国家自然科学基金(30300195)
- 作品数:11 被引量:16H指数:2
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- 相关机构:河南农业大学中国农业大学商丘学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金河南省教育厅自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 小麦TaMBD4基因的克隆、结构及表达的初步分析被引量:1
- 2008年
- 以拟南芥MBD基因的EST为基础,采用电子克隆并结合RT-PCR方法分离克隆了包含开放阅读框的小麦甲基结合域蛋白基因TaMBD4。序列分析显示,TaMBD4蛋白有典型的甲基结合域。组织表达特性分析表明,TaMBD4在干种子和胚乳中的表达量高于其它组织。TaMBD4的cDNA和基因组DNA比较分析显示,此基因包括1个内含子,进一步分析表明这个内含子为2个GGCAGT序列的串联重复,推测该内含子可能与TaMBD4基因的转录后调控相关。
- 孟凡荣刘昊英司志飞尹钧李永春
- 关键词:DNA甲基化小麦克隆
- 水稻甲基结合蛋白基因MBD701的克隆及原核表达被引量:2
- 2012年
- 甲基结合域蛋白MBD作为与甲基化位点特异结合的重要反式作用因子,在植物生长发育中发挥着重要的调控作用.为了探讨MBD基因的结构与功能,利用RT-PCR方法克隆了水稻中编码甲基结合蛋白基因MBD701,构建了MBD701的原核表达载体pGEX-MBD701,并在大肠杆菌BL21(DE3)工程菌株中实现了融合蛋白GST-MBD701的表达.结果表明,MBD701除了包含典型的甲基结合域(第138~212)外,还包含CW的锌指结构(第73~132);在37℃,1 mmol/L IPTG浓度条件下成功诱导表达了大小为65.87 kD的GST-MBD701融合蛋白,这为进一步开展MBD701的蛋白纯化和功能分析奠定了基础.
- 张艳霞贾海英司志飞刘昊英孟凡荣
- 关键词:水稻甲基结合蛋白基因克隆原核表达
- 植物甲基结合蛋白(MBD)被引量:2
- 2009年
- DNA甲基化是生物体内普遍存在的一种基因修饰,甲基结合蛋白(MBD)是与甲基化DNA结合的反式作用因子,在植物生长发育过程中起调控作用。本文介绍了植物DNA甲基化和MBD蛋白在植物生长发育调控中的研究进展,并对其研究前景作了展望。
- 张问李永春张艳霞凌娜孟凡荣
- 关键词:DNA甲基化植物
- 小麦甲基结合蛋白基因MBD3重组表达载体的构建和原核表达被引量:1
- 2008年
- DNA甲基化在基因表达调控过程中发挥重要作用,甲基结合蛋白(Methyl-Binding Domain Protein,MBD)是能特异识别甲基化位点的反式作用因子。开展植物MBD基因的功能研究对于探讨植物生长发育的表观遗传学调控机制具有重要意义。该研究构建了小麦甲基结合蛋白基因MBD3的原核表达载体pGEX-4T-MBD3,转化大肠杆菌BL21(DE3)工程菌株,在37℃,1mMIPTG浓度条件下,成功诱导表达了的GST-MBD3融合蛋白,大小为49.6kDа,这为进一步开展MBD3的蛋白纯化和功能分析奠定了基础。
- 孟凡荣司志飞刘昊英张问
- 关键词:原核表达
- 两个小麦甲基结合蛋白基因cDNA全长克隆及其在种子中的表达特性被引量:2
- 2009年
- 【目的】分析小麦甲基结合蛋白基因TaMBD1和TaMBD6的序列特征及其在种子形成和萌发过程中的表达模式,为探讨小麦种子形成及萌发过程中的表观遗传学调控机制积累资料。【方法】利用RACE技术进行cDNA全长克隆,采用生物信息学软件分析克隆基因的编码蛋白特性,并通过半定量RT-PCR分析克隆基因在小麦种子不同发育阶段及萌发过程中的表达模式。【结果】获得了小麦甲基结合蛋白基因TaMBD1和TaMBD6的cDNA全长,可分别编码193和187个氨基酸。氨基酸序列分析发现,TaMBD1和TaMBD6均包含有典型的甲基结合域,TaMBD1还包含1个CW型的锌指结构域。三维结构分析显示,TaMBD1和TaMBD6均可形成由β-折叠、α-螺旋及C-端扭曲共同构成的特定夹层结构。表达特性分析表明:TaMBD1在种子发育过程中一直保持有较高水平的稳定表达,而在萌发过程中呈现出有规律的表达动态,即胚中的表达量逐渐增强,胚乳中的表达量却逐渐减弱;TaMBD6在种子发育过程中呈现出先升高后降低的表达趋势,以开花后15d时表达量最高,但在种子萌发过程中却未检测到其表达。【结论】首次克隆了小麦甲基结合蛋白基因TaMBD1和TaMBD6的cDNA全长,这2个基因的编码蛋白均包含有与DNA互作的典型功能域;通过对这2个基因在种子发育及萌发过程中的表达特性分析表明,TaMBD1在小麦种子的发育及萌发过程中均发挥重要调控功能,而TaMBD6仅与种子发育过程中的基因表达调控有关;研究结果为进一步探讨小麦种子形成和萌发过程的基因表达调控机制提供了重要信息。
- 孟凡荣李永春凌娜王潇司志飞张艳霞尹钧
- 关键词:甲基结合蛋白基因克隆小麦种子
- 小麦TaMBD2原核表达载体的构建和诱导表达被引量:3
- 2008年
- 构建了小麦甲基结合域蛋白基因TaMBD2的原核表达载体pGEX-TaMBD2,并在大肠杆菌BL21(DE3)工程菌株中优化了融合蛋白GST-TaMBD2的诱导表达条件。结果表明,用0.3、0.5和1.0mmol·L-1的IPTG诱导后,融合蛋白GST-TaMBD2均能有效表达,以1.0mmol·L-1 IPTG诱导的效果最好;从诱导表达的时间来看,3种浓度IPTG诱导1h后融合蛋白均开始表达,且表达量随着诱导时间的延长而逐渐增加,但在诱导6h后的表达量增加幅度不大,因此确定诱导融合蛋白GST-TaMBD2表达的最佳IPTG浓度为1.0mmol·L-1,诱导时间为6h。
- 孟凡荣司志飞刘昊英张问李永春尹钧
- 关键词:小麦原核表达
- 小麦甲基转移酶基因TaDnMT2的克隆及特性分析被引量:1
- 2012年
- 依赖于DNA甲基化的基因表达调控在植物生长发育过程中发挥重要功能,而DNA甲基转移酶是调节DNA甲基化模式的功能蛋白之一。本研究采用RACE技术克隆了小麦甲基转移酶基因TaDnMT2的包含完整编码区的cDNA序列,并系统分析了该基因的结构特征及其在小麦生长发育过程中的表达特性。结果表明,TaDnMT2的cDNA序列为1321bp(GenBank登录号:JN642641),其中5′-和3′-UTR(非翻译区)分别为84和115bp、ORF(开放阅读框)1122bp;TaDnMT2编码的氨基酸序列包含2个S-腺苷甲硫氨酸结合域(I和X)、甲基转移酶活性位点(IV)、靶胞嘧啶结合位点(VI)、中和DNA骨架负电荷域(VIII)和靶位点识别区(IX)6个高度保守域,属于DNA甲基转移酶家族的DnMT2亚类;三维结构预测显示,TaDnMT2蛋白可以形成包括7个β-折叠和4个α-螺旋的特定空间结构。表达特性分析的结果表明,TaDnMT2基因在‘京841’小麦不同发育时期的叶中表达量均较高,且其在三叶龄期和五叶龄期的表达量受春化处理的影响;在种子发育过程中,该基因在授粉后5d的种子中表达量较高,随着种子发育进程的推进其表达水平呈逐渐下降趋势;在不同发育时期的根系中,TaDnMT2基因均具有较高水平的表达,且在分蘖期根系中的表达量最高。推断TaDnMT2基因可能在小麦生长发育过程中发挥重要功能。
- 凌娜刘浩贾海英闫延涛尹钧李永春孟凡荣
- 关键词:甲基转移酶基因克隆
- 植物DNA的甲基化及其生物学功能被引量:4
- 2007年
- DNA甲基化是生物体内普遍存在的一种基因修饰现象,在生物体内发挥着重要的生物学功能。大量研究表明,DNA甲基化不仅可以遗传,而且存在特定的动态变化模式。综述了植物DNA甲基化的特点、模式以及它们与植物生长、发育和基因表达调控的关系。
- 孟凡荣司志飞刘昊英
- 关键词:植物DNA甲基化生长发育
- TaMBD2基因cDNA全长克隆及其在小麦叶片和种子中的表达被引量:2
- 2010年
- 为探讨甲基结合蛋白(MBD)在小麦生长发育过程中的生物学功能,通过RACE技术克隆了小麦TaMBD2基因的cDNA全长,并分析了该基因在小麦叶片、种子发育及萌发过程中的表达特性。RACE克隆及序列分析表明,TaMBD2基因cDNA全长为1 511 bp,其中5 UTR 164 bp,3 UTR 405 bp,ORF 942 bp。对该基因编码氨基酸序列的分析发现,TaMBD2编码蛋白中包含有1个典型的甲基结合域和1个CW型锌指结构域;通过RT-PCR分析发现,TaMBD2基因在叶片中的表达随着小麦的生长发育而逐渐增强;在种子发育过程中,该基因在花后20和30 d时的表达量最高;在种子萌发过程的胚和胚乳中,该基因的表达水平变化不大。
- 孟凡荣李占英凌娜王潇司志飞尹钧李永春
- 关键词:小麦甲基结合蛋白基因克隆
- 酵母双杂交筛选小麦TaMBD2互作蛋白
- 2017年
- 为探讨小麦甲基结合域蛋白(TaMBD2)在植物生长发育过程中的调控功能,以TaMBD2基因的全长cDNA为模板,构建诱饵载体pGBKT7-TaMBD2,利用酵母双杂交系统从小麦cDNA文库中筛选TaMBD2互作蛋白。结果共筛选到91个菌斑显蓝色的克隆,对其进行菌液PCR检测并测序,然后在NCBI上进行BLAST比对分析,共获得8个可能与TaMBD2互作的蛋白,分别为二磷酸核苷激酶(NDPK)、ENTH结构域蛋白、SIAN蛋白、Agenet结构域蛋白、C2H2型锌指蛋白、磷酸激酶和2个假定蛋白,其中最有可能的TaMBD2互作蛋白为NDPK。这些候选蛋白主要参与细胞信号传导、抗逆、能量代谢和蛋白质运输等。其中,检测结果中参与植物抗逆胁迫的蛋白质为主要互作蛋白,所占比例为54.9%;参与蛋白质运输的互作蛋白所占比例为25.3%,其余互作蛋白所占比例较小。因此,推测TaMBD2可能主要参与植物对干旱、低温和高盐等非生物胁迫逆境的响应及调控。
- 凌娜杨艳敏侯江涛孟凡荣
- 关键词:小麦酵母双杂交