国家自然科学基金(81290343)
- 作品数:5 被引量:8H指数:2
- 相关作者:张永振李明慧陈小萍赵高余康雁君更多>>
- 相关机构:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所武汉市疾病预防控制中心龙泉市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 弹状病毒的分类和进化被引量:2
- 2014年
- 弹状病毒科病毒给人类健康、农业、畜牧业和渔业带来重大影响。不同属病毒之间在基因组结构、宿主范围、传播方式等方面性状各异。目前弹状病毒划分为9个属,但仍有不少新发现病毒有待分类。病毒的进化与媒介(宿主)、传播方式、生态环境等多种因素密切相关。
- 康雁君张永振
- 关键词:弹状病毒进化
- 北京市昌平区西伯利亚立克次体的分离和鉴定被引量:1
- 2014年
- 目的对北京市昌平区中国疾病预防控制中心园区内刺猬携带的中华革蜱进行斑点热群立克次体(SFGR)的分离和鉴定。方法采用形态学和分子生物学方法对SFGR进行鉴定,并进行系统进化特征分析。结果 SFGR对DH82细胞产生明显细胞病变;Gimenez染色后,可见较多清晰的立克次体被染成紫红色;细菌16S基因测定后,西伯利亚立克次体246株和西伯利亚立克次体BJ-90株相应核苷酸序列的同源性均为100%;系统进化分析显示,SFGR位于西伯利亚立克次体进化分支内,确认其为西伯利亚立克次体。结论北京市昌平区存在西伯利亚立克次体,该地区存在北亚热自然疫源地的可能性。
- 贺金荣李明慧陈小萍李辞修
- 浙江省啮齿动物中温州病毒的基因组学分析被引量:1
- 2017年
- 目的为了解国内发现的新型沙粒病毒(温州病毒)在温州地区啮齿类动物中的流行情况。方法采用巢式RT-PCR方法分别对采集自温州(48份)及龙泉(156份)的啮齿动物样本筛查沙粒病毒。结果在温州地区采集的5份啮齿动物样本中再次检测到温州病毒,阳性率为10.41%;但在龙泉地区采集的156份样本中均未发现温州病毒。分析病毒的全基因组序列发现其中4株病毒与已知的温州病毒有很高的同源性;而编号为Wencheng-Rn-288病毒株的S和L节段与已知病毒同源性分别为87.5%和91.6%,在进化树上为一独立分支,为温州病毒的新亚型。结论温州病毒在温州地区啮齿动物中有较高的流行率,且呈多样性。鉴于在柬埔寨已发现温州病毒能引起人呼吸道疾病,因此我国应加强温州病毒的监测。
- 李鲲林献丹李明慧王淼若孙肖瑜张永振
- 关键词:啮齿动物新亚型呼吸道疾病
- 利用高通量测序技术检测流行性乙型脑炎病毒被引量:1
- 2015年
- 目的通过宏转录组和高通量测序方法高效检测和分析蚊虫样品中的流行性乙型脑炎(乙脑)病毒。方法2013年从武汉地区采集蚊虫标本32批(约480只),通过TRIzol加试剂盒的方法对蚊虫进行总RNA提取,对RNA制备RNA文库,应用Trinity、Blast、Seq Man、MAFFT_7、Meg Align、Phy ML等生物学软件对乙脑病毒全基因组核酸序列进行获取及病毒的系统进化分析。结果检测到乙脑病毒1株(WH-JEV株),并分析获得其基因组全长10 947 bp,其中从81位到10 367位为开放阅读框,编码3432个氨基酸。该病毒的测序深度为40X,丰度(TPM)为4.19,对比蚊虫转录组里其他病毒属于低表达量病毒。全基因组序列系统进化分析显示WH-JEV株属于基因Ⅰ型乙脑病毒,而与其最近的LN0716株的核酸序列相似度为99.5%,氨基酸序列相似度为100%。结论利用高通量技术可快速检测出乙脑病毒,并获得相关的全基因组信息。
- 李辞修施莽田俊华李明慧覃新程
- 关键词:高通量技术流行性乙型脑炎病毒丰度系统进化
- 埃立克体和埃立克体病被引量:3
- 2013年
- 埃立克体属(Ehrlichia)细菌属于a-变形菌纲(a.Proteobacteria)立克次体目(Rickettsiales)的无形体科(Anaplasmataceae)。埃立克体在自然界中借助节肢动物媒介和脊椎动物宿主而存在,能引起人或动物埃立克体病。
- 赵高余陈小萍张永振
- 关键词:埃立克体埃立克体病