国家自然科学基金(31160177)
- 作品数：6 被引量：4H指数：1
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- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 拟南芥成花调控LFY基因的选择性剪接(英文)
- 2012年
- 为研究拟南芥成花调控基因LFY,我们采用RT-PCR方法分离克隆了三种选择性剪接的片段,分别命名为LFY1239,LFY1263和LFY1275。序列分析表明LFY1263包含一个大小为1 263bp的开放阅读框,与之前报道的LFY基因片段大小相同,而LFY1239在第一外显子的3′端缺失了36bp,LFY1275在第一内含子的3′末端插入了12bp。对几种片段表达部位的分析显示,LFY1239只能在营养生长期的莲座叶中表达,而LFY1263和LFY1275在营养生长期和花期的花器官和莲座叶中都可以检测到,并且,LFY1263呈现出主导地位,LFY1275与LFY1263表达的比例表现为花器官高于莲座叶,该比例的变化可能预示着与成花调控有关。
- 于丽霞姚有林武晓璐汤晓倩鄢波
- 关键词：选择性剪接
- 纤枝短月藓LEA5亚族基因的克隆与生物信息学分析
- 2021年
- 植物胚胎发育晚期丰富蛋白(late embryogenesis abundant protein,LEA)是与细胞抗逆保护相关的一类重要蛋白质。本研究以纤枝短月藓(Brachymenium exile)为材料,利用PCR技术克隆得到纤枝短月藓LEA5亚族成员的基因序列。分析得出LEA5亚族有3个成员,分别命名为LEA5-1、LEA5-2、LEA5-3。通过生物信息学手段,分析LEA5亚族成员的理化性质、基因结构等信息。将纤枝短月藓与其它植物LEA5亚族编码蛋白氨基酸序列进行比对,构建系统进化树,结果显示纤枝短月藓与小立碗藓的亲缘关系最近。对LEA5-1进行荧光定量分析,结果表明,LEA5-1在纤枝短月藓不同时期和不同组织中都有表达,揭示可能对脱水胁迫有响应。这些结果为进一步研究LEA蛋白的保护机制奠定了基础。
- 李雪宝王琦鄢波
- 关键词：脱水胁迫
- 慈竹LEAFY基因和启动子的克隆及序列分析被引量：3
- 2014年
- 研究以开花慈竹叶片为材料,采用RT-PCR、染色体步移和RACE相结合的方法克隆得到慈竹LFY基因的完整片段,该基因DNA全长为3 116 bp,包含5'UTR和3'UTR,3个外显子和2个内含子序列,有一个1 161 bp的完整开放阅读框,编码386个氨基酸,LFY蛋白相对分子质量为42.29 kDa,等电点为8.85。蛋白质二级结构预测发现α-螺旋结构和无规卷曲为主导。通过Tail-PCR技术克隆得到1 003 bp的慈竹LFY基因的启动子序列,包含花粉特异表达元件、种子特异表达元件、激活StDof1蛋白在保卫细胞特异表达元件、控制大豆胁迫下的应答元件MYC识别位点、光调节相关元件及AGL15结合位点保守元件等。利用MAGA5.1软件构建慈竹与44种已知的不同植物来源的LFY基因氨基酸序列的系统发育树,结果显示系统发育树中分为2个大的分支,其中裸子植物和蕨类植物遗传距离较近,禾本科植物中慈竹与玉米遗传距离较近,其次为小麦。该研究从慈竹中克隆得到与花分生组织形式相关基因LFY基因,该研究为今后从分子水平上研究竹类植物开花机理打下基础。
- 白琼孙晓娇于丽霞鄢波
- 关键词：慈竹克隆启动子系统进化树
- 垫状卷柏SpLEA1基因克隆及干旱胁迫下的表达分析
- 2023年
- 晚期胚胎发育丰富蛋白(late embryogenesis abundant,LEA),广泛存在于生物体内,与植物抗逆性密切相关,可在干旱胁迫下保护植物细胞,减少植物损伤。垫状卷柏(Selaginella pulvinata)是一种在干旱胁迫下生存能力极强的蕨类植物,具有很强的恢复能力。为探究垫状卷柏SpLEA 1基因在耐旱植物中的分子机制与表达特征,该研究以高耐旱性植物垫状卷柏为实验材料,基于转录组测序结果,采用RT-PCR技术获得SpLEA 1基因cDNA序列,采用HiTail-PCR技术获得启动子序列,利用生物信息学对序列进行了分析,并采用qRT-PCR技术分析了SpLEA 1基因在干旱胁迫下的表达模式。结果表明:(1)垫状卷柏SpLEA 1全长为476 bp,开放阅读框(ORF)为279 bp,共编码92个氨基酸,通过在线工具预测到蛋白分子量为9491.46 Da,等电点为5.45,蛋白结构预测分析表明该蛋白为亲水性蛋白,含有10个磷酸化位点,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。(2)预测到SpLEA1蛋白的保守结构域为Lea-5,来源于LEA1家族。基于系统发生树和遗传距离矩阵,发现垫状卷柏SpLEA1与来自鹰嘴豆(Cicer arietinum)和红车轴草(Trifolium pratense)的Lea-5蛋白同源性较高。(3)对启动子序列进行顺式作用元件的预测分析发现SpLEA 1基因启动子含有5类激素响应元件和与干旱胁迫响应有关的功能元件。(4)在自然干旱处理下SpLEA 1基因表达上调,并在12 h时达到峰值,在24 h干旱后进行复水处理,表达量显著下调。综上所述,SpLEA 1基因在垫状卷柏中很可能参与了干旱胁迫响应机制的相关调控。该结果为进一步研究垫状卷柏SpLEA 1基因在干旱胁迫下的功能及其表达调控机制提供了参考。
- 周璇高鹏华鄢波
- 关键词：基因克隆启动子克隆
- 纤枝短月藓BeLEA2基因的克隆及表达分析
- 2022年
- 为探究纤枝短月藓LEA2基因的结构和表达特征,该研究以纤枝短月藓为材料,首次利用PCR克隆技术得到纤枝短月藓BeLEA2基因序列,并对该基因进行分析。结果表明:(1)该基因序列中含有2个外显子和1个内含子,其开放阅读框(ORF)为456 bp,编码151个氨基酸,预测其相对分子质量为16515.96 Da。(2)将纤枝短月藓与其他植物LEA2基因氨基酸序列进行比对,构建系统进化树,结果显示纤枝短月藓与小立碗藓的亲缘关系最近。(3)利用HiTail-PCR技术克隆获得1072 bp的BeLEA2启动子序列,用PlantCARE在线工具对该启动子的顺式作用元件进行预测,结果表明该启动子除了含有核心启动子元件TATA-box和CAAT-box外,还含有ABRE、MYB、MYC、MYB结合位点(MBS)等其他顺式元件。(4)实时荧光定量PCR分析表明,BeLEA2基因在纤枝短月藓不同发育时期和不同组织中都有表达,且对脱水胁迫有响应。以上结果为进一步探究LEA2基因在苔藓植物中的功能及作用机制奠定了基础。
- 李雪宝王琦鄢波
- 关键词：基因启动子脱水胁迫
- 纤枝短月藓LEA5基因表达及耐盐性分析《西北植物学报》发表论文的院士作者统计被引量：1
- 2021年
- 该研究以纤枝短月藓为材料,利用RT-PCR和HiTail-PCR技术分别克隆得到纤枝短月藓LEA5基因的ORF和启动子序列,并进行生物信息学、基因表达及耐盐性分析,为进一步研究LEA5蛋白的保护机制奠定基础。结果显示:(1)LEA5基因包含267 bp的开放阅读框(ORF),编码88个氨基酸。(2)LEA5基因启动子序列为1053 bp,利用PlantCARE在线工具预测顺式作用元件显示,该启动子不仅具有典型的CAAT box元件,还含有ABRE、MYB、MYC、MYB结合位点(MBS)等其他元件。(3)荧光定量分析表明,LEA5基因在纤枝短月藓不同时期和不同组织中都有表达。(4)LEA5蛋白的异源表达提高了大肠杆菌对盐胁迫的耐受性,表明LEA5蛋白可能在耐盐性中起重要作用。
- 李雪宝周璇鄢波
- 关键词：盐胁迫
