国家自然科学基金(30170986)
- 作品数：19 被引量：39H指数：5
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- 相关机构：中国医科大学沈阳医学院附属中心医院更多>>
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- 人巨细胞病毒UL138～142基因在临床低传代分离株中的多态性研究被引量：8
- 2004年
- 目的 研究人巨细胞病毒 (humancytomegalovirus ,HCMV)UL138～UL14 2基因在临床低传代分离株中的多态性及其与HCMV先天感染致病性之间的关系。方法 对经荧光定量PCR方法检测HCMV DNA为阳性的临床分离株进行UL138～UL14 2基因全序列PCR扩增 ,对扩增阳性的标本进行全序列的测序及结果分析。结果 HCMV临床分离株的UL138、UL14 2ORF(openreadingframe)高度保守 ;UL139ORF呈现高度多态性 ,可被明确划分为 3个基因型 ,且核苷酸及氨基酸的变异主要集中在序列的 5′端 ;所有临床分离株的UL14 0ORF在Toledo株第 174位核苷酸处插入 1个胞嘧啶核苷酸 ,其ORF较Toledo株增加了 2 31个核苷酸 ;所有临床分离株的UL14 1ORF在Toledo株第 2 2 7位核苷酸处缺失了 1个胸腺嘧啶核苷酸 ,故形成UL14 1a及UL14 1b 2个新的ORF。HCMV临床分离株的UL14 0蛋白较Toledo株新增了ScAMP磷酸化和酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点 ,其它基因编码蛋白的重要功能区域相对保守。结论 HCMV临床分离株UL139ORF的 5′端呈现高度多态性 ,而且被明确地分成 3个基因型 ,故其可能在HCMV先天感染的致病性差异方面起一定作用 ;尚未发现UL138～UL14
- 齐莹卢颖马艳萍阮强何蓉吉耀华刘庆陈淑荣
- 关键词：人巨细胞病毒基因多态性先天感染聚合酶链反应
- 人巨细胞病毒UL141片段在临床低传代分离株中的多态性研究
- 2005年
- 目的:研究人巨细胞病毒不同临床分离株UL141基因多态性,并分析这种多态性与人巨细胞病毒先天感染疾病之间的关系。方法:对荧光定量PCR方法检测HCMV-DNA阳性的临床低传代分离株进行UL141基因全序列PCR扩增,对扩增阳性的标本进行测序及分析。结果:19株临床低传代分离株在Toledo株UL141基因227位均缺失一个碱基T,因此产生两个新的ORF(UL141A和UL141B)。与Toledo株相应片段比较,UL141A预测蛋白质第75位氨基酸后序列和翻译后修饰位点产生大量变异。UL141B高度保守。结论:临床分离株的UL141片段产生两个新的ORF。
- 齐莹阮强马艳萍何蓉吉耀华孙峥嵘黄郁晶刘庆陈淑荣王继东
- 关键词：人巨细胞病毒多态性基因
- 先天性巨结肠患者人类巨细胞病毒UL144基因多态性的研究被引量：10
- 2006年
- 目的研究人类巨细胞病毒(human cytomegalovims,HCMV)UL144基因在先天性巨结肠(Hirschsorung's disease,HD)临床株中的多态性,探讨HCMV UL144基因多态性与致病性之间的关系。方法随机选取53个先天性巨结肠患儿痉挛段结肠手术标本及经荧光定量PCR方法检测HC- MV DNA为阳性的4个HD患儿的尿标本,对照组为无症状或仅有皮肤轻度黄疸的6个尿标本。应用巢式聚合酶链反应的方法,扩增HCMVUL144基因开放阅读框架(ORF),扩增阳性的临床株进行双向 DNA测序,最后通过DNAclub、Bioedit、DNAstar、GeneDoc等软件进行分析。结果23份HD痉挛段肠组织(46％)及4份尿标本HCMVUL144基因扩增阳性,并且完成测序。种系进化树分析结果显示25个 HD患儿的DNA序列分为3个基因型,G1A型64．O％,G2型24％,G3型12％。与对照组比较,经X^2检验,X^2=10．93,p为0．012;其中HD临床株G1A和G3型基因经Fisher检验,P为0．015,差异具有统计学意义。全结肠型、长段型及普通型HD分散分布于UL144各个基因型中。结论HD与HCMV感染有关,HCMV可能是HD的病因之一;在HD患儿中,HCMV感染以UL144．基因G1A型为主;HD的临床分型与HCMVUL144基因分型无关。
- 毛志芹黄英孙梅何蓉黄郁静吉耀华齐莹马艳平孙峥嵘高红阮强
- 关键词：人巨细胞病毒先天性巨结肠多态性
- 人类巨细胞病毒UL144基因在临床低传代分离株中的多态性研究被引量：15
- 2003年
- 目的 探讨人类巨细胞病毒 (humancytomegalovirus ,HCMV)UL144序列在临床患儿低传代分离株中的多态性及其与临床疾病的关系。方法 对 6 5株HCMV临床低传代分离株及 7例同年龄组HCMV DNA定量PCR方法检测阳性健康儿尿液进行HCMV UL144PCR扩增分析 ,对HCMV UL144扩增阳性标本进行HMA SSCP分析 ,并对其中 32个阳性标本进行HCMV UL144基因全序列测定及分析。结果 6 5株分离株中有 5 5株UL144全序列引物PCR扩增为阳性 ,7份QPCR检测HCMV DNA阳性健康儿尿液中 5份UL144全序列引物PCR扩增为阳性。 6 0份UL144扩增阳性标本HMA SSCP (heteroduplexmobilityassayandsingle strandedconformationpolymorphism)分析呈现 3种典型带形 ,32个测序标本序列呈现较高的多态性 ,差异多位于序列的前半部 ,种系发生图谱分析可大致分为 3组 ,二级结构预测表现为 6种类型 ,在重要的蛋白质功能区氨基酸序列高度保守。各病种间结果比较显示 ,巨结肠患儿分离株序列没有Ⅱ型 ,小头畸形患儿的序列分布以Ⅰ型为主 ,黄疸患儿以Ⅲ型为主。32个HCMV UL144序列已被GenBank收录。结论 HCMV UL144广泛存在于临床低传代分离株中 ,序列呈现高度多态性 ,不同疾病类型的HCMV UL144序列不同 ,提示UL144基因可能在HCMV致病上起一定的作用。
- 何蓉阮强吉耀华刘庆陈淑荣刘兰青吕绳敏
- 关键词：人类巨细胞病毒临床低传代分离株多态性儿童
- 人类巨细胞病毒UL145基因在临床低传代分离株中的多态性被引量：4
- 2003年
- 卢颖阮强何蓉齐莹吉耀华刘庆陈淑荣刘兰青
- 关键词：基因多态性人类巨细胞病毒临床低传代分离株
- 人巨细胞病毒UL149基因在临床低传代分离株中的多态性研究被引量：6
- 2004年
- 目的研究人巨细胞病毒(humancytomegalovirus,HCMV)UL149序列在临床低传代分离株中的多态性,探讨HCMV基因多态性与其感染引起不同临床症状之间的关系。方法对29株经荧光定量PCR方法(QPCR)检测HCMVDNA为阳性的临床低传代分离株的细胞培养上清液进行HCMVUL149全序列PCR扩增,并对PCR扩增产物进行序列测定及分析。结果29株临床低传代分离株有26株PCR扩增阳性,与HCMVToledo株进行序列比较分析,26株临床分离株UL149开放阅读框架(openreadingframe,ORF)之间存在着高度的多态性,种系进化树分析结果显示26个序列可分为3个型,黄疸患儿分布以G1型为主;小头畸形以G3型为主;巨结肠仅见于G1、G2型,G3型未见。部分临床分离株存在CKP位点的缺失及TKP位点增加。结论HCMVUL149基因在临床分离株中存在着高度的多态性。来自不同临床症状分离株的UL149基因及其编码蛋白具有一定的结构特点,并与基因型呈一定的相关性。
- 吉耀华阮强何蓉齐莹马艳萍孙峥嵘刘庆陈淑荣周艳丽
- 关键词：HCMV临床低传代分离株人巨细胞病毒临床分离株PCR扩增
- 人巨细胞病毒UL150基因在临床低传代分离株中的多态性研究
- 2008年
- 目的研究人巨细胞病毒（human cvtomegalovirus，HCMV）UL150序列在临床低传代分离株中的多态性，探讨HCMV基因多态性与其感染引起不同临床症状之间的关系。方法对29株经荧光定量PCR方法（Q-PER）检测HCMV-DNA为阳性的临床低传代分离株进行HCMV UL150全序列PER扩增，并对PER扩增产物进行序列测定及分析。结果在29株临床低传代分离株中25株PCR扩增阳性，其中18株完成了测序。18株临床分离株HCMV UL150开放阅读框架（open reading frame，ORF）与HCMV Toledo株相应序列进行比较分析，显示18株低传代临床分离株的HCMVUL150 ORF均为1920bp，编码蛋白含有640个氨基酸，临床株的ORF及编码的氨基酸序列的长度均与Merlin株一致。结论HCMVUL150基因在临床分离株中存在着高度的多态性，未发现其与HCMV感染不同临床症状间存在明显的关系。
- 吉耀华阮强何蓉齐莹马艳萍孙峥嵘刘庆王继东
- 关键词：巨细胞病毒基因
- 人巨细胞病毒UL136基因在临床低传代分离株中多态性分析被引量：5
- 2003年
- 目的 研究人巨细胞病毒 (humancytomegalovirus,HCMV)UL136基因在临床低传代分离株中的多态性 ,探讨其多态性与HCMV先天性感染不同致病性之间的关系。方法 对 4 8株经荧光定量PCR方法检测HCMVDNA为阳性的临床低传代分离株进行HCMVUL136全序列PCR扩增 ,对于扩增阳性的 12株PCR产物进行UL136基因全序列测定及结果分析。结果 4 8株临床低传代分离株UL136PCR扩增 ,12株阳性 ,阳性率 2 5 % ,以HCMVToledo株作为参考株 ,进行序列比较分析表明 ,12株临床分离株UL136开放阅读框架 (openreadingframe,ORF)长度均与Toledo株相同 ,为 72 3bp ,编码2 4 1个氨基酸的蛋白。DNA序列变异均为碱基替换 ,不同临床分离株UL136基因与Toledo株进行同源性比较 ,结果在核苷酸水平为 97.7%～ 99.3% ,氨基酸水平为 96 .6 %～ 99.1%。UL136编码蛋白的氨基酸变异率为 0 .83%～ 3.3%。二级结构预测分为两种构象。大多数HCMVUL136蛋白翻译后修饰位点在所有分离株中均高度保守 ,仅几个位点在一些分离株中存在缺失或新增。Toledo株及 12株临床分离株核苷酸及氨基酸序列系统进化树分析表明 :4 5J最接近Toledo株。结论 12株临床低传代分离株HCMVUL136基因DNA及其编码产物的氨基酸序列比较保守 ,但仍存在一定多态性。未发现不同临床?
- 阮强卢颖何蓉吉耀华齐莹刘庆陈淑荣马艳萍
- 关键词：人巨细胞病毒多态性先天性感染
- 人巨细胞病毒UL138基因在临床低传代分离株中的多态性研究被引量：4
- 2004年
- 目的 :研究人巨细胞病毒 (HCMV)UL1 38基因在临床低传代分离株中的多态性及其与HCMV先天感染不同致病性之间的关系。方法 :对 30株经荧光定量PCR方法检测HCMV DNA为阳性的临床低传代分离株进行HCMV UL1 38全序列PCR扩增 ,对 1 6株进行HCMV UL1 38基因全序列测序及结果分析。结果 :30株临床分离株中有 2 0株UL1 38基因PCR扩增阳性。 1 6株临床分离株HCMV UL1 38开放阅读框架及编码蛋白的重要功能基团均高度保守。核苷酸序列进化树的分析结果表明 :除 2 0M外 ,先天性巨结肠株只存在于 2a型 ,而小头畸形株仅存在于 2b型。结论 :HCMVUL1 38基因高度保守 ,但存在一定的多态性。
- 马艳萍阮强齐莹何蓉卢颖吉耀华刘庆陈淑荣
- 关键词：人巨细胞病毒多态性
- 人巨细胞病毒UL142基因在临床低传代分离株中的多态性被引量：1
- 2006年
- 目的 研究人巨细胞病毒（HCMV）UL142基因在低传代分离株中的多态性。探讨其多态性与HCMV先天性感染不同致病性之间的关系。方法 27株经荧光定量PCR方法检测HCMV DNA阳性的低传代分离株进行UL142全序列PCR扩增，阳性13株PCR产物进行UL142基因测序及结果分析。结果27株分离株UL142PCR扩增，13株阳性，阳性率48．2％，以Toledo株为参考株序列比较表明，13株UL142可读框长度均与Toledo株相同，为921bp，编码307个氨基酸的蛋白。DNA序列变异均为核苷酸替换，不同临床分离株UL142基因与Toledo株进行同源性比较，结果在核苷酸水平为94．4％-95．9％，氨基酸水平为89．9％-99．6％。二级结构预测分为三种构象。大多数HCMV UL142蛋白重要功能基团位点在所有分离株中均高度保守，仅四个位点在一些分离株中存在缺失或新增。系统进化树分析：除Toledo株外，13株核苷酸及氨基酸序列可分为3个基因组。结论13株临床低传代分离株HCMV UL142基因DNA及其编码产物的氨基酸序列比较保守，但仍存在一定多态性。未发现不同临床分离株UL142基因多态性与HCMV先天性感染不同疾病表现的关系。
- 卢颖阮强何蓉齐莹马艳萍吉耀华刘庆陈淑荣
- 关键词：巨细胞病毒多态现象遗传学
