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计算机辅助药物设计教学改革与探索被引量：7: 2013年; 计算机辅助药物设计(Computer-aided drug design,CADD)是生命科学与计算机、药学、化学、物理、数学等学科全方位交叉的学科,该门课也是生物工程专业专业课教学中一门重要的应用实践课程。该文以淮北师范大学生命科学学院生物工程专业为例,从计算机辅助药物设计的授课内容改进、教学方法形象多样化、加强实际操作应用3个方面阐述本校应用型人才培养模式下的计算机辅助药物设计教学改革与探索。; 吴晓敏薛书蕾张海军王光利; 关键词：计算机辅助药物设计应用型人才教学改革

模型多肽Trp-Cage折叠形成机制的研究进展被引量：3: 2013年; 蛋白质折叠是目前结构生物学领域的核心问题之一,理解蛋白质结构折叠机制及其与生物功能之间的相互关系一直是生命科学家非常重要的研究内容,并且该研究受到越来越多不同学科领域研究工作者的高度重视.蛋白质大多数在数十毫秒、微秒或几秒内完成自我折叠过程,但其折叠过程中所发生的分子结构精细转变却在纳秒甚至更短时间尺度内完成.由于其折叠时间分辨率的限制,目前无论是从常规实验还是理论计算角度对其研究都存在一定的难度.本文首先概述了蛋白质折叠研究在实验和理论模拟方面存在的一些问题,然后以结构典型且可快速折叠的人工设计多肽Trp-cage为例,主要对其折叠过渡温度、折叠形成模型及其肽链上关键氨基酸残基在折叠过程中的作用三个方面进行了详细讨论,综述了模型多肽Trp-cage的折叠动力学行为分别在实验和理论模拟方面的研究进展.最后就如何有效化解蛋白质残基间相互作用网络进而降低其折叠机制的复杂性提出了一些新的建议,不仅有助于阐明该迷你蛋白Trp-cage快速折叠、稳定形成的驱动力成因,而且也能为蛋白质折叠机制研究和多肽设计提供有益参考.; 吴晓敏袁晓辉薛书蕾查岭生王光利张海军; 关键词：关键氨基酸

降解菌Pigmentiphaga sp.strain D-2对啶虫脒污染土壤的生物修复作用被引量：2: 2014年; 啶虫脒属于一种新型的氯化烟碱类杀虫剂，被认为是替代有机磷农药的重要品种之一，在世界范围内已经得到了广泛的应用，其在环境中的残留备受关注，利用微生物修复异源污染物是一种有效的措施。在实验室条件下，研究了高效降解菌D-2（噬染料菌属，Pigmentiphagasp．）对被啶虫脒污染土壤的修复作用及其影响因素。结果表明，降解菌株在未灭菌土壤中的降解效果要略好于灭菌土壤，在土壤外源添加降解菌2×10^8cfu／g，温度20～40℃，弱碱性（pH7．5）的条件下，该菌株能有效降解土壤中1～200mg／kg的啶虫脒。啶虫脒施用对土壤种群结构有一定的影响，可以刺激细菌和真菌的生长，从而使土壤微生物群落结构发生改变，而降解菌的施用可缓解啶虫脒对土壤微生物的影响，修复受污染土壤。因此，人工接种降解菌D-2可提高土壤中啶虫脒的降解率，有效降低其在土壤中的残留。; 王光利张辉熊明华吴晓敏葛玮李峰; 关键词：啶虫脒生物修复环境因素

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安徽省自然科学基金(1208085QC58)