甘肃省科技重大专项计划(1102NKDH023)
- 作品数:7 被引量:34H指数:4
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- 发文基金:甘肃省科技重大专项计划国家现代农业产业技术体系建设项目国家科技支撑计划更多>>
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- 绵羊BMP15基因特征、组织表达及其与产羔数性状的关联性分析被引量:11
- 2015年
- 为了解绵羊BMP15基因序列特征和组织表达特征,SNP筛查及其与产羔数性状关联性分析,采用生物信息学方法分析绵羊BMP15基因序列特征;利用qRT-PCR检测BMP15基因在‘湖羊’下丘脑、垂体、心等13个组织中mRNA的分布;通过测序验证了绵羊BMP15基因B2突变位点并与产羔数进行关联性分析.结果表明:绵羊BMP15基因ORF全长1 377bp,编码393个氨基酸残基,包括transforming growth factor-beta(TGF-beta)家族和低复杂性区段(low complexity region).Protfun分析结果显示,绵羊BMP15基因作为激素参与生物学过程的可能性最高.绵羊BMP15基因在公羊十二指肠中表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05),而在母羊中,卵巢组织的表达量最高,且显著高于其他组织(P<0.05).B2突变位点于BMP15基因编码区外显子Ⅱ的第718bp处,该突变为C→T突变.绵羊产羔数相关联分析结果显示:该位点与产羔数呈显著相关,其中G+型绵羊产羔数为(2.00±0.78),显著高于++型绵羊产羔数(P<0.05),为(1.38±0.54).绵羊BMP15基因B2突变位点与绵羊产羔数呈显著相关,可用作为提高绵羊产羔数性状的分子标记应用于育种.
- 刘世佳潘香羽李发弟王维民李廷福
- 关键词:绵羊BMP15基因特征产羔数
- 绵羊ESR基因生物信息学分析被引量:9
- 2014年
- 利用生物基因组学数据库,对绵羊雌激素受体(estrogen receptor,ESR)基因进行生物信息学分析。结果表明,绵羊ESR基因含有1个1 413 bp的开放阅读框,编码470个氨基酸;ESR蛋白分子质量为53 393.85D。ESR基因主要位于细胞核中,参与机体转录调控过程。
- 张小雪潘香羽李发弟王维民
- 关键词:绵羊雌激素受体生物信息学分析
- 绵羊GDF9基因生物信息学分析被引量:3
- 2014年
- 利用生物基因组学数据库,对生长分化因子9(Growth Differentiation Factor 9,GDF 9)基因进行生物信息学分析。结果表明,绵羊GDF 9基因含有1个1 362 bp的开放阅读框,编码452个氨基酸;GDF 9蛋白分子质量为51 773.63 D;GDF 9基因主要位于细胞膜及膜外,参与机体的信号转导调控。
- 张小雪潘香羽李发弟王维民
- 关键词:绵羊生物信息学分析
- 绵羊RARG基因组织表达规律的研究被引量:2
- 2013年
- 根据GenBank中报道的绵羊视黄酸受体γ(retinoic acid receptor-gamma,RARG)基因mRNA序列,设计特异性引物,利用Real-time PCR技术对绵羊RARG基因的组织表达规律进行了研究,并对其进行了生物信息学分析,为进一步研究该基因的功能提供线索。结果表明,绵羊RARG基因共编码458个氨基酸,其中亮氨酸所占比例最高,为11.10%;该基因编码产物在系统进化树中与牛的亲缘关系最近;RARG基因编码产物二级结构主要以无规则卷曲和α螺旋为主,主要位于细胞核中,是一种水溶性蛋白;Real-time PCR结果显示,绵羊RARG mRNA在心、肝、脾、肺、肾、瘤胃、十二指肠、淋巴、下丘脑、垂体、肌肉、睾丸等12个组织中均有表达,其中在睾丸中表达量最高,推测绵羊RARG基因可能参与机体繁殖机能的调控。
- 王维民李发弟潘香羽
- 关键词:绵羊PCR生物信息学分析
- 酵母β-葡聚糖对早期断奶羔羊瘤胃氮代谢的影响被引量:6
- 2013年
- 选用甘肃肉用绵羊新品种选育群初生公羔20只,随机分为5组,观测了饲粮中添加不同剂量(0、37.50、75.00、112.50、150.00 mg/kg)酵母β-葡聚糖对早期断奶羔羊瘤胃氮代谢参数的影响,结果表明,添加酵母β-葡聚糖对日龄82 d的羔羊瘤胃液中总氮、氨氮和蛋白氮含量均没有显著影响(P>0.05),75.00 mg/kg的添加剂量组尿素氮含量有高于对照组的趋势(P=0.091),食前150.00 mg/kg添加剂量组血清尿素氮显著低于对照组(P<0.05)。
- 李冲魏占虎李发弟马友记王维民姜仲文周勇
- 关键词:早期断奶羔羊酵母Β-葡聚糖血清尿素氮
- 绵羊LHβ基因生物信息学分析被引量:4
- 2013年
- 利用生物基因组学数据库,对绵羊促黄体生成素β(Luteinizing hormone beta,LHβ)基因进行生物信息学分析。结果表明,绵羊LHβ基因含有1个426 bp的开放阅读框,编码141个氨基酸;LHβ蛋白分子质量为15.2KD,理论等电点为7.47;LHβ编码产物的二级结构主要以β折叠和无规则卷曲为主,主要位于细胞质中,作为一种激素参与机体的生殖调控。
- 王维民李发弟潘香羽
- 关键词:绵羊生物信息学分析
- 绵羊IGF-Ⅰ和IGF-Ⅰ R基因特征分析及其在肌肉组织中的表达差异被引量:2
- 2015年
- 为了比较IGF-Ⅰ和IGF-ⅠR基因在绵羊肌肉中的表达差异,根据GenBank公布的绵羊IGF-Ⅰ和IGF-ⅠR基因mRNA序列设计特异性引物,采用实时定量PCR方法检测其在甘肃‘高山细毛羊’及其与南非肉用‘美利奴’杂交F1代(南甘F1代)羔羊肌肉组织中的表达量.利用生物信息学软件分析了绵羊IGF-Ⅰ和IGF-ⅠR基因结构,并构建系统进化树,探讨了其生物学功能.结果表明:南甘F1代羔羊肌肉组织中IGF-Ⅰ基因的表达量显著高于‘甘肃高山细毛羊’(P〈0.05),而IGF-ⅠR基因的表达量在南甘F1代羔羊和‘甘肃高山细毛羊’肌肉组织中没有显著变化(P〉0.05).绵羊IGF-Ⅰ和IGF-ⅠR基因分别含有465bp和4 518bp的完整开放阅读框,编码154个和1 505个氨基酸;其蛋白质分子量分别为17 011.71U和169 267.26U,等电点分别为9.36和6.70;IGF-Ⅰ基因信号肽切割点分别位于49~50位氨基酸之间,而IGF-ⅠR基因不含信号肽;IGF-Ⅰ基因编码产物的二级结构主要以无规则卷曲和α-螺旋为主,位于细胞核的可能性最高(62.5%);IGF-ⅠR基因编码产物的二级结构主要以无规则卷曲为主,位于细胞质的可能性最高(34.8%);IGF-Ⅰ和IGF-ⅠR基因分别作为激素和信号传感器参与机体生物学过程.
- 王冬李发弟王维民马友记李冲梁育林
- 关键词:绵羊RT-QPCR