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重庆市科技攻关计划(CSTC2012GGYYJSB80002)

作品数:1 被引量:6H指数:1
相关作者:洪瑞唐尧车燕飞陈斌张玉娟更多>>
相关机构:重庆师范大学更多>>
发文基金:重庆市科技攻关计划美国国立卫生研究院基金国家自然科学基金更多>>
相关领域:医药卫生更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇中华按蚊
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇细胞
  • 1篇细胞色素
  • 1篇细胞色素P4...
  • 1篇按蚊

机构

  • 1篇重庆师范大学

作者

  • 1篇张玉娟
  • 1篇陈斌
  • 1篇车燕飞
  • 1篇唐尧
  • 1篇洪瑞

传媒

  • 1篇中国媒介生物...

年份

  • 1篇2014
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
中华按蚊CYP6P5基因的生物信息学鉴定及特征分析被引量:6
2014年
目的鉴定中华按蚊CYP6P5基因并分析其序列特征,为研究中华按蚊CYP6P5基因杀虫剂抗性机制提供理论依据。方法以催命按蚊基因CYP6P5为询问基因,基于中华按蚊转录组测序数据,采用双向Blast方法搜寻中华按蚊CYP6P5cDNA序列。利用生物信息学相关软件对该基因编码蛋白序列的一级结构、疏水区、跨膜区、结构域、3D结构等进行预测分析,并采用最大似然法(maximumlikelihood,ML)建立代表性蚊种的系统发育关系。结果搜索获得1条中华按蚊CYP6P5全长cDNA序列。该cDNA序列具备P450超家族和CYP6家族特征性的保守序列,命名为CYP6P5(GenBank登录号:KF358704)。该cDNA全长为1583bp,开放阅读框为1527bp,编码508个氨基酸,推测其相对分子质量为58.32×10-3,等电点为7.17。分析表明该基因编码的蛋白序列第5~21位氨基酸是疏水区,第5~22位氨基酸是跨膜区,第36~505位氨基酸是P450保守结构域,并具有多个酶活性位点。系统发育关系和相似性分析表明,中华按蚊CYP6P5与催命按蚊CYP6P5和冈比亚按蚊CYP6P5亲缘关系最近,形成一个单系,相似率分别为89.4%和89.0%。结论为进一步研究中华按蚊CYP6P5基因溴氰菊酯抗性的分子机制奠定了基础。
车燕飞张玉娟唐尧洪瑞陈斌
关键词:细胞色素P450中华按蚊生物信息学分析
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