教育部科技基础资源数据平台建设项目(505015)
- 作品数：9 被引量：24H指数：3
- 相关作者：李生斌陈腾余兵陈峰桂宏胜更多>>
- 相关机构：西安交通大学西安医学院附属医院中华人民共和国司法部更多>>
- 发文基金：教育部科技基础资源数据平台建设项目陕西省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生历史地理政治法律更多>>
- 云南纳西族10个X-STR基因座遗传多态性研究被引量：3
- 2007年
- 为研究云南纳西族人群10个位于X染色体的短串联重复序列基因座及单倍型的遗传多态性，采用PCR扩增。变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结合银染显色分型技术，对98名云南纳西族无关男性个体x染色体的10个STR基因座进行基因分型。结果显示。98名无关男性个体中。DXS7423、DXS7424、DXS6799、DXS7133、DXS6804、DXS8378、HPRTB、DXS7130、DXS7132和DXS6789分别检出4、7、6、3、6、5、5、7、6和8个等位基因。等位基因频率分布在0．0102（DXS7132、DXS6789）～0．7347（DXS7133）之间．由DXS8378与DXS7130基因座组成的单倍型共检出20种，由DXS6789、DXS6799和DXS7424基因座组成的单倍型共检出56种。单倍型多样性分别为0．8553和0．9649，说明所选的10个X—STR位点有较高的多态性信息，在基因组多样性研究、法医学个体识别、亲权鉴定中具有重要应用价值。
- 陈腾辛娜朱俊艳余兵金天博李生斌
- 关键词：X染色体短串联重复序列遗传多态性单倍型
- 中国青海藏族、汉族mtDNA控制区遗传多态性被引量：2
- 2008年
- 目的研究中国青海藏族、汉族mtDNA控制区遗传多态性。方法收集69份青海藏族和青海汉族无关人群外周血样本,对其mtDNA控制区进行序列分析,计算多个多态性指标,结合其他民族mtDNA遗传资料,根据Nei法计算包括青海藏族和汉族群体在内的11个群体之间的Fst和Rst遗传距离,进行聚类分析,绘制系统发生树。结果在青海藏族和汉族群体mtDNA控制区中分别发现56和59个多态性位点。Rst遗传距离显示青海藏族人群与各人群之间遗传距离均较远(P<0.05);青海汉族人群与西安汉族、蒙古族、长沙汉族等人群之间距离较近(P>0.05)。结论我国青海藏族和汉族人群mtDNA具有相对独特的遗传特征,其遗传多态性和个体识别力较高,可用于民族起源、迁徙、法医学个体识别等领域研究。
- 穆豪放陈峰熊新张博阎春霞陈腾邓亚军
- 关键词：法医遗传学遗传多态性藏族汉族
- 湖南土家族群体X染色体10个STR位点的遗传多态性及法医学应用价值评估被引量：3
- 2008年
- 摘要:对198名湖南土家族健康无关个体抽取静脉血,提取DNA,经PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染进行等位基因分型;软件SPSS13.0计算各位点基因型频率和等位基因频率,进行Hardy-Weinberg平衡检验,并检验基因分布差异有无统计学意义;Fstat软件计算基因多态性及固定指数;Powerstats软件计算各种法医学应用指标。在湖南土家族群体中,共检出65个等位基因,频率分布在0.0048～0.6170之间;10个X-STR位点中DXS6789、DXS6799、HPRTB位点的多态性和分化程度较低;DXS7133、DXS7423位点的法医学应用价值较低;位点比较中,湖南土家族群体与德国、意大利群体的差异最明显。DXS6804、DXS7132、DXS7130、DXS8378、DXS6789、DXS6799、DXS7424、HPRTB等8个位点在湖南土家族群体的个体识别和女孩的亲权鉴定中有应用价值,对疾病相关研究有实际意义;差异性检验结果揭示高加索人种与蒙古人种间存在着较大的差异性。
- 韩卫杨丽桂宏胜余兵卫洁李生斌
- 关键词：土家族X染色体短串联重复序列遗传多态性
- 新疆地区7个少数民族遗传分化及基因流动特征被引量：4
- 2008年
- 目的基于9个CODIS STR位点分型数据,探寻新疆地区7个主要少数民族的遗传分化及基因流动特征。方法计算杂合度、Nei遗传分化系数、Nei遗传距离以及Wright F统计量,使用确切概率法对民族分化水平进行统计检验;通过Mega构建系统发生树,Arlequin进行分子方差分析;应用R矩阵模型分析基因流动形式。结果7个少数民族平均杂合度均大于0.7,遗传分化系数小于2%,群体分化检验显示多数位点都有显著性差异;系统发生树和分子方差分析表明7个民族分为三支;R矩阵分析结果显示维吾尔、柯尔克孜以及乌兹别克族具有较高的基因流动水平,而回族基因流动形式呈现一定隔离性。结论新疆7个少数民族属于独立民族,但分化程度一般;其进化关系上较近,存在广泛的基因交流。
- 桂宏胜余兵杨程博李生斌
- 关键词：遗传分化基因流动系统发生树R矩阵语系
- 中国甘肃裕固族X-STR遗传多态性及其应用研究被引量：5
- 2008年
- 为研究中国甘肃裕固族人群X染色体STR基因座的遗传多态性及其在群体遗传学中的应用,采用PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结合银染显带技术,检测120名(女55,男65)裕固族无关个体9个X-STR基因座(DXS7130、DXS7132、DXS6804、DXS7423、DXS7424、DXS6789、DXS6799、DXS8378和HPRTB)的等位基因频率及基因型分布,以及存在连锁的X-STR基因座的单体型多态性;同时,利用X-STR构建系统发生树和进行聚类分析,分析裕固族与我国其他民族的群体遗传关系。结果发现,DXS7130、DXS7132、DXS6804、DXS7423、DXS7424、DXS6789、DXS6799、DXS8378和HPRTB基因座分别检出8、6、6、5、6、7、6、4、6个等位基因和16、14、13、6、13、20、11、6、12种基因型,9个X-STR基因座女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。由DXS7130和DXS8378基因座组成的单体型共检出15种,由DXS6789、DXS6799、DXS7424和DXS6804基因座组成的单体型共检出55种,单体型多样性分别为0.8212和0.9947。群体遗传多态性指标显示上述9个X-STR基因座均具有较高多态性,在法医学个体识别、亲权鉴定及群体遗传学研究中有重要应用价值。对裕固族与我国其他民族群体遗传关系的研究结果显示,裕固族与蒙古族及同处西北的汉族、藏族关系较近,而与回族、维族关系较远,提示裕固族是一个在起源上与蒙古族、汉族以及藏族关系密切的民族群体。
- 陈艳炯陈峰辛娜张洪波郑海波余兵李生斌陈腾
- 关键词：X染色体短串联重复序列单体型遗传多态性聚类分析
- 中国内蒙古鄂伦春族线粒体DNA高变区Ⅰ和高变区Ⅱ遗传多态性被引量：1
- 2008年
- 收集50份鄂伦春族无关人群外周血样本,用ABIPRISM377测序仪对其mtDNAHVRⅠ和HVRⅡ进行测序,计算多态性位点数、单倍型数目、单倍型频率、平均核苷酸差异数目等多态性指标;结合已发表的其他民族mtDNA遗传资料,根据Nei法计算鄂伦春族与各群体之间的遗传距离,进行聚类分析,绘制系统发生树。鄂伦春族群体mtDNA两个高变区与CRS序列比对,分别发现52和24个多态性位点,分别界定了38和27种单倍型,单倍型多态性分别为0.964±0.018和0.929±0.019;平均核苷酸差异分别为7.379和2.408;用HVRⅠ序列多态性数据计算Fst和dA两种遗传距离,相关系数r为0.993(P<0.01);基于HVRⅠ序列的系统树显示鄂伦春族与中国台湾、南方汉族和中国香港人群遗传距离较近,与北方汉族、蒙古族及其国外人群遗传距离相对较远。我国鄂伦春族人群mtDNA具有相对独特的遗传特征,其遗传多态性和个体识别力较高,可用于民族起源、迁徙、法医学个体识别等领域研究。
- 阎春霞陈峰党永辉李涛郑海波陈腾李生斌
- 关键词：鄂伦春族线粒体DNA遗传多态性聚类分析
- 云南省10个少数民族遗传分化和基因流动被引量：3
- 2011年
- 目的基于9个CODIS STR基因座(CSF1PO、FGA、TH01、TPOX、vWA、D3S1358、D5S818、D7S820和D13S317)分型数据,探寻云南地区10个主要少数民族的遗传分化及基因流动特征。方法计算出各基因座的杂合度和分化指标F、θ、f和Gst。分别采用Phylip 3.6和Arlequin 3.0软件计算DA遗传距离和固定指数Fst。进而采用Mega 3.0软件构建系统发生树,最后应用R矩阵模型分析民族间的基因流动。结果 10个少数民族平均杂合度多大于0.7,分化检验显示在大多数基因座群体间都有显著性差异。系统发生树分析表明10个民族分为两大支,R矩阵分析表明彝族和傣族比其他民族有更多的基因流动,独龙族基因流动呈现出一定的隔离性。结论在法医鉴定中常用的9个STR基因座位点具有丰富的多态性,杂合度可以用于少数民族群体的遗传分化和基因流动分析。云南10个少数民族属于独立民族,分化程度一般。各民族间进化关系上较近,存在广泛的基因交流。
- 邝文健黄平托娅孙瑞芳李生斌
- 关键词：法医遗传学遗传分化基因流动少数民族
- 运用多重PCR-直接测序法检测ABO基因型及其遗传多态性被引量：2
- 2008年
- 根据ABO基因座第6和7外显子9个SNP位点设计引物,复合扩增后直接测序,根据测序结果判定不同物证检材ABO基因型及其在藏族群体中的多态性分布。成功地检测出经过不同方法处理的血痕、毛发、口腔拭子、骨骼、混合斑等101例腐败、降解及微量检材的ABO基因型,结果与免疫血清学分型一致,且该方法具有灵敏度高、特异性好、操作简单、结果准确、客观及能够发现新等位基因等优点。对80名青海藏族无关个体的调查表明,ABO基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡,杂合度H为0.675,多态信息含量PIC为0.672,个人识别力DP值为0.874,非父排除率PE值为0.391,偶合度I为0.126;青海藏族ABO等位基因频率O>B>A,且O等位基因频率高达0.6125。多重PCR-直接测序法检测ABO基因型适用于法医学不同来源的样本,提高了ABO血型系统的个体识别能力;ABO基因型在青海藏族人群中的分布具有较高多态性,可用于法医学个体识别及群体遗传学研究。
- 陈峰陈腾阎春霞党永辉穆豪放于晓光张博邓亚军
- 关键词：多重PCRDNA测序群体遗传学青海藏族
- 群体遗传学研究中STR数据的统计方法应用被引量：4
- 2007年
- STR作为遗传多态性较高的标记,被广泛地运用于群体遗传学的研究。对于STR分型产生的基因型频率及等位基因频率数据,文章总结了各种参数指标的计算及分析方法。其中参数指标包括杂合度、多态信息量、连锁不平衡系数、近交系数、遗传距离以及固定指数等;分析方法包括主成分分析、系统发生树、分子方差分析、R矩阵、地理信息系统以及空间自相关分析。通过这些参数指标及分析方法的使用,可以既直观又科学地揭示群体遗传结构、群体间遗传分化以及人类起源与进化等群体遗传学中研究的关键问题。
- 桂宏胜杨丽李生斌
- 关键词：STR群体遗传学系统发生树AMOVAR矩阵空间自相关
