江苏省自然科学基金(BK2008036)
- 作品数：4 被引量：19H指数：2
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- 两个棉纤维发育相关基因的克隆与特征分析(英文)
- 2010年
- 棉纤维发育突变体是克隆棉纤维发育关键基因和阐明其发育分子机理的优异资源。陆地棉李氏超短纤维突变体(Li1li1)是显性单基因突变体,表现为显性纯合体(Li1Li1)致死,显性杂合时(Li1li1)表型为茎秆扭曲、叶片卷曲和纤维短至6mm,而隐性纯合体(li1li1)则表现为株型和纤维发育都正常。本文对开花后10d的李氏纤维发育正常材料(li1li1)和超短纤维突变体(Li1li1)胚珠纤维混合体进行mRNA差异显示反转录PCR(DDRT-PCR)分析,获得2条在李氏纤维发育正常材料中上调表达的差异片段。测序及DNA序列的生物信息学分析表明该差异片段分别与编码谷氨酸脱羧酶和质子焦磷酸酶的基因有较高同源性。通过电子拼接,5′RACE和全长cDNA序列验证,克隆了棉花的谷氨酸脱羧酶(GhGAD)和质子焦磷酸酶(GhVP1)基因全长cDNA,进一步对其功能和染色体定位进行了初步分析。转录水平分析表明,这两个基因在棉花根、茎、叶和纤维中组成性表达,在棉纤维中优势表达。利用本实验室陆地棉遗传标准系TM-1和海岛棉海7124培育的含140个单株的BC1作图群体,将GhGAD和GhVP1分别定位在第12条染色体和第8条染色体。
- 王磊朱一超蔡彩萍张天真郭旺珍
- 关键词：棉花纤维突变体DDRT-PCR谷氨酸脱羧酶
- 利用海岛棉染色体片段导入系定位衣分和籽指QTL被引量：17
- 2010年
- 以染色体片段导入系IL-15-5和IL-15-5-1构建的F2和F2:3分离群体,利用SSR标记对数量性状衣分和籽指QTL进行了定位。应用复合区间作图法分析两个组合的774个F2单株和F2:3家系衣分和籽指,检测到2个衣分的QTL,1个籽指的QTL。衣分QTLqLP-15-1在两世代中都被检测到,位于相同的分子标记置信区间JESPR152～NAU3040,置信的遗传距离分别为5.40cM和3.20cM;qLP-15-2只在F2:3中被检测到,位于分子标记NAU5302～NAU2901之间,置信的遗传距离为0.08cM。籽指QTLqSI-15-1在F2和F2:3中都被检测到,分别位于分子标记NAU2814～NAU3040和JESPR152～NAU3040,置信的遗传距离分别为6.70cM和5.70cM。利用染色体片段导入系能准确地定位产量组分的QTL,为棉花产量的分子设计育种奠定基础。
- 朱亚娟王鹏郭旺珍张天真
- 关键词：棉花衣分QTL
- 海岛棉EST-SSRs分布特征及新标记的开发与利用被引量：2
- 2010年
- SSRs标记已成为目前应用最为广泛的一种分子标记.相较之其他棉种,海岛棉的ESTs及SSRs标记资源均相当匮乏.本研究利用本实验室2个纤维cDNA文库随机测序获得的海岛棉ESTs序列,进行海岛棉EST-SSRs分布特征分析及新SSRs标记开发与应用研究.通过对9697条非冗余ESTs序列分析,共发现SSRs位点638个,分布于595条ESTs中,EST-SSRs序列的频率是6.13%,平均相隔10.4kb出现一个SSR.在2～6bp的重复基元中,三核苷酸重复基元的SSRs出现频率最高(26.6%),其次是六核苷酸重复(26.0%)和五核苷酸重复(25.9%).在所有重复基元类型中所占比例最大的是(AAG)n.利用Primer3及virtualPCR程序开发SSRs引物,并去除来源于海岛棉自身部分同源序列以及与CMD释放的不同棉种冗余SSRs引物后,获得380对棉花新SSRs引物.进一步对本实验室四倍体作图亲本陆地棉TM-1和海岛棉海7124进行多态性检测,其多态率为25.8%.利用BC1作图群体,将来源于82对引物的95个多态位点定位在我室构建的海陆遗传图谱上,其中42个定位在At亚组,53个定位在Dt亚组.研究结果为进一步饱和棉花遗传图谱以及开展基于图谱的比较基因组研究奠定了基础.
- 吕远大蔡彩平王磊林绍艳赵亮田亮亮吕俊宏张天真郭旺珍
- 关键词：海岛棉EST-SSRS多态性
- 陆地棉Li_1纯合显性不致死重组体的遗传分析
- 2010年
- 极短纤维突变体Li1自国外引入本实验室后,出现了纯合致死现象。而在杂交组合(Li1×XZ142 FLM)的后代中意外发现了一些Li1基因纯合的突变体株系,其自交后代均为极短纤维。这种Li1基因显性纯合不致死突变体被命名为Li-R重组体。本实验利用Li-R重组体分别与TM-1、海7124及突变体Li1新组配了3个F2群体,对Li-R重组体进行遗传分析。组合Li-R×XZ142 FLM、Li-R×TM-1、Li-R×海7124及Li-R×Li1的F2后代的分离结果均表明,Li-R重组体的纯合显性不致死表型是由2对基因控制的,一个是显性基因Li1,另一个是来自XZ142 FLM的隐性基因lia。其中的lia基因是本实验室新提出的一个基因。因而Li-R的基因型就是lialiaLi1Li1;并由此推断,Li1纯合致死突变体的基因型是LiaLiaLi1Li1,XZ142 FLM的基因型为lialiali1li1,1929年发现的Li1显性杂合突变体的基因型为LiaLiaLi1li1。利用(Li-R×TM-1)F2:3进一步分析Li-R中的新基因lia的等位性,发现lia与控制纤维起始发育的基因li3、n2均不等位。新基因lia的提出,进一步丰富了纤维发育基因资源。
- 刘逢举梁文化张天真
