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上海市科委技术标准专项(06DZ05029)
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姜婷
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使用16SrDNA序列分析鉴定副溶血性弧菌
2010年
目的 测试应用16SrDNA序列分析鉴定副溶血性弧菌的适用性。方法用16SrDNA基因的扩增引物,对从腹泻者,水产品和环境中分离获得的副溶血性弧菌(n=39)及临床分离的15种(n=181)常见菌的基因组DNA进行聚合酶链反应,产物经琼脂糖凝胶电泳纯化后直接测序。序列通过blastn,在GenBank中比对,确定细菌属种并与表型法结果进行比较。结果220株菌(220/220)扩增出870bp的目的片段,平均测序长度752bp。36/39株副溶血性弧菌鉴定结果与生化培养法相符,3株菌株分别鉴定为科氏葡萄球菌(Staph3,lococcuscohnii),表皮葡萄球菌(Staphylococcusepidermidis)和Oceanobacillus profundus。181株其它临床分离菌无误判为副溶血性弧菌,其中123株与生化培养法结果一致,58株有差异。结论本文报告的16SrDNA基因序列分析可用于准确鉴定副溶血性弧菌,并可与15种临床常见分离菌区分。
王宏萍
张继伦
吴文娟
姜婷
鲍依稀
周晓明
关键词:
副溶血性弧菌
临床菌株
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