国家重点基础研究发展计划(2010CB126006)
- 作品数：39 被引量：216H指数：8
- 相关作者：袁有禄石玉真商海红巩万奎龚举武更多>>
- 相关机构：中国农业科学院棉花研究所西北农林科技大学陕西师范大学更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学理学石油与天然气工程更多>>
- 利用基因芯片技术筛选棉花产量性状相关的基因被引量：4
- 2013年
- 根据皮棉产量数据的重复性测验及显著性分析,从SG747(Gossypium hirsutum L.)和Giza75(Gossypium Barbadense L.)的回交自交系群体中选取高产组和低产组品系各3个材料,取这2组材料和其父母本开花后10 d的纤维进行芯片分析。比较芯片数据,获得了1508个差异表达基因。对这些差异表达基因进行聚类分析,结果显示高产组品系和低产组品系分别聚类在一起,符合基于田间数据分组的预期结果。利用Blast2GO软件对1508个差异表达基因进行Blast-Mapping-Annotation-KEGG分析,结果表明参与细胞质膜发育、过氧化物酶活性、抗逆和营养物质运输等生物学过程的基因最多。进一步利用RT-PCR分析,得到一系列与纤维品质和产量等性状密切相关的基因。研究结果为棉花高产基因工程和分子育种提供了丰富的基因资源。
- 张利媛于霁雯吴嫚马建辉范术丽宋美珍庞朝友李兴丽张金发喻树迅
- 关键词：棉花基因芯片
- 棉花新材料A111基于cpDNA的种性初步鉴定被引量：2
- 2013年
- A111是从澳大利亚收集到的一份新的野生棉,属于澳洲棉、或奈尔逊氏棉乃至一个新的棉种,归属一直没定论。为鉴别A111与澳大利亚以及世界其它地区棉种的差别,以24个棉种(变种)为参照,分析了A111的cpDNA序列特点。结果表明,在15条cpDNA基本序列中,筛选出了8条序列适合于棉属植物系统发育和种性鉴别研究。这8条序列的变异率和识别率均较高,其中rps16识别率最高(100%)。基于8个序列组合的系统发育分析,能识别单个棉种。聚类结果显示,棉属分为两大分支,A111与奈尔逊氏棉(G3)处于澳洲野生棉分支中的姊妹分支。序列比对结果表明,A111的叶绿体序列存在特异的插入与缺失,明显区别于其他棉种。由此,初步鉴定A111是澳洲野生棉的一个新种,与奈尔逊氏棉的亲缘关系最近。
- 冯坤刘方蔡小彦黎绍惠周忠丽张先亮华金平王坤波
- 关键词：CPDNA棉属物种鉴定
- 多环境下陆地棉染色体片段代换系及F_1皮棉产量与纤维品质的表型分析被引量：5
- 2016年
- 以1套陆地棉染色体片段代换系为亲本材料,采用株系间随机成对杂交组配F1,在5个环境下鉴定片段代换系亲本及F1的皮棉产量与纤维品质性状表现。结果表明,与轮回亲本(中棉所36)相比,F1在铃重与皮棉产量性状上具有一定的对照优势,亲本与F1的纤维长度与比强度均表现出明显的对照优势,且环境间表现一致。F1铃重、衣分与皮棉产量在各个环境下的中亲优势均值全部为正,且相对较大。除个别环境外,纤维长度、马克隆值与比强度的中亲优势均值也全部为正,但数值相对较小。片段代换系及F1的遗传变异丰富,部分亲本与F1在多个环境下的综合表现优异,其皮棉产量与纤维品质得到同步提高,群体材料的遗传改良与杂种优势利用具有广阔前景。
- 黎波涛石玉真龚举武李俊文刘爱英王涛商海红巩万奎陈婷婷葛群张金凤王永波胡玉枢袁有禄
- 关键词：陆地棉染色体片段代换系皮棉产量纤维品质表型分析
- 人工合成ASGNA的原核表达和抗虫性初探
- <正>棉花作为主要的纺织原料,在国民经济中占有重要的地位,但易受虫害影响,导致棉花减产。近年来,随着Bt转基因抗虫棉的大量种植,棉铃虫的危害减小,而蚜虫逐渐成为棉花生产中的主要害虫之一,在我国各棉花产区均有蚜虫灾害的发生...
- 田莉莉常淑芬俞嘉宁
- 关键词：棉花抗虫育种转基因技术雪花莲凝集素
- 文献传递
- 利用染色体片段代换系定位陆地棉株高QTL被引量：9
- 2014年
- 以陆地棉中棉所36为轮回亲本和海岛棉海1为供体亲本,构建染色体片段代换系。为了能检测到稳定的株高QTL,将三个代换系群体(BC5F3,BC5F3:4和BC5F3:5)在5个环境中种植,2009年和2010年分别在河南安阳种植BC5F3单株、BC5F3:4株行,2011年分别在河南安阳、辽宁辽阳和新疆石河子种植BC5F3:4株系。结果表明,在不同群体环境中株高的超亲比例为53.43%～88.97%。从早期构建的总图距为5088.28 cM,含有2280个SSR标记位点,覆盖26条染色体的遗传连锁图谱中筛选标记,对408个单株进行的SSR鉴定,结果检测到16个株高QTL,分布在10条染色体上。单个QTL解释的表型变异为7.35%～13.17%。有7个QTL在2个以上环境被检测到。与标记MUSS563紧密连锁的qPH-15-19在一个环境中被检测到,在前人的研究中也有报道。这些结果为进一步精细定位QTL、基因克隆、分子辅助选择等研究奠定基础。
- 何蕊石玉真张金凤梁燕张保才李俊文王涛龚举武刘爱英商海红巩万奎白志川袁有禄
- 关键词：棉花染色体片段代换系株高QTL
- PPR蛋白影响植物生长发育的研究进展被引量：7
- 2013年
- 植物生长发育是一个极其复杂的生理生化过程,受内外因素共同作用。PPR蛋白是核基因编码的具有重复PPR基序的蛋白,分布广泛,在高等植物中数量巨大。PPR蛋白的靶标一般是线粒体和叶绿体中转录的RNA前体,多数可与MORF互作,参与线粒体和叶绿体基因的RNA编辑。PPR蛋白缺失的突变体植株多数呈现异常表型,影响植物的正常生长发育。本文就近年来发现的PPR蛋白结构、分布,与RNA编辑的关系,及其对植物生长发育的影响进行了综述。
- 陆萍俞嘉宁
- 关键词：RNA编辑生长发育高等植物
- 蔗糖合成酶（GhSUS）基因家族与棉花纤维生长关系初探
- 蔗糖合成酶（Sucrosesynthase）在植物中是参与糖代谢的关键酶之一,植物体中可以同源四聚体形式存在。该酶催化:sucrose+UDP→fructose+UDPG的可逆反应,以前的研究表明SUS的功能主要参与淀粉...
- 黄圣何鹏俞嘉宁
- 关键词：蔗糖合成酶纤维伸长
- 文献传递
- 棉花纤维发育早期RNA-Seq转录组分析被引量：9
- 2013年
- 为了揭示棉花纤维发育早期基因表达变化情况,本研究以纤维长度存在显著差异的两个陆海回交近交系NMGA-062(32.58 mm)和NMGA-105(27.06 mm)为材料,利用Illumina HiSeqTM 2000对0、3 DPA(Dayspost anthesis)的胚珠及10 DPA的纤维进行RNA-Seq测序。六个文库进行拼接,共得到长度大于200 bp的Unigene 98464个,总长度约为88.2 Mb。对10 DPA的纤维转录组数据进行差异表达分析,共筛选到1931个差异表达基因,1536个Unigene上调,395个Unigene下调。GO(Gene ontology)功能显著性富集和Pathway显著性富集分析发现,差异表达基因富集在脂质转移活性(Lipid transport activity)分子功能组和脂质代谢通路(Lipid metabolism pathway),由此推测脂类相关基因可能在纤维伸长发育过程中起重要作用。通过对棉纤维发育10 DPA基因转录水平差异比较分析,为深入开展纤维伸长相关功能基因的克隆和功能验证提供了丰富的资源,并为揭示棉花纤维伸长的机制打下了坚实的基础。
- 李锡花吴嫚于霁雯张金发范术丽宋美珍庞朝友喻树迅
- 关键词：RNA-SEQQRT-PCR
- 棉花GhMYB0基因的克隆、表达分析及功能鉴定被引量：8
- 2014年
- MYB类转录因子是植物转录因子最大的家族之一,参与控制植物腺毛细胞的模式和形态建成。本研究利用雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii)D5基因组数据库以AtMYB0(GL1,NM_113708)蛋白为参比序列获得同源基因GrMYB0,从徐州142中克隆了陆地棉的GhMYB0,其开放阅读框长度为843 bp,编码280个氨基酸。经过保守结构域分析和亚细胞定位确定GhMYB0为R2R3-MYB转录因子。qRT-PCR的结果表明,GhMYB0在徐州142开花当天开始高调表达,开花后20 d表达量达高峰;在所有的组织器官中,花中表达量最高,其次为胚珠。转基因功能分析结果表明,在野生型拟南芥(Columbia)中过表达GhMYB0,使其叶片表皮毛与野生型相比明显减少;该基因在拟南芥突变体gl-1中过表达,能恢复表皮毛缺失型突变体的表型,说明该基因可能对拟南芥表皮毛的形态建成发挥一定作用,本试验为研究R2R3-MYB转录因子在棉纤维起始和伸长过程中的调控作用提供有力证据。
- 王诺菡于霁雯吴嫚马启峰李兴丽裴文锋李海晶黄双领张金发喻树迅
- 关键词：棉花MYB转录因子植物表达载体构建
- 利用SSCP技术分析棉花纤维差异表达的基因被引量：2
- 2011年
- 单链构象多态性(Single strand conformation polymorphism,SSCP)技术是一种简便、灵敏的多态性检测方法,可以检测出在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中因构象差异而导致的单链DNA片段迁移率的不同。本研究根据棉花基因芯片筛选的纤维发育中差异表达基因设计了162对引物,利用SSCP技术在4个陆地棉品种、4个海岛棉品种中进行多态性检测。结果表明,在162对引物中,146对引物经PCR扩增后在1.5%的琼脂糖凝胶电泳中检测出现清晰、明亮的带。经过SSCP分析,54对引物在陆地棉之间产生多态性,共出现116个多态性位点;45对引物在海岛棉之间产生多态性,共出现111个多态性位点;79对引物在陆地棉和海岛棉之间产生多态性,共出现260个多态性位点;36对引物在陆地棉之间、海岛棉之间同时出现多态性。进一步聚类分析后表明,海岛棉和陆地棉分别聚在了一起。
- 谢晓兵于霁雯吴嫚翟红红范术丽宋美珍庞朝友李兴丽张金发喻树迅
- 关键词：陆地棉海岛棉多态性
