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新发虫媒病毒:基因A型版纳病毒全基因组序列扩增引物被引量：5: 2016年; 目的设计版纳病毒型别特异性测序引物,为构建快速高效经济的版纳病毒全基因组测序平台奠定基础。方法根据Gen Bank已知的版纳病毒基因序列信息进行基因型分析,采用Primer Premier v6.0及Oligo 7.56软件完成版纳病毒亚型特异性扩增引物的设计与评估。使用中国分离的30株版纳病毒进行版纳病毒型别特异性引物工作效率验证和评估。结果通过对30株隶属于2个不同基因亚型的版纳病毒开展全基因组序列测定,获得2套型别工作效率高、扩增效果稳定的基因A型特异性版纳病毒全基因组序列扩增测序引物。基因A1亚型引物一套共26对;基因A2亚型引物一套共计30对。完成了30株版纳病毒全基因组序列扩增。结论设计的版纳病毒型别特异性扩增测序引物可以高效准确地完成版纳病毒全基因组序列扩增,为进一步深入研究版纳病毒分子生物学特征奠定了基础。; 刘红梁国栋; 关键词：版纳病毒基因型测序

乙脑病毒的空间播散及迁徙事件研究被引量：5: 2015年; 为明确乙脑病毒在空间播散的分布及分化机制,利用PhyML v3.0软件对359株具有详细信息的乙脑病毒(基因1型)E基因序列进行系统进化分析,使用PAUP v4.0软件和MigraPhyla软件包进行迁徙事件推演分析。结果显示乙脑病毒在亚洲的播散存在频繁的迁徙事件,共计发生迁徙事件95次,其中在我国境内发生54次。分析结果还显示泰国以及中国上海、山东、四川和云南等地是乙脑病毒重要的迁徙源泉地区,泰国作为源泉地区主要播散至太平洋地区的澳大利亚、柬埔寨、印度以及中国西藏;上海作为源泉地区乙脑病毒主要播散至亚洲东部沿海地区以及中国云南;山东主要播散至韩国以及中国的浙江、湖北、山西和辽宁等省份;四川主要迁徙至中国内陆省份以及越南和日本;云南作为源泉地区主要迁徙至浙江。本研究首次证实乙脑病毒在亚洲的播散存在频繁的迁徙事件,泰国以及中国上海、山东、四川和云南等省份是乙脑病毒在亚洲播散的重要源泉地区。; 高晓艳周海卫刘红付士红王环宇郭振洋李晓龙梁国栋; 关键词：乙脑病毒

四川省东南部地区蚊、蠓及相关虫媒病毒调查研究被引量：4: 2018年; 目的了解四川省的蚊、蠓以及相关虫媒病毒种类及分布。方法在自然界使用灯诱法采集吸血昆虫标本，形态学分类后分装，液氮保存备用。蚊虫、蠓虫研磨上清液接种BHK-21细胞和C6/36细胞进行病毒分离和病毒基因检测。使用BioEdit 7.0.5.3、MEGA 6.0等软件对病毒序列进行分子生物学特征分析。结果2016－2017年在四川省东南部3个县的7个自然村共采集到3属4种蚊虫17 019只，蠓虫12 700只。三带喙库蚊占蚊虫采集总数的79.4%（13 519/17 019），其次为骚扰阿蚊（11.1%，1 897/17 019），致倦库蚊占采集蚊虫标本总数的5.5%（930/17 019）；中华按蚊最少（4.0%，673/17 019）。蚊虫标本接种组织细胞后，在合江县采集的三带喙库蚊标本获得3株可以稳定传代的病毒分离株，经分子生物学实验鉴定为基因Ⅰ型流行性乙型脑炎（乙脑）病毒，在合江县采集的7批蚊虫中检测到乙脑病毒基因阳性。蠓虫标本接种细胞后未获得病毒分离物，在合江县采集的4批蠓虫标本经分子生物学检测，显示阿卡斑病毒基因阳性。结论三带喙库蚊是四川省东南部3县的优势蚊种，四川省东南部存在经蚊虫传播的乙脑病毒及以蠓虫为媒介的阿卡斑病毒。; 宋颂付士红周兴余张佳珂李伟刘丽珺李劲松汪健林于李晓龙何英雷雯雯王环宇王斌鲁晓睛梁国栋; 关键词：流行性乙型脑炎病毒

中华按蚊分离的版纳病毒全基因组序列测定与分子遗传进化分析被引量：3: 2018年; 目的对分离自中华按蚊的版纳病毒进行病毒全基因组核苷酸序列测定和分子遗传学分析。方法使用分子病毒学方法测定病毒全基因组12节段核苷酸序列,以生物信息学软件进行序列比对、同源性和分子遗传进化分析。结果 2012年从云南省中缅边境地区中华按蚊分离的版纳病毒(YN12234病毒株)能在C6/36细胞引起细胞病变并稳定传代,该病毒为12节段RNA病毒。根据病毒VP1蛋白(RdRp)氨基酸序列进行的分子遗传进化分析发现,YN12234病毒属于呼肠孤病毒科东南亚12节段RNA病毒属版纳病毒。对第12节段基因序列的进一步分析显示,YN12234病毒属于A2基因型版纳病毒。系统进化分析结果还显示,从中华按蚊分离的版纳病毒与此前从中华按蚊分离的版纳病毒处在不同进化分支,且不同蚊虫分离的版纳病毒并非聚类在共同的进化分支。结论从中华按蚊分离的YN12234病毒株属于含有12节段的版纳病毒,分子进化分析结果提示包括云南省分离的YN12234病毒在内的目前国内外从蚊虫分离的版纳病毒并不存在病毒与蚊虫种类之间的媒介适应性。; 程睿付士红范娜何英雷雯雯王环宇王斌鲁晓晴梁国栋; 关键词：版纳病毒中华按蚊

Characterization of viromes within mosquito species in China被引量：3: 2020年; Mosquitoes are vectors of multiple disease-causing agents that cause worldwide outbreaks of serious infectious diseases in both humans and animals. These arboviral agents include Dengue virus (DENV), Zika virus (ZIKV), chikungunya virus, yellow fever virus, Japanese encephalitis virus (JEV),and Rift Valley fever virus. Thus, mosquitoes are key to the study of viral origin, spread, and the epidemic tendency of these infectious diseases (Hall and Macdonald, 2016).; Jiang DuFan LiYelin HanShihong FuBo LiuNan ShaoHaoxiang SuWeijia ZhangDandan ZhengWenwen LeiJie DongLilian SunYing HeJianmin WangFan YangHuanyu WangGuodong LiangZhiqiang WuQi Jin; 关键词：DISEASES ENCEPHALITIS FEVER

基于第12节段基因序列的版纳病毒分子遗传进化分析被引量：3: 2016年; 目的了解自1980-2012年在世界各地分离的版纳病毒分子遗传进化特征。方法采用多种生物信息学分析方法，对1980-2012年我国及世界各地分离的版纳病毒进行基于第12节段基因序列的系统进化、分子溯源分析。结果版纳病毒的共同进化祖先出现时间为315（95% HPD：63～619）年前，第12节段的进化速率为2.33×10-3（95% HPD：2.84×10-4～8.52×10-3）碱基替换/位点/年，提示版纳病毒属于新发快速进化的虫媒病毒。结论版纳病毒属于快速进化的新发虫媒病毒，其地域分布范围进一步扩大且已经分化出新的病毒变种，应加强对该病毒在自然界分布及其致病性的监测。; 刘红高晓艳付士红李铭华翟友刚孟维珊孙肖红王环宇吕志申辛欣曹玉玺何英梁国栋; 关键词：版纳病毒虫媒病毒系统进化分析

河南省新安县和息县2012年蚊传虫媒病毒调查被引量：2: 2015年; 目的了解河南省部分地区蚊传虫媒病毒的种类分布及基因型别。方法于2012年5-8月在河南省洛阳市新安县和信阳市息县的居民住房、猪圈、牛棚及树林中采集蚊虫。使用细胞培养法分离病毒,通过反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法进行种属特异扩增鉴定,并用Clustal X2.1、Meg Align、Genedoc 3.2和Mega v5.1生物信息学软件完成病毒核酸序列的分子生物学分析并进行基因分型。结果共采集蚊虫4属5种7149只,其中新安县以骚扰阿蚊居多(2055只,51.36%),息县以淡色库蚊(2964只,94.16%)为主。共分离获得5株病毒,直接接种BHK-21细胞无病变、C6/36细胞培养仅导致轻微病变,其C6/36细胞传代培养物转接BHK-21细胞后3 d可致细胞明显病变;序列分析表明这5株病毒均属基因Ⅰ型流行性乙型脑炎病毒(JEV),其中3株分离自淡色库蚊,2株来自三带喙库蚊。结论河南省部分地区依然存在JEV及其传播媒介,且目前当地自然界中循环的JEV仍以基因Ⅰ型为主。; 郑雅匀付士红唐晓燕李幸乐尚思远徐超梁国栋; 关键词：流行性乙型脑炎病毒基因型

湖北省部分地区2010年蚊传虫媒病毒调查被引量：4: 2015年; 目的继续调查湖北省蚊媒和病毒种类及其分布状况。方法 2010年夏季在湖北省恩施州、神农架林区、江陵县和随州市采集蚊虫标本,用组织培养法分离病毒,用血清学和分子生物学方法对阳性病毒分离物进行鉴定,利用生物信息学软件对新分离病毒进行序列同源性和系统进化分析。结果采集到3属4种12 845只蚊虫标本,共分离到38株阳性分离物,经血清学和分子生物学鉴定,32株阳性分离物为流行性乙型脑炎病毒(JEV),5株阳性分离物为盖塔病毒,1株为JEV和盖塔病毒感染混合株。JEV E基因序列进化分析显示新分离JEV均为基因Ⅰ型JEV。盖塔病毒NS2基因序列进化分析显示新分离病毒与中国河北省和韩国毒株同源性最高,与俄罗斯分离株进化关系较远。结论首次在湖北省分离到盖塔病毒,并再次在湖北省分离到基因Ⅰ型JEV。; 高晓艳付士红邹文菁彭延刘红曹玉玺江永忠梁国栋; 关键词：虫媒病毒流行性乙型脑炎病毒盖塔病毒系统进化分析

我国西尼罗病毒和Tahyna病毒的发现与流行被引量：13: 2016年; 已发现100余种蚊传虫媒病毒在世界各地流行,其引发的人兽共患病是全世界关注的公共卫生问题。长期以来我国仅发现乙型脑炎和登革热两种蚊传虫媒病毒病,但近年来新发现西尼罗病毒和Tahyna病毒及其感染疾病流行。从我国新疆维吾尔自治区采集的蚊虫标本中分离到西尼罗病毒,大量血清学研究证明当地不仅存在西尼罗病毒感染所致疾病,还发生过西尼罗病毒感染引发的病毒性脑炎流行。目前已从新疆维吾尔自治区、青海省和内蒙古自治区采集的蚊虫标本中分离到Tahyna病毒,并发现其在自然界动物中的循环和导致的人类感染流行。西尼罗病毒和Tahyna病毒及其相关感染性疾病的发现为我国虫媒病毒及虫媒病毒病的预防与控制提出了新的挑战。; 梁国栋; 关键词：虫媒病毒西尼罗病毒病毒性脑炎

盖塔病毒分子进化及其迁徙被引量：11: 2017年; 目的了解世界各地分离盖塔病毒分子进化特征及其时空迁徙。方法用Clustal X1.83、MegaAlign和Gene DOC软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,用MEGA 6.0软件绘制系统发生树,采用BEAST v 1.8.1软件包里的Bayesian Stochastic Search Variable Selection(BSSVS)程序进行盖塔病毒的空间动力学分析。结果盖塔病毒E2基因全长均为1 266nt,编码422aa,其核苷酸和氨基酸同源性分别为94.5%~100%和96.4%~100%。病毒分子进化分析发现,盖塔病毒不存在蚊虫,马匹和猪等宿主动物和媒介的种属和地域分布差异。生物信息学分析结果显示,盖塔病毒起源于马来西亚,此后依次传播至日本、中国、韩国以及蒙古国和俄罗斯等地。结论自1955年首次分离盖塔病毒至2014年间分离的盖塔病毒E2基因序列较为稳定,未发现病毒基因组之间存在种属及地域分布差异,并且该病毒已经从热带地区传播到欧亚大陆多个国家和地区,因此加强盖塔病毒及人畜动物感染的检测和监测至关重要。; 李元元刘红李晓龙付士红高晓艳雷雯雯吕志何英王环宇王桂琴梁国栋; 关键词：盖塔病毒分子进化

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