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低温胁迫下西瓜同源二倍体和三倍体甲基化及基因表达的差异分析被引量：7: 2014年; 为了揭示西瓜二倍体及三倍体在低温胁迫下的耐冷性分子机制,以西瓜二倍体自交系‘83166’(‘京欣1号’品种的母本)及其同源三倍体为材料,利用MSAP及c DNA-AFLP技术研究低温处理前后基因表达的差异,并对差异带进行克隆、测序和比对。28对MSAP引物扩增得到2 356个位点,其中二倍体经低温处理后总甲基化率下降8.5%,三倍体下降10.4%。将13条差异带与西瓜基因组数据库比对,有7条带确定是西瓜基因组序列。26对c DNA-AFLP引物组合扩增出1 267条带,其中二倍体上调表达占48.2%,下调表达占51.8%;三倍体上调表达占51.3%,下调表达占48.7%。21条差异带在NCBI中找到了同源序列基因,包括假定蛋白(38.1%)、能量与代谢(38.1%)、信号转导(9.5%)、物质运输(9.5%)以及DNA修饰(4.8%),另有9条无同源序列。低温胁迫后,三倍体去甲基化率与上调表达量均大于二倍体,而且三倍体诱导出更多的差异基因参与了能量代谢调控、信号转导、物质运输等过程,说明在抵御低温胁迫中三倍体比二倍体有更强的耐冷性。; 杨炳艳霍秀爱刘云婷段会军; 关键词：西瓜 MSAP CDNA-AFLP 基因表达

基于SRAP的西瓜种质资源遗传多样性评价被引量：9: 2013年; 运用SRAP分子标记技术分析了80份西瓜种质资源的遗传多样性,28对不同的引物组合共扩增出308条谱带,其中多态性谱带68条。引物组合的多态性频率最低为9.1%,最高为45.5%,平均22.1%。基于全部材料的SRAP基因型数据评价品种间的遗传关系,80份西瓜种质的遗传相似系数变化范围在0.94～1.00之间,表明供试西瓜种质资源的遗传背景比较狭窄。利用NTSYS软件聚类分析,80份西瓜材料被划分为3个类群,类群间相似度较高。来源地不同的西瓜材料也被划分到一个类群,进一步说明供试材料遗传背景狭窄。西瓜育种要取得突破性进展,必须加强种质资源的引进与创新。; 李朋飞霍秀爱程永强代亮杨炳艳段会军; 关键词：西瓜 SRAP

甜瓜玉米黄质环氧化酶基因的电子克隆及生物信息学分析被引量：9: 2011年; 对甜瓜玉米黄质环氧化酶(Zeaxanthin epoxidase)进行电子克隆及功能预测。根据基因同源同功原理,利用基于GengBank的EST数据库和CAP3在线软件进行同源搜索和序列拼接,克隆甜瓜玉米黄质环氧化酶基因得到序列ZE,再利用生物信息学数据库及相关软件对其进行结构和功能的预测分析。结果显示:ZE的cDNA序列长2 323 bp,开放阅读框编码657个氨基酸残基,分子量为72.4 kDa,具有一个由56个氨基酸组成的FHA结构域(553～608)。该蛋白是一个亲水性稳定蛋白,参与叶黄素循环,类胡萝卜素的生物合成等代谢反应。; 李萌张爱华白雪飞王翠霞段会军; 关键词：电子克隆生物信息学

西瓜种质资源耐低温性评价被引量：14: 2010年; 为了明确西瓜种质资源耐低温性,为耐低温育种工作提供理论依据,对21份西瓜种质资源在人工模拟气候条件下进行冷害指数、电导率、可溶性蛋白含量、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)活性和丙二醛(MDA)含量的测定,并对基于被测的各项指标的结果进行了聚类分析。不同品种耐冷指数不同,其中野生西瓜材料耐冷指数最小,ZXG01315最大;供试品种中电导伤害率存在一定差异,野生西瓜的电导伤害率最小,超甜早霸母本电导伤害率最大;随低温胁迫叶绿素a/b值的变化分为降低、上升和平稳三种类型;可溶性蛋白和MDA含量随温度降低而增加;SOD和POD活性随温度降低而升高;聚类分析表明,西瓜材料分为三大类,其中类群I只包含野生西瓜;类群II、III各包含10份材料。类群与西瓜耐冷性存在一定的相关性。第一和第三类群可作为耐低温育种的育种材料。; 张爱华王静华李艳梅王翠霞李萌段会军; 关键词：西瓜种质资源耐低温

太空诱变西瓜后代突变体检测及相关片段克隆: 2013年; 为进一步研究太空环境对西瓜后代的影响,应用53对AFLP引物对200粒M2代单株进行分析,根据Gene Walking Kit的要求设计引物,利用TAIL-PCR技术对差异片段进行延伸,在GenBank上用BLASTn和BLASTx软件对其进行序列同源性比对。结果表明:引物E50/M60在135号和74号检测到差异片段,长度分别为253bp、81bp和98bp,对此进行序列比对,未检测到同源性大于40%的序列。对253bp进行延伸得到长度为1 379bp的片段,此片段与黄瓜光照诱导下的EST序列有93%的同源性。; 代亮苏玉环李朋飞霍秀爱杨炳艳段会军; 关键词：西瓜太空诱变 AFLP 克隆

冬瓜枯萎病菌核糖体rDNA ITS区的克隆与序列分析被引量：8: 2010年; 采用镰刀菌核糖体基因转录间隔区(ITS)通用引物,PCR扩增冬瓜枯萎病菌核糖体基因ITS区,并对产物进行克隆和序列分析;利用Mega 4.1软件对序列及GeneBank中以葫芦科为寄主的镰刀菌不同专化型ITS序列进行聚类。冬瓜枯萎病菌ITS全长1 063 bp,其中包括18S rDNA一部分序列,5.8S rDNA,ITS1和ITS2全部序列及28S rD-NA部分序列。聚类结果将15个菌株ITS序列划分为2个类群,类群I包括4个菌株,分别为2个西瓜枯萎病菌株和2个甜瓜枯萎病菌株;类群II包括11个菌株,其中冬瓜枯萎病菌株就在该类群中,其余为甜瓜枯萎病菌株5个、西瓜枯萎病菌株3个、黄瓜枯萎病菌株、丝瓜枯萎病菌株和葫芦枯萎病菌株各1个。; 王翠霞徐金茹习雨琳白雪菲温晓蕾段会军; 关键词：冬瓜 ITS

基于cDNA-AFLP及MSAP技术分析西瓜同源二倍体和四倍体低温胁迫差异表达被引量：3: 2015年; 为了研究西瓜二倍体及同源四倍体在低温胁迫下的分子机制,以西瓜京欣1号母本83166(二倍体)及其同源四倍体为材料,利用MSAP及cDNA-AFLP技术研究低温处理前后基因表达的差异,并对差异带进行克隆、测序和比对。22对MSAP引物扩增得到1564个位点,其中二倍体经低温处理后总甲基化率下降2.8%,四倍体下降6.4%。将12条差异带与西瓜基因组数据库比对,有7条带确定是西瓜基因组序列。26对cDNA-AFLP引物组合扩增出1267条带,其中二倍体上调表达占48.2%,下调表达占51.8%;四倍体上调表达占58.6%,下调表达占41.4%。23条差异带在NCBI中找到了同源序列基因,包括假定蛋白(39.13%)、能量与代谢(43.48%)、物质运输(8.70%)、转录相关(4.35%)以及逆境相关(4.35%),另有10条无同源序列。低温胁迫后,四倍体去甲基化率与上调表达量均高于二倍体,而且四倍体诱导出的差异基因参与了物质的能量代谢调控及逆境胁迫过程,说明四倍体较二倍体有更强的耐冷性。; 杨炳艳刘云婷胡文靖么大轩段会军; 关键词：西瓜 DNA甲基化 CDNA-AFLP

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河北省自然科学基金(C2007000547)