国际科技合作与交流专项项目(12430702000)
- 作品数：19 被引量：17H指数：2
- 相关作者：李代禧刘宝林刘立潘琦余华星更多>>
- 相关机构：上海理工大学上海交通大学海南灵康制药有限公司更多>>
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- 相关领域：理学自动化与计算机技术化学工程医药卫生更多>>
- 尿素(520)晶面可控结晶的分子动力学模拟被引量：1
- 2019年
- 由于尿素结晶呈白色针状,晶貌单一,且传统结晶工艺不可控,严重影响药物的一致性评价结果。采用分子动力学模拟方法,从分子水平上研究不同种类的添加剂对尿素晶体生长的调控作用,揭示添加剂对药物晶体生长的调控机制。结果表明:(1)六种添加剂(海藻糖、蔗糖、葡萄糖、山梨醇、赖氨酸、精氨酸)在101.325kPa、290 K下相较于无添加剂时都能不同程度地抑制(520)晶面的生长;(2)添加剂对尿素晶面(520)的吸附能越负,其抑制晶面生长效果越好,其中海藻糖抑制(520)晶面生长效果最好;(3)添加剂分子携带基团的种类与数目决定与晶层的相互作用的强弱,特别是海藻糖、蔗糖双糖类分子含有8个羟基,与晶层上的尿素分子氢键相互作用强,与溶液层中的溶质形成竞争性吸附,能更好抑制(520)晶面生长。
- 蔡惊涛李代禧刘宝林栾翰森郭柏松魏冬青王浩
- 关键词：分子模拟添加剂
- 含巯基小分子药物抗氧化活性及机理研究
- 2015年
- 本文利用量子化学方法,分别对R型硫普罗宁,S型硫普罗宁,青霉胺,N-乙酰半胱氨酸和半胱氨酸,这5种含巯基小分子药物,在极性溶剂(水)和非极性溶剂(四氯化碳)下的抗氧化活性进行比较研究。在B3LYP/6-311++G(d,p)基组下,得到5种化合物的优化结构、解离焓(BDE)、质子解离焓(PDE)、键长、前线轨道能级。通过计算,发现虽然巯基的抗氧化性会随着溶剂极性的变化有一定的改变,但无论是极性还是非极性溶剂下,含巯基小分子药物消除自由基的反应机理仍主要倾向于S-H键断裂的自由基反应,5种含巯基小分子药物的抗氧化活性强弱顺序依次为:R型硫普罗宁>S型硫普罗宁>D-青霉胺>半胱氨酸>N-乙酰半胱氨酸。通过S-H键键长分析,发现S-H键键长的结果与解离焓结果具有较高一致性,说明S-H键键长可用于含巯基药物的抗氧化活性研究。
- 刘立李代禧潘琦余华星柴培陈正隆刘宝林
- 关键词：巯基密度泛函理论抗氧化活性
- As^(3+)与DNA4种碱基相互作用的理论研究被引量：1
- 2015年
- 砷在进入生物体后,可通过对基因损伤和基因表达等多方面的影响而发挥其毒性。本文运用量子化学计算,研究了As3+与DNA4种碱基的配位作用。从理论上确立了As3+与4种碱基的配合特征和各种配合物的相对稳定性以及As3+对4种碱基配合的选择性。当As3+与碱基结合时,最多能与3个碱基配体形成稳定构型,我们共得到17个稳定的三配体配合物。其中,As3+与O和N所形成配位键As-O和As-N的键长范围分别为(1.76~1.85)?和(1.88~2.01)?。As3+与4种不同碱基作用时,倾向与鸟嘌呤发生配位反应,且易于结合位点羰基O处发生反应。
- 柴培李代禧潘琦徐斐余华星刘立袁敏
- 关键词：砷中毒分子识别鸟嘌呤
- 胰岛素活性结构在水合离子液体中的稳定性被引量：1
- 2017年
- 离子液体以其独特的、可修饰的分子结构以及优良的物理化学性质被应用于蛋白质的稳定性研究。采用分子动力学模拟方法及微量热法,研究热敏性蛋白药物胰岛素在不同水质量分数下水合离子液体中活性结构的稳定性,并深入分析离子液体与胰岛素之间的相互作用及水分子与蛋白质稳定性之间的关系。研究结果表明,当水质量分数低于25.00%时,胰岛蛋白的热变性温度能保持在68℃以上。且通过模拟分析得出,含水量25.00%的水合离子液体体系中,大量阴、阳离子在胰岛蛋白表面聚集,并通过较强的静电相互作用吸附在其表面,从而对蛋白质的活性结构展现出良好的稳定效果。结合宏观实验研究及微观动力学计算阐释了不同水含量的离子液体稳定蛋白质的作用机理,并为离子液体对蛋白质的稳定作用研究提供了一种新的分析方法。
- 潘晓莉李代禧魏冬青
- 关键词：离子液体胰岛素蛋白质稳定性分子模拟微量热法
- Bukn还原型硫辛酸抗氧化活性的理论研究
- 2015年
- 硫辛酸是一种强抗氧化剂,本文运用量子化学计算,模拟了还原型硫辛酸即二氢硫辛酸(DHLA)和谷胱甘肽(GSH)在真空、水和四氯化碳3种溶剂环境中发生氧化反应的过程,来研究它们在这3种溶剂条件下的抗氧化活性。以GSH作对比,分析得出DHLA上的巯基抗氧化活性较强,且其作用机理为2个S-H键同时发生断裂。此外,通过对比分析真空和溶剂环境中的键解离焓、质子解离焓和HOMO、LUMO能级差值,发现溶剂环境极性越大,越容易发生电子转移反应:极性越小,越易发生自由基反应。
- 柴培李代禧陈雯霞刘立潘琦余华星王丹丹
- 关键词：抗氧化谷胱甘肽巯基
- 氨基酸对胰岛素单体活性结构的干燥保护作用研究
- 2014年
- 热敏性蛋白药物日益在疾病的预防、诊断和治疗方面表现出重要的作用。然而,热敏药物的不稳定性给它们的推广和应用带来巨大难题。本文拟以氨基酸为干燥活性保护剂研究其对热敏性胰岛蛋白活性结构的保护作用,利用Gromacs软件和Gromos96(53a6)简化分子力场,通过REMD分子模拟方法详细研究了氨基酸对胰岛蛋白药物的干燥活性保护效果。研究结果表明,相对于没有保护的干燥胰岛蛋白样品,氨基酸的保护有效防止了胰岛蛋白在干燥过程中的亲疏水表面翻转。添加氨基酸保护剂后,胰岛蛋白不仅三维整体结构得到了很好的保持,而且二级结构改变也很小。由此可见,氨基酸是一种很好的干燥活性保护剂。
- 李代禧翟振郭柏松刘宝林张燕余华星刘立杨春生
- 关键词：氨基酸人胰岛素分子模拟
- 加巴喷丁与阳离子相互作用提高其稳定性的研究
- 2018年
- 目的为了减少或抑制副反应的发生,研究在真空以及乙醇溶剂中添加不同离子前后加巴喷丁药物分子脱水缩合反应的分子机制及反应势垒。方法采用密度泛函理论(DFT)的B3LYP方法,在6-311+G (d,p)基组水平上,对添加不同离子前后的药物分子结构进行优化,计算其结构参数以及热力学参数。结果得到加入不同阳离子的反应势垒均明显高于未加入离子前的反应势垒,其中添加锌离子(Zn2+)抑制效果最好。结论证明加入不同阳离子可以有效抑制加巴喷丁缩合生成3,3-亚戊基丁内酰胺的副反应。其作用规律是通过静电作用以及改变活性基团的电子分布,提高加巴喷丁分子内缩合的反应势垒,从而抑制其副反应的发生。
- 杨理想李代禧刘宝林魏冬青郭柏松栾翰森奚泉王浩
- 关键词：密度泛函理论加巴喷丁反应势垒稳定化
- 双糖保护剂对胰岛素活性结构稳定性的影响
- 2016年
- 采用微量热分析法并结合分子动力学模拟,研究了不同双糖保护剂对胰岛素的保护效果.结果表明,通过区域选择性吸附,双糖保护剂可以在胰岛素表面产生保护作用,提高胰岛素的热稳定性.在4种双糖保护剂中,吸附作用越强的保护剂对胰岛素热稳定性的提升效果越好.随着保护剂质量分数的增加,胰岛素的热稳定性呈先增强后稳定的趋势.进一步分析了保护剂与水分子之间的相互作用,得出双糖保护剂与胰岛蛋白之间的直接相互作用可能是提高其热稳定性的主要原因.
- 孙旭李代禧郭柏松
- 关键词：胰岛素热稳定性分子模拟微量热
- 离子液体中胰岛素结构稳定性的分子动力学模拟被引量：1
- 2016年
- 离子液体作为一种新型绿色溶剂,由于其独特的物理化学性质,被广泛应用于蛋白质的稳定性研究。选用热敏性蛋白药物胰岛素作为研究对象,采用分子动力学模拟方法,从分子层面上研究不同种类的离子液体对胰岛素结构的稳定效果。结果表明,与纯水体系相比,在常温下离子液体能够有效地稳定胰岛素的分子结构,且体系中阴离子的氢键碱性越弱,阳离子的烷基链越短,对胰岛素分子结构的稳定作用越强。并深入分析不同烷基链长度的二氰胺类离子液体与胰岛素之间的相互作用,发现相较于长烷基链离子液体,短烷基链离子液体与胰岛素之间的相互作用更强,揭示了后者能更好地维持和稳定胰岛蛋白的分子结构。
- 潘晓莉李代禧魏冬青
- 关键词：离子液体胰岛素蛋白质稳定性相互作用能分子模拟
- LEA蛋白特征片段及海藻糖对热敏性蛋白药物胰岛素冻干的协同保护被引量：1
- 2015年
- 热敏性蛋白药物胰岛素的热稳定性较差,极易受制备方式和保存条件等影响而失活。故本研究分别利用高效液相色谱(HPLC)测定冻干样品中胰岛素的效价和差示扫描量热仪(DSC)测定冻干样品的玻璃化转变温度等重要参数,来研究胚胎发育晚期富集蛋白特征片段(LEA-motif,LEAM)和海藻糖冻干保护剂对胰岛素冻干保护效果的影响。冻干实验表明,两种保护剂均对胰岛素的活性具有保护效果,且LEAM的活性保护效果优于海藻糖。在效价和热稳定性方面,LEAM保护的胰岛素冻干品均高于海藻糖保护的胰岛素冻干样品。更为重要的是,两种保护剂协同保护时,少量海藻糖对于LEAM的保护特性具有增效作用。在冻干过程中,可有效提升药物玻璃态的稳定性,防止热致变性失活。由此可见,这种LEAM和海藻糖保护剂复合保护方法有望也可以应用在热敏性蛋白药物冻干粉针制备过程以保护药物活性。
- 刘立李代禧郭柏松潘琦余华星柴培刘宝林杨春生
- 关键词：胰岛素海藻糖冷冻干燥
