上海市卫生系统百名跨世纪优秀学科带头人培养计划(06XD14017)
- 作品数:5 被引量:12H指数:3
- 相关作者:熊爱生高峰彭日荷姚泉洪付晓燕更多>>
- 相关机构:上海市农业科学院南京农业大学扬州大学更多>>
- 发文基金:上海市卫生系统百名跨世纪优秀学科带头人培养计划国家高技术研究发展计划上海市青年科技启明星计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 一个新的葡萄抗逆转录因子VvERF2基因的In silico克隆及生物信息学分析
- 2008年
- ERF是植物所特有的一类重要的转录因子,广泛参与植物生长、发育以及多种生理生化反应的信号传导。本研究利用In silico克隆方法获得葡萄VvERF2基因,并利用生物信息学方法对该基因编码产物从氨基酸组成、理化性质、进化关系、二级及三级结构、功能等方面进行预测和分析。结果表明,VvERF2为亲水性蛋白,与其他物种的ERF在序列组成、结构及活性位点等方面均具有高度的一致性。
- 刘红锦高峰熊爱生彭日荷李贤蔡斌薛永付晓燕
- 关键词:ERF葡萄转录因子生物信息学
- 葡萄中一类AP2/EREBP-B1亚族转录因子的电子克隆及生物信息学分析被引量:3
- 2011年
- 采用电子克隆(In silico cloning)的方法获得3个葡萄ERF类转录因子VvERF2.1、VvERF2.2、VvERF2.3,利用生物信息学方法对基因推导的氨基酸序列从氨基酸组成、理化性质、进化关系、高级结构和功能等方面进行了预测和分析。结果表明:3个转录因子属于AP2/EREBP-B1亚族,与其他物种的ERF在序列组成、结构及活性位点等方面具有高度的一致性。
- 郑建立高峰田永生高建杰帅建军彭日荷熊爱生姚泉洪
- 关键词:葡萄AP2/EREBP电子克隆转录因子生物信息学
- 八棱海棠肌动蛋白基因(MrACT)的克隆及分析被引量:5
- 2008年
- 以八棱海棠(Malus micromalus Makino)为材料,抽取RNA,反转录成cDNA。采用cDNA末端快速扩增(RACE)方法,5’-RACE获得长度1121bp的片段、3’-RACE获得883bp的片段,再通过设计引物扩增得到八棱海棠中一种肌动蛋白基因的cDNA的全长序列。该序列全长1134bp,推测其编码377个氨基酸,等电点为5.16,其编码的氨基酸与拟南芥(Arabidopsis thaliana)actin7编码的氨基酸只有2个氨基酸差别。通过对八棱海棠MrACT基因的表达分析,发现在不同组织中,该基因的表达水平没有明显差异,本文为进一步利用RT-PCR技术,以MrACT基因为内标,研究八棱海棠其他基因的丰度打好基础。
- 徐锦涛章镇彭日荷熊爱生刘金戈周军蔡斌高峰付晓燕姚泉洪
- 关键词:八棱海棠肌动蛋白基因RACE内标
- 水稻转录因子DREB1的克隆与原核表达
- 2007年
- DREB类转录因子特异地与DRE顺式作用元件结合,在非生物逆境胁迫(干旱、低温、高盐)中激活胁迫诱导基因的表达,使植物能够耐受水分胁迫的影响。以顺式元件rd29A3 cis构建诱饵质粒.通过酵母单杂交方法从水稻cDNA文库中筛选获得7个阳性质粒,序列分析显示阳性质粒中插入的cDNA序列一致,根据核苷酸序列推导出cDNA编码一219个氨基酸组成的多肽,该多肽有保守的EREBP/AP2结构域,N端为核定位信号(NLS),而C端则为转录激活区域,属于EREBP/AP2类转录因子,命名为RdreB1。重新合成的RdreB1 I基因降低了GC比含量,诱导处理产生了约45 kD的特异表达的融合蛋白。
- 高峰姚泉洪秦秋琳刘金戈熊爱生彭日荷洪义欢陈建民
- 关键词:DREB转录因子酵母单杂交水稻
- 水稻热休克转录因子OsHSF13的克隆与生物信息学的初步分析(简报)被引量:4
- 2007年
- 环境刺激的信号转导是植物信号转导的一个重要研究方向。热激反应(heat—shock response。HSR)是动植物细胞或器官在遇到外界热刺激时所产生的一种保护性反应。是正常的蛋白质合成受阻时产生热激蛋白(heat—shock protein,HSP)的一种细胞生理活动。
- 武丽娟章镇彭日荷熊爱生刘金戈付晓燕高峰姚泉洪
- 关键词:酵母单杂交水稻