瘤相关候选基因和分子标志。方法:采用BioStarH-141s(2004)型含14112点的人类全长基因cDNA表达谱芯片对20例鼻咽癌组织及15例鼻咽慢性炎症组织进行检测,并用生物统计学及生物信息学方法分析它们之间的基因表达差异。结果:和鼻咽慢性炎症组织相比,20例放疗前鼻咽癌组织存在着大量的差异表达基因,涉及基因包括癌基因与原癌基因、免疫相关基因、细胞分裂、分化、增殖和凋亡相关基因、信号与蛋白传递相关基因、DNA结合转录和转录因子,一些生物酶的酶活调节等。结论:用基因表达谱芯片可以筛选出许多不同种类的参与鼻咽癌病变过程的重要基因,这为揭示鼻咽癌复杂的病变机理提供了研究的方向。
- 陈甲信郭懿张政司勇锋冯国生陈可和韦海明程金健邓卓霞李瑶
- 关键词：鼻咽癌基因表达基因芯片
- 基因表达谱在肿瘤放射敏感性研究中的应用被引量：1
- 2007年
- 放疗是肿瘤局部治疗重要手段之一,肿瘤细胞具有放射敏感异质性,同种类肿瘤患者放疗反应不尽相同。基因表达谱能从mRNA和蛋白质表达水平反映细胞或组织特异性表型。绘制出每种肿瘤发生、发展、治疗、转归等过程中各特定阶段基因表达图谱,寻找特异性差异表达基因,是肿瘤基因组学的核心内容之一。基因表达谱不但可以用来构建肿瘤放射敏感性的基因表达谱,对肿瘤进行分子分型,还可以用来研究放射敏感性的分子机理或放射增敏剂的作用机理。已初步构建部分常见肿瘤,如肺癌、乳腺癌、子宫颈癌、食道癌等放射敏感与抗拒细胞株及其放射前后不同时间、不同剂量点的基因表达谱;发现不少新的与放射敏感性相关的基因;通过生物信息分析方法,一些肿瘤已初步筛选出能代表放射敏感性的标志基因组合,主要包括细胞增殖、细胞周期、细胞凋亡和细胞损伤修复等功能密切相关的基因。这些基因不但可以作为诊断靶来判断病人的放射敏感性,还可以作为药靶,设计新的放射增敏剂,从而更好地进行个性化治疗。
- 陈甲信
- 关键词：基因表达谱肿瘤
