国家高技术研究发展计划(2007AA022402)
- 作品数:12 被引量:22H指数:3
- 相关作者:严家新吴杰徐葛林孟胜利杨晓明更多>>
- 相关机构:武汉生物制品研究所贵州省疾病预防控制中心丽水市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学生物学更多>>
- 中国流行的狂犬病病毒时空进化分析被引量:1
- 2011年
- 本研究对1931~2009年间分离于中国20个省区的167株狂犬病病毒的N基因序列进行进化分析,以探讨中国狂犬病病毒株的基因分型和分组情况、时间和空间的动态进化。结果显示:从中国分离的毒株都属于基因1型狂犬病病毒,可以分为2个进化分支共计8个组,分支Ⅰ包括1~4组,分支Ⅱ包括5~8组;选择压力分析表明中国狂犬病病毒处于较强的净化选择约束下,狂犬病病毒N基因中的核苷酸突变主要是同义突变;运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法估计中国狂犬病病毒N基因核苷酸的平均碱基替代率为4×10-4替代/位点/年,共同祖先出现的时间不超过2000年前;迁移分析表明中国狂犬病病毒株存在跨地域传播。
- 孟胜利徐葛林雷永良吴杰严家新杨晓明
- 关键词:狂犬病病毒N基因地理生物信息学
- 我国近期分离的6株狂犬病病毒的糖蛋白基因序列分析
- 2013年
- 目的分析我国近期分离的6株代表性狂犬病病毒(rabiesvirus,RV)的糖(G)蛋白基因序列,了解RV街毒株与疫苗株在核苷酸和氨基酸序列水平的差异。方法对6个RV街毒株G基因进行逆转录和PCR扩增,经纯化、克隆、测序后获得6条G基因全长序列,采用生物信息学软件对G基因序列进行分析。结果6个街毒株的G蛋白在核苷酸水平的同源性为97.7%-100%,在氨基酸水平的同源性为97.9%-100%;与CTN-181疫苗株的核苷酸序列同源性最高,为86.7%-87.2%,氨基酸序列同源性为92.7%~93.1%。结论6个RV街毒株的G蛋白在核苷酸及氨基酸水平上均有变异,但与CTN.181疫苗株关系最近,表明CTN-181疫苗株可能为我国境内流行的狂犬病提供良好的预防作用。
- 黄思佳解庭波吴杰王月季雅琦严家新徐葛林
- 关键词:狂犬病病毒糖蛋白类基因型DNA
- 狂犬病毒的分子流行病学及新型诊断试剂研究
- 2011年
- 狂犬病是中国危害严重的传染病之一。近年来中国狂犬病发病人数增加,包括部分狂犬病疫苗免疫失败,很有必要进一步弄清中国当前流行的狂犬病毒的分子进化趋势,确定优势流行毒株的遗传背景。与狂犬病防治相关的科研领域是我国有可能在较短时间内在世界上占据领先地位的领域之一。
- 关键词:分子流行病学狂犬病毒狂犬病疫苗免疫失败进化趋势流行毒株
- 中国狂犬病病毒遗传多样性分析被引量:4
- 2010年
- 目的分析中国狂犬病病毒(RV)的遗传多样性,为我国狂犬病的预防提供理论依据。方法采用RT-PCR技术扩增26株RVN基因,并进行测序,与GenBank登录的序列进行比对,构建进化树,分析RV的基因分型和分组情况以及时间和空间的动态进化。结果中国RV分为2个大的进化分支(8组),分支Ⅰ包括1~4组,分支Ⅱ包括5~8组,组内核苷酸同源性≥93.2%,氨基酸同源性≥94.3%;组间核苷酸差异性≥8.0%,氨基酸差异性≥1.7%;运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法,估计中国RVN基因核苷酸的平均碱基替代率为1.4089×10-4取代/位点·年,共同祖先出现在公元968年。结论中国狂犬病病毒株均属于基因1型狂犬病病毒,存在跨地域、跨宿主传播;我国分支Ⅰ狂犬病病毒株与泰国、越南、菲律宾、印度尼西亚、马来西亚等东南亚国家分离的狂犬病病毒株起源相同;分支Ⅱ的毒株在全球分布。
- 孟胜利徐葛林程满荣舒祥雷勇良朱风才周敦金王定明明贺田吴杰严家新杨晓明
- 关键词:狂犬病病毒N基因
- 5例狂犬咬伤者暴露后的处置效果观察被引量:2
- 2009年
- 2008年11月16-17日,浙江省淳安县-9月龄狼狗对潘店、鸠岭山两个自然村共7人进行了主动攻击,其中5人有较为明显的伤口暴露:Ⅲ度暴露2人,Ⅱ度暴露3人。该犬被杀死后,由淳安县疾病控制中心送武汉生物制品研究所检测,通过直接免疫荧光法和双抗体夹心ELISA法,初步确认狂犬病病毒阳性,同时取犬脑组织,提取病毒RNA,进行RT-PCR检测,并经1日龄昆明乳鼠分离病毒,均确认为狂犬病病毒阳性。
- 章国平钱宝峰孟胜利周剑军郑新雄吴杰徐葛林
- 关键词:狂犬咬伤免疫荧光法
- 新型狂犬病减毒活疫苗研究的重大突破被引量:4
- 2010年
- 最近狂犬病疫苗研究取得重大突破。新型狂犬病减毒活疫苗效力更高而且高度安全,甚至有可能用于狂犬病发病后的早期治疗。这是狂犬病疫苗诞生一百多年来的一个重要里程碑。此文对狂犬病疫苗研究取得的重大突破、决定狂犬病病毒致病性和免疫原性的相关因素及新型狂犬病减毒活疫苗的主要优点作一综述。
- 解庭波唐芳严家新
- 关键词:狂犬病减毒活疫苗免疫原性
- 安徽省阜阳市狂犬病街毒株G基因序列分析被引量:2
- 2009年
- 目的了解安徽省阜阳市流行的狂犬病毒株与人用、兽用狂犬病疫苗株在G基因核苷酸和氨基酸水平的差异,为有效控制我国狂犬病疫情提供初步科学依据。方法在安徽省阜阳市收集犬脑组织162份,用酶联免疫吸附试验(ELISA)和小鼠颅内接种试验(MIT)检测样品带毒情况,对阳性样品用RT-PCR扩增G基因并测序,以TOPALi和DNA Star软件对G基因序列进行分析。结果从安徽省阜阳市162份犬脑样品中检出阳性样品15份;这15株病毒与我国现在使用的各种疫苗株在G基因的核苷酸和氨基酸水平上均存在不同程度的变异,与我国人用疫苗株CTN同源性较高。结论15株狂犬病毒为基因Ⅰ型狂犬病毒,在核苷酸或氨基酸水平上,与疫苗株CTN之间的同源性要高于与其它疫苗株之间的同源性。
- 孟胜利刘红胡岱霖朱理业徐葛林吴杰杨晓明严家新
- 关键词:狂犬病毒G基因
- 1株驴源狂犬病毒的分离鉴定及N、G基因序列分析被引量:2
- 2012年
- 目的对武汉市汉南区新分离的1株驴源狂犬病毒(RABV)街毒株的N、G基因进行遗传学分析,比较其与近年来湖北省及周边地区分离的代表性街毒株以及人用和兽用狂犬病疫苗病毒株之间的差异。方法以直接免疫荧光法检测驴脑组织中的RABV,并将驴脑海马组织研磨后接种乳鼠,观察其发病情况,采用双抗体夹心ELISA法检测驴脑组织及发病乳鼠脑组织悬液中的RABV,然后提取发病乳鼠脑组织RNA,利用RT-PCR扩增RABV的N、G基因,测序后进行遗传学分析。结果在驴脑组织及发病乳鼠脑组织中检出RABV,该病毒株与近年来湖北省及周边地区分离的代表性街毒株以及国内外人用和兽用狂犬病疫苗病毒株相比,N、G基因核苷酸序列的同源性分别为85.7%-99.1%和82.2%-99.7%,推导的氨基酸序列同源性分别为95.6%。99.8%和87.8%~99.4%,与国内分离街毒株核苷酸和氨基酸的同源性高于疫苗株,且与国内疫苗株CTN-181的同源性要高于国外疫苗株。结论该病毒株鉴定为驴源RABV,与湖北省及周边地区分离的代表性街毒株及中国人用狂犬病疫苗株CTN-181处于同一个亚群,有较近的系统进化关系。
- 解庭波俞华吴杰黄思佳徐葛林严家新余滨周敦金
- 关键词:狂犬病毒
- 浙江新分离狂犬病病毒街毒株与国内外疫苗株G基因的比较分析被引量:2
- 2009年
- 目的对浙江新近分离的2株狂犬病病毒街毒株的G基因进行遗传学分析,并比较其与国内外使用的狂犬病疫苗株间的差异。方法以直接免疫荧光法和双抗体夹心ELISA法检测伤人犬脑组织,乳鼠接种分离病毒,RT-PCR扩增G基因片段,直接测序后进行遗传学分析。结果在2份伤人犬脑组织(编号LH和ZJCA1)中均检出狂犬病病毒,与其他浙江街毒株相比,G基因核苷酸和氨基酸序列同源性均为98.7%~99.2%。与当前国内外使用的多种疫苗株相比,与CTN疫苗株同源性最高,G基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为79.5%~86.1%和86.8%~94.1%。结论浙江新分离的2株狂犬病病毒街毒株属于基因1型,与当前使用的多种疫苗株相比,与CTN疫苗株属于同一分支,二者的亲缘关系最近。
- 孟胜利钱宝峰章国平周剑军吴杰严家新徐葛林
- 关键词:狂犬病病毒G基因分子进化
- 中国12株狂犬病街毒株G基因序列测定与分析被引量:8
- 2009年
- 目的了解中国狂犬病毒的流行情况以及街毒株与中国人用、兽用狂犬病疫苗株在G基因核苷酸和氨基酸水平的差异,为有效控制狂犬病疫情提供初步科学依据。方法对12株街毒株G基因进行了全基因测序,与其它36株中国狂犬病街毒株,以及中国的疫苗株和其它国家毒株的G基因序列进行了综合分析。结果序列分析表明来源于中国的50株狂犬病毒均为基因Ⅰ型狂犬病毒;其中具有代表性的6株病毒与我国现在使用的各种疫苗株在G基因的核苷酸和氨基酸水平上均存在不同程度的差异,与我国人用疫苗株CTN同源性较高;进化分析表明,我国主要流行狂犬病毒与泰国、印度尼西亚、马来西亚等东南亚狂犬病毒株处于同一分支。中国毒株之间G基因核苷酸同源性分别≥82.3%;氨基酸同源性分别≥92.1%;中国街毒株与疫苗株相比较核苷酸的同源性为79.3%~94.2%,氨基酸的同源性为87.8%~97.9%。结论我国的狂犬病毒为基因Ⅰ型狂犬病毒,可以明确分为6个进化群。无论在核苷酸还是氨基酸水平上,中国多数街毒株与疫苗株CTN之间的同源性要高于与其它疫苗株。
- 孟胜利徐葛林吴杰王定明严家新杨晓明
- 关键词:狂犬病毒G基因测序分析