海南省自然科学基金(80412)
- 作品数:4 被引量:43H指数:2
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- 相关机构:海南大学中国热带农业科学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金海南省自然科学基金中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 一个推测的马氏珠母贝肿瘤抑制子QM的cDNA分析被引量:2
- 2007年
- 从马氏珠母贝(P.martensii)足的SMART cDNA文库中得到了一个与肿瘤抑制子QM基因同源的克隆.测序获得了757bp的全长cDNA序列,推测的开放阅读框位于23-673bp,编码217个氨基酸,由20种氨基酸组成,最少的为色氨酸,仅占1.4%,最多的为精氨酸,有24个,占11.1%;同GenBank数据库中查找到的马氏珠母贝(P.fucata)QM基因仅在末尾有4个氨基酸存在差异.P.fucata缺少P.martensii在开放阅读框的第637处对应的碱基C,导致P.fucata的QM蛋白在3′端多了13个氨基酸和缺乏多聚腺苷酸加尾信号AATAAA.因而,已报道的P.fucata QM基因很可能由于测序等原因导致在开放阅读框第637处缺失了碱基C.
- 石耀华顾志峰王嫣侯战辉王爱民
- 关键词:马氏珠母贝
- 马氏珠母贝EST微卫星的筛选被引量:39
- 2008年
- 构建了马氏珠母贝的血液、足、鳃、胃、肝、心脏、外套膜、珍珠囊和感染多毛虫马氏珠母贝的血液(血感)等9个组织的cDNA文库,测序获得了6979个EST序列,从中查找到了268个重复序列,隶属于243个EST,含微卫星的EST数占EST总数的3.48%。珍珠囊cDNA文库含微卫星的序列所占比例最高,为6.16%,血感的最低,为1.65%。双碱基重复序列130个,占48.5%,(AT/AT)n类型最常见;三碱基类型的83个,占约31%,其中(AAT/ATT)n和(AAG/CTT)n较多;四碱基重复的有30个,占11.2%,(AAAT/ATTT)n占了该类型的约50%。一共能够设计151对微卫星引物,有130对可以扩增,占合成引物总数的86.09%,其中,多态性引物45对。多态性EST-SSR的筛选将为马氏珠母贝的分子遗传学研究、种质鉴定和野生资源保护等提供可靠的工具。
- 石耀华洪葵郭希明王嫣侯占辉顾志峰王爱民
- 关键词:马氏珠母贝分子遗传学
- 杂色鲍野生群体与养殖群体自交和杂交子一代的RAPD分析被引量:2
- 2007年
- 杂色鲍野生群体和养殖群体分别自交和杂交产生野生鲍自繁F1代(WW)、养殖鲍自繁子代(CC)、正交子一代(W♀×C♂,简称WC)和反交子一代(C♀×W♂,简称CW)4个群体,采用RAPD分析4个群体遗传特性。就多态位点比例、Nei基因多样性值和Shannon信息指数而言,WW群体比CC群体高;杂交群体WC的值分别为88.76%、0.3246和0.4811,比其余群体都要高,与群体WW最接近;另一杂交子代群体CW除多态位点比例比群体CC高外,其余参数均为最低。群体间的遗传距离分析表明,WW与各群体的遗传距离都较大,其中与CC群体的遗传距离最大,为0.0849,与两个杂交群体间的遗传距离分别为0.0772(CW)和0.0671(WC);CC群体与两个杂交群体间的遗传距离都较小,分别为0.0610(与CW)和0.0597(与WC);杂交子代间的遗传距离为0.0600;杂交群体WC与WW的遗传距离大于与CC的遗传距离,CW与WW的遗传距离也大于与CC间的遗传距离,两个杂交群体与亲本的遗传距离不对等,偏向养殖亲本。
- 石耀华王嫣曲艳波叶翚顾志峰王爱民
- 关键词:杂色鲍自交子一代RAPD
- 马氏珠母贝核糖体蛋白S13基因的克隆和序列分析被引量:1
- 2007年
- 构建马氏珠母贝腹足SMART cDNA质粒文库,测序和在GenBank中进行同源性查找,得到了核糖体40s亚基S13基因的全长cDNA序列。马氏珠母贝S13的cDNA全长554bp,推测的开放阅读框位于27-479,编码151个氨基酸,其中亮氨酸16个,所占比例为10.6%。马氏珠母贝S13同鲶鱼以及真菌纲的球毛壳的同源氨基酸序列相似性分别为90.05%和72.85%,很保守,可以用于种以上生物的进化关系研究。聚类分析显示,马氏珠母贝与脊椎动物和昆虫的亲缘关系较近,同线虫、水稻、啤酒酵母和球毛壳等动植物、真菌等相距较远。
- 石耀华王嫣顾志峰侯战辉王爱民
- 关键词:马氏珠母贝克隆