国家自然科学基金(31330005) 作品数:7 被引量:18 H指数:3 相关作者: 王睿瑞 赵立平 王金星 费娜 吴国军 更多>> 相关机构: 上海交通大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 农业科学 更多>>
枯草芽孢杆菌YK-1R对断奶仔猪肠道菌群的影响 被引量:5 2018年 本研究旨在运用高通量测序技术研究益生菌Bacillus subtilis YK-1R对断奶仔猪肠道菌群的影响。挑选21日龄断奶仔猪14头,随机分成两组,即益生菌组与空白对照组,每组各7头仔猪。益生菌组每头仔猪每天灌胃15 m L浓度为109cfu/m L的益生菌,对照组每天灌胃15 m L磷酸缓冲液(PBS)。在实验第0天、第14天、第28天采集每头仔猪新鲜粪便样品,采用高通量测序技术分析仔猪肠道菌群组分与结构变化。研究表明,在实验第14天时,益生菌显著提高断奶仔猪生长性能(p〈0.01)、肠道菌群alpha多样性(p〈0.05),降低仔猪腹泻率,提高饲料利用率;基于unweighted Uni Frac距离多元方差分析(MANOVA)表明,此时益生菌组与对照组仔猪肠道菌群结构有显著差异(p〈0.01)。由此可见,益生菌Bacillus subtilis YK-1R能增加仔猪肠道菌群多样性,促进仔猪健康生长。 陈丽梅 徐岳松 陈峰关键词:断奶仔猪 肠道菌群 BACILLUS SUBTILIS 高通量测序 两株嗜黏蛋白阿克曼氏菌特异性影响小鼠溃疡性结肠炎 2020年 炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)的发生发展与肠道菌群有密切关系。嗜黏蛋白阿克曼氏菌是一种能够专一性地降解肠道黏蛋白的细菌,其在IBD患者以及动物模型肠道中丰度的显著改变暗示其可能影响IBD的发生发展。本研究采用两株嗜黏蛋白阿克曼氏菌,人源ATCC菌株和鼠源139菌株,采用葡聚糖硫酸钠(dextran sulphate sodium,DSS)诱导的急性溃疡性结肠炎小鼠模型,探究两株菌对于急性溃疡性结肠炎小鼠生理表型以及肠道菌群影响。研究发现灌喂ATCC菌株的小鼠在实验后期体重、结肠长度显著小于DSS对照小鼠,同时有着更高的DAI指数以及结肠组织学评分。而灌喂139菌株的小鼠表型与DSS对照小鼠没有显著差异,说明嗜黏蛋白阿克曼氏菌ATCC菌株显著抑制了小鼠急性结肠炎的恢复,而139菌株没有。在肠道菌群方面,ATCC菌株以及139菌株均显著改变了小鼠的肠道菌群结构,通过稀疏偏最小二乘判别分析(sparse partial least squares discriminant analysis,sPLS-DA)鉴定出24个可操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)响应ATCC菌株,19个OTU响应139菌株,而其中只有6个OTU对两株菌均有响应。综上所述,嗜黏蛋白阿克曼氏菌菌株对于急性溃疡性结肠炎的作用以及对肠道菌群的影响存在菌株特异性,强调了在菌株水平研究肠道菌群与IBD的关系的重要性。 翟芮 薛欣合 张晨虹关键词:肠道菌群 一名肥胖儿童营养干预后肠道内假小链双歧杆菌碳水化合物利用能力的探究 被引量:3 2015年 双歧杆菌被认为是肠道内的有益菌,可以利用膳食中的多种植物多糖或寡糖,能够被人体无法消化的复杂碳水化合物选择性富集。本研究采用序列引导的分离策略,于厌氧条件下采用MRS琼脂培养基,得到了一名肥胖儿童营养干预后肠道内优势的双歧杆菌。采用ERIC指纹图谱技术对分离物进行基因水平上的分型,并通过16S r RNA基因测序鉴定分离株的分类地位。73个双歧杆菌分离物分为5种ERIC类型,均为假小链双歧杆菌。与Bacteroides thetaiotaomicron ATCC 29148、Eschrichia coli D45和Anaerostipes hadrus BPB5这些肠道中常见共生菌的代表菌株相比,丰度最高的ERIC类型代表菌株Bifidobacterium pseudocatenulatum C95利用复杂碳水化合物的能力更强。Bifidobacterium pseudocatenulatum C95被膳食中的复杂碳水化合物和益生元显著富集,成为该儿童营养干预后肠道内的优势菌。菌株自身较强的碳水化合物利用能力可能是其生长优于肠道中其他共生细菌的原因。 吴欢 王睿瑞 赵宇峰 庞小燕 申剑 张晨虹关键词:肠道菌群 阴沟肠杆菌B29菌株脂多糖合成基因(waaL,waaG)缺失突变株的构建及分析 被引量:6 2014年 脂多糖(LPS)在革兰氏阴性细菌中的功能作用在不同菌株中已有研究,但尚未有对肠杆菌属LPS结构与功能的报道。本研究试图构建能引起肥胖的阴沟肠杆菌B29菌株waaL和waaG基因的缺失突变株,以了解突变体菌株产生的LPS结构与活性与野生菌株产生的LPS的差异。根据同源重组技术原理,利用广宿主自杀性质粒构建成敲除载体pKNG101△waaL和pKNG101△waaG,转化E.coli SM10菌株,并与B29菌株进行双亲杂交,再以抗生素和蔗糖筛选条件筛选waaL和waaG基因缺失突变株;利用多重PCR、ERICPCR、PCR-DGGE、DNA测序结果均证实突变株B29△waaL和B29△waaG构建成功;最后,对野生菌株B29与两个突变株生物学特性的差异进行了比较。银染实验结果表明野生型B29菌株的脂多糖为光滑型结构,突变株的LPS结构明显缺失O抗原,B29△waaG突变株同时还缺失了外部核心部分;用鲎试剂法检测LPS的内毒素活性显示,突变株的内毒素活性与野生型相比有较大幅度下降;B29△waaL突变株的生长速率与野生型相当,而B29△waaG突变株的生长速率则相对降低。本研究成功构建两种内毒素活性下降的突变株,为下一步利用突变株研究B29菌株在肥胖发生中的机制奠定基础。 王金星 费娜 王睿瑞 吴国军 张梦晖 赵立平 张晓君关键词:阴沟肠杆菌 脂多糖 一株节食小鼠肠道优势鼠乳杆菌加速DSS致慢性结肠炎恢复 被引量:2 2021年 肠道菌群在炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)的发生和发展中扮演着非常重要的角色,补充益生菌有望成为缓解和治疗IBD的有效手段。本研究旨在利用高通量测序技术研究一株从节食小鼠肠道内分离的优势鼠乳杆菌(Lactobacillus murinus)CR147对葡聚糖硫酸钠(dextran sulphate sodium,DSS)诱导的慢性结肠炎小鼠肠道炎症及肠道菌群的影响。该菌株在先前的研究中已被证明有降低相关炎症的重要作用。给DSS造模完成后的小鼠灌胃CR147菌株,可以加速疾病活动指数和小鼠粪便中指示肠道炎症的标志物Lipocalin-2水平的恢复,显著改善DSS导致的肠道菌群α多样性的下降。另外,基于Bray-Curtis距离的主坐标分析和多元方差分析(multivariate analysis of variance,MANOVA)表明,补充CR147菌株显著改变了小鼠肠道菌群的整体结构,并且肠道菌群组成在门和属水平上也与对照组有显著差异。通过稀疏偏最小二乘判别分析(sparse partial least squares discriminant analysis,s PLS-DA)模型鉴定出37个响应CR147菌株的可操作分类单元(operational taxonomic units,OTU),其中19个OTU的丰度在CR147组中显著增加,12个OTU丰度显著降低。综上,鼠乳杆菌CR147菌株能加快小鼠DSS诱导的慢性结肠炎的恢复并改变其肠道菌群,这些发现预示CR147菌株可能是通过调节肠道菌群来发挥抗炎效果。 陈晓瑜 陈峰 张晨虹关键词:乳杆菌 三种胆汁酸盐对Bilophila wadsworthia菌株生长的影响 2015年 本研究通过体外纯培养实验研究了3种胆汁酸盐:牛磺胆酸(TCA)、胆酸(CA)和脱氧胆酸(DCA),对沃氏嗜胆菌(Bilophila wadsworthia)菌株的生长状况的影响。比浊法和活菌计数法结果表明,TCA能显著促进该菌株生长,与添加相同摩尔浓度的牛磺酸(TAU)带来的效应接近,而CA和DCA对该菌株无显著作用。通过超高效液相色谱-质谱技术分析B.wadsworthia菌株对TCA的代谢的结果显示TCA可被该菌株分解产生CA和TAU。Ca2+沉淀法对B.wadsworthia菌株产胆盐水解酶的能力进行鉴定的结果表明该菌株具有产胆盐水解酶的能力。由此推断,TCA对B.wadsworthia菌株的促进作用主要是通过其水解产生的TAU,而非CA来发挥的。 马晓庆 冯舟 赵宇峰 赵立平 龙文敏关键词:牛磺胆酸 胆酸 脱氧胆酸 胆盐水解酶 苦瓜全粉和苦瓜乙醇提取物健康功效的体外评估 被引量:2 2019年 本研究的目的是运用体外模型评估苦瓜全粉和苦瓜乙醇提取物的健康功效。苦瓜全粉和苦瓜乙醇提取物以7.5 mg/mL和15 mg/mL的剂量与新鲜粪便样品进行体外厌氧培养。通过454焦磷酸测序技术分析粪便菌群组成的变化,同时测定发酵上清中短链脂肪酸的含量以及对Caco-2单层细胞跨膜电阻的影响。结果显示,苦瓜全粉(15 mg/mL)可以明显地扶植Faecalibacterium属细菌,同时抑制Bilophila和Desulfovibrio属细菌的增殖;同等剂量的苦瓜全粉发酵上清中短链脂肪酸的含量明显高于苦瓜乙醇提取物发酵上清;源自苦瓜乙醇提取物(15 mg/mL)的发酵上清对Caco-2单层细胞跨膜电阻的增强作用要大于苦瓜全粉(15 mg/mL)。本研究探究了体外苦瓜全粉和苦瓜乙醇提取物不同的生理功效,为以后苦瓜制品的选择提供了初步证据。 黄鲁燕 何欣欣 薛正晟 徐佳 肖水明 王凌华关键词:短链脂肪酸 肠道菌群