目的建立前列腺癌组织中胶原三股螺旋重复蛋白1(collagen triple helix repeat containing 1,CTHRC1)基因转录水平的微滴数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)检测方法,并进行验证。方法根据GenBank中登录的CTHRC1基因序列设计引物,扩增CTHRC1保守区基因片段,并合成含有该基因片段的PUC57质粒。经2%琼脂糖凝胶电泳验证引物的特异性后,采用PUC57质粒验证ddPCR法的正确度、精密性,并确定检测限及线性范围。采用建立的ddPCR法检测复旦大学附属中山医院泌尿外科住院患者73份前列腺穿刺组织样本(前列腺癌组织40份,非前列腺癌组织33份)中的CTHRC1基因转录水平,同时采用试剂盒检测患者血清中的总前列腺特异抗原(total prostate specific antigen,TPSA)水平,将相应结果进行ROC曲线分析,以获得CTHRC1-TPSA联合检测对诊断前列腺癌的预测概率。结果经2%琼脂糖凝胶电泳验证设计的引物具有良好的特异性。检测值和理论值之间的Log值差异均<1,且拟合度高,R2=0.9959,表明该方法具有良好的正确度;重复性验证CV均<10%,中间精密性验证CV均<15%;该方法的检测限为100copies/μL;检测值在100~104copies/μL范围内,与理论值呈良好的线性相关性,R2=0.9972。ddPCR法检测前列腺癌组织中CTHRC1基因转录水平显著高于非前列腺癌组织(Z=-4.339,P<0.001)。CTHRC1与TPSA联合诊断前列腺癌的ROC曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.847,灵敏度为83.3%,特异性为67.7%。结论ddPCR法可用于前列腺癌组织中CTHRC1基因转录水平的检测,与TPSA指标联合可提高临床诊断前列腺癌的准确性。
背景与目的:基因芯片技术是利用杂交测序方法,可大规模高通量地检测不同组织、细胞中的基因表达水平的技术。该研究采用基因芯片技术筛选前列腺癌及前列腺炎症穿刺组织中差异表达的基因并对其进行生物学信息分析。方法:采用美国Affymetrix Human U133 plus 2.0基因表达谱芯片,按一步法分别抽提恶性程度较高的前列腺癌及前列腺炎症组织的总RNA,并分离纯化这两种组织的m RNA。经逆转录合成掺入生物素标记的c DNA合成探针,与芯片杂交和严格洗片后,用荧光扫描仪扫描芯片荧光信号图像。用生物信息学方法分析前列腺癌及前列腺炎症组织中差异表达基因。结果:按照表达差异倍数大于等于2,P<0.05的筛选条件,筛选出差异基因1 819条,其中上调表达基因1 025条和下调表达基因794条。采用GO富集分析发现这些差异基因主要涉及细胞周期、分子代谢等分子功能以及生物学过程;KEGG信号通路分析发现,这些差异基因主要涉及嘌呤核苷酸代谢等代谢通路。STING在线工具分析对差异基因编码的蛋白质间的相互作用进行分析,结果发现这些基因编码的蛋白间的相互作用主要集中在TPX2、ANLN、NUSAP1、MELK、DLGAP5、KIF11、TOP2A及RRM2等20个关键节点基因。最后对重要节点基因进行文献挖掘,发现CEP55和ANLN基因可能与前列腺癌的发生和转移有关。结论:在前列腺癌的发生、发展中,促使细胞进入增殖周期的相关基因的活化、代谢相关酶类基因活性的异常、细胞黏附功能相关基因的抑制以及细胞移行相关基因的激活等因素发挥了重要的作用。系统的分析这些基因发现,CEP55和ANLN基因与前列腺癌的发生和预后关系密切,为下一步研究实验提供有价值的线索。进一步研究相关差异基因将有望发现新的早期诊断指标,为建立个体化治疗方案和预后评估系统提供帮助。
Lung cancer is the leading cause of cancer-related mortality around the world. Despite advancements in diagnosis, surgical techniques, and neoadjuvant chemoradiotherapy over the last decade, the mortality rate is still high and the 5-year survival is a dismal 15%. Fortunately, early detection by low-dose computed tomography （LDCT） scans has reduced mortality by 20%; yet, overall, 5-year-survival remains low at less than 20%. Therefore, in order to ame- liorate this situation, a thorough understanding of the underlying molecular mechanisms is urgently needed. Chemo- kines and their receptors, crucial microenvironmental factors, play important roles in lung tumor genesis, progression, and metastasis, and exploring the mechanisms of this might bring new insights into early diagnosis and precisely targeted treatment. Consequently, this review will mainly focus on recent advancements on the axes of chemokines and their receptors of lung cancer.
