江西省教育厅青年科学基金(GJJ09442)
- 作品数：3 被引量：12H指数：2
- 相关作者：陶勇涂追许杨何庆华刘夏更多>>
- 相关机构：南昌大学南昌大佳科技有限公司更多>>
- 发文基金：江西省教育厅青年科学基金国家科技型中小企业技术创新基金食品科学与技术国家重点实验室目标导向资助项目更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 半巢式PCR法构建天然噬菌体单域重链抗体文库被引量：3
- 2010年
- 目的:构建天然噬菌体单域重链抗体文库,淘选可应用于食品安全检测的单域重链抗体。方法:以未经免疫的健康羊驼(Lama pacos)外周血为起始材料,提取RNA反转录为cDNA,根据重链抗体保守序列设计引物,通过半巢式PCR法扩增获得全套重链抗体可变区编码基因,将其克隆至噬菌粒pHEN1,电转化大肠杆菌TG1得到初级抗体库,辅助噬菌体KM13感染后得到噬菌体展示库。采用固相淘选法分别对3种人工抗原进行淘选。结果:单域重链抗体编码基因得到有效扩增,经10次电转化获得初级文库,命名为SNAL,实际库容量达到1.6×107个独立克隆,菌落PCR鉴定结果表明,克隆效率约为87%,辅助噬菌体救援后得到的展示文库命名为SNA-PDL,滴度达1013CFU/mL。对3种不同人工抗原DON-MBSA、NOR-BSA和AFB1-OVA的淘选均有富集现象。结论:构建了天然噬菌体单域重链抗体文库,文库的多样性较好,可以用于后续淘选。
- 涂追许杨何庆华陶勇
- 关键词：噬菌体文库羊驼半抗原
- 驼源天然单域重链抗体库的构建与鉴定被引量：8
- 2011年
- 从未经主动免疫的健康羊驼(Lama pacos)外周血淋巴细胞中提取总RNA,反转录后作为第一轮PCR的模板。根据重链抗体保守区域设计引物,经巢式PCR法扩增获得了全套重链抗体可变区基因,将其克隆至噬菌粒pHEN1,电转化大肠杆菌TG1得到初级抗体库NAL,含有2×107个独立克隆,菌落PCR和Hinf I酶切分析结果显示,克隆效率大于97%,文库的多样性良好。辅助噬菌体救援后,得到噬菌体展示文库命名为NA-PDL,滴度达1013CFU/ml。以真菌毒素人工抗原DON-MBSA为目标抗原,对NA-PDL进行了淘选,第二轮洗脱物中,阳性克隆率达36.4%,提示针对目标抗原的噬菌体颗粒得到了有效富集,文库NA-PDL多样性较好,为后续淘选针对特定抗原的单域重链抗体奠定了基础。
- 涂追许杨刘夏何庆华陶勇
- 关键词：羊驼脱氧雪腐镰刀菌烯醇噬菌体文库
- 抗DON单域重链抗体序列分析及三维建模与对接被引量：2
- 2011年
- 探讨应用分子模拟与对接技术预测抗脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)单域重链抗体(DONIV2)的三维结构及其与DON的结合模式。采用生物信息学相关工具和网站分析预测DONIV2的理化特性及其二级结构,同源建模方法获得三级结构,然后采用分子对接软件Autodock 4.2将三维结构模型与DON进行分子对接。二级结构和三级结构分析显示,DONIV2由10个β片层结构组成,CDR区为无规则卷曲结构,位于分子的一端,在CDR1、CDR2与CDR3之间形成1条宽度约为1.2 nm的凹槽结构。对接结果显示,可能的DON结合位点由Arg59、Arg103和Arg105等残基组成,他们位于CDR2和CDR3区域。表明通过分子模拟与对接相关工具获得了DONIV2的一、二、三级结构及可能的结合活性位点,为深入认识DON与抗体相互作用机理提供了理论指导,并为下一步DONIV2体外亲和力的成熟提供了线索。
- 涂追许杨付金衡刘夏陶勇
- 关键词：单域抗体脱氧雪腐镰刀菌烯醇分子模拟分子对接
