四川省畜禽育种攻关项目(2011NZ0099-6)
- 作品数：12 被引量：58H指数：5
- 相关作者：徐亚欧林亚秋聂晓庆左斌王海更多>>
- 相关机构：西南民族大学四川省畜牧科学研究院冕宁县畜牧局更多>>
- 发文基金：四川省畜禽育种攻关项目四川省应用基础研究计划项目国家肉鸡产业技术体系建设专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 基于D-loop区序列分析的四川省三个地方鸡种遗传多样性及母系亲缘关系研究被引量：11
- 2013年
- 为研究四川省少数民族地区泸宁鸡、米易鸡、草科鸡的遗传多样性及母系亲缘关系,通过PCR扩增、产物回收、测序的方法,获得各鸡种30个样本的mtDNA D-loop区的部分序列,利用DNAMAN、MEGA5、DnaSP、Network等生物信息学软件对测序结果进行分析。对90个个体mtDNA D-loop区589 bp的片段通过数据分析及聚类分析,构建了单倍型网络关系图及品种聚类图等。泸宁鸡、米易鸡、草科鸡具有较近的亲缘关系,推测3个地方鸡种起源于分布在印度支那半岛、泰国、苏门答腊的红原鸡Gallus gallus gallus亚种。
- 蒋利蒋小松熊斌王康环王海刘光伟任冰冰徐亚欧
- 关键词：地方鸡品种
- 藏鸡磷酸酪氨酸互作结构域1(PID1)的克隆及组织表达谱研究被引量：5
- 2016年
- 本研究旨在阐明藏鸡PID1基因在不同组织与时序表达谱,并研究PID1基因表达与肌内脂肪含量(IMF)的关系。利用RT-PCR技术克隆藏鸡PID1基因,用相关软件预测PID1蛋白的结构和功能,采用荧光定量PCR研究PID1基因在藏鸡不同组织、不同日龄的表达谱,并分析其与IMF的相关性。结果显示,克隆得到藏鸡PID1基因序列长度为654bp(GenBank登录号:KT000001),共编码217个氨基酸,是具有PTB结构域的不稳定亲水酸性蛋白质;有14个磷酸化位点、4个O-糖基化位点、1个N-糖基化位点、7种保守特异性蛋白激酶结合位点、3个二硫键;预测其二级结构中α-螺旋占26.73%,β折叠占20.74%,无规则卷曲占52.53%,属于混合型蛋白且主要存在于细胞质中。荧光定量PCR结果显示,PID1基因在藏鸡的不同组织中均存在表达,且在脂肪组织中表达水平最高(P<0.01);时序表达谱结果显示,PID1基因在1日龄公藏鸡胸肌中表达水平最高。在210日龄的公鸡腿肌的表达量极显著高于其他日龄的表达水平(P<0.01),在119日龄母鸡腿肌的表达量极显著高于其他日龄表达水平(P<0.01)。在119和154日龄公鸡脂肪组织中表达水平较高,在210日龄母鸡脂肪组织中的表达量最高(P<0.01)。相关性分析结果显示,PID1mRNA的表达量与藏鸡胸肌的IMF含量存在显著相关(P<0.05)。结果提示,PID1基因可能是影响藏鸡IMF沉积的候选基因。
- 聂晓庆林亚秋徐亚欧赵燕英吕明左璐璐张小玉李想
- 关键词：藏鸡克隆肌内脂肪
- 泸宁鸡和米易鸡MSTN基因多态性及其与生长性状的关联性被引量：5
- 2015年
- 为探明泸宁鸡、米易鸡肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因多态性与生长性状的关联性,采用PCR-SSCP法对MSTN基因的多态性进行检测,同时对泸宁鸡、米易鸡的主要生长性状进行测定,并对MSTN基因多态性与生长性状的关联性进行分析。结果表明:MSTN基因外显子1中有2 100bp(C/T)和2 109bp(C/T)2个SNPs位点,未引起氨基酸变异,为同义突变,表现出CT、TT(2 100bp)和CC、CT、TT(2 109bp)5种基因型,与心脏重、胫围和屠宰率有相关性;泸宁鸡存在CC、CT和TT 3种单倍型,米易鸡存在CC、TC和TT 3种单倍型。内含子1中有4 295bp(T/C)、4 359bp(T/C)和4 404bp(A/C)3个SNPs位点,表现出CT(4 295bp)、CT(4 359bp)、TT、CT和CC(4 404bp)5种基因型,与腺胃重有显著相关;泸宁鸡存在CCC和TTT 2种单倍型,米易鸡存在CCC、TTC和TTT 3种单倍型。3’非编码区有7 637bp(A/G)和7 725bp(A/G)2个SNPs位点,表现出AG(7 637bp)、AA、AG和GG(7 725bp)4种基因型,与腺胃重、腹脂重和半净膛率具有相关性;泸宁鸡存在AG、GA和GG 3种单倍型。MSTN基因是影响泸宁鸡、米易鸡主要生长性状的主效基因之一,可以作为地方鸡品种选育的候选基因。
- 左斌任冰冰蒋小松熊应龙王康环蒋利刘光伟王海徐亚欧
- 关键词：肌肉生长抑制素PCR-SSCP生长性状单倍型
- 藏鸡PPARα基因克隆与生物信息学分析被引量：4
- 2015年
- 为阐明藏鸡PPARα基因的结构及功能,利用RT-PCR方法对PPARα基因进行克隆,并进行生物信息学分析.结果表明:克隆获得包括完整开放阅读框的藏鸡PPARα基因序列1430 bp,开放阅读框1404 bp,编码468个氨基酸;藏鸡PPARα蛋白分子量为52.23 ku,等电点为5.85,为不稳定酸性蛋白,存在27个磷酸化位点和4个糖基化位点,无信号肽和跨膜螺旋结构.预测其二级结构中α-螺旋占37.61%,β-折叠占16.67%,无规则卷曲比例占45.73%.该研究结果为揭示PPARα在藏鸡脂代谢中的作用奠定了基础.
- 林森徐亚欧林亚秋吕明廖红海李倩朱江江郑玉才王永
- 关键词：藏鸡PPARΑ克隆生物信息学分析
- 米易鸡ADSL基因第2和第9外显子多态性与肌苷酸含量的关联被引量：7
- 2015年
- 为了检测米易鸡ADSL基因第2、第9外显子的单核苷酸多态性并分析该多态性与胸肌肌苷酸含量的关联性,以四川省优质地方鸡种米易鸡为研究对象,采用高效液相色谱测定米易鸡胸肌肌肉肌苷酸的含量,并运用测序技术测定了ADSL基因第2、第9外显子的单核苷酸多态性。结果表明:ADSL基因在外显子2(A3713G、C3797T),外显子9(C10191T)处出现3个SNP位点,变异引起相应的氨基酸均为同义变异,第2外显子A3713G位点的基因型为AA、GG、AG型;C3797T位点的基因型为CC、CT、TT型;第9外显子的C10191T位点的基因型为CC、CT型。经独立性检验,ADSL基因A3713G、C10191T位点变异处于Hardy-Weinberg平衡状态;应用最小二乘法对基因型与肌苷酸含量进行分析,说明ADSL第9外显子C10191T SNP位点与IMP含量存在显著相关性(P<0.05),CT型个体的胸肌肌苷酸含量高于CC型个体,初步推测米易鸡中ADSL基因第9外显子C10151T SNP位点CT型为优势基因型。
- 石浩徐亚欧梅寒王海刘红丽左斌聂晓庆胡卫民
- 关键词：肉质风味外显子2
- 泸宁鸡MyoG基因的克隆及组织表达差异分析被引量：4
- 2015年
- 为了研究MyoG基因在鸡生长发育与肉质形成中的作用,试验以泸宁鸡为研究对象,采用RT-PCR技术克隆MyoG基因序列,并利用生物信息学的方法对其理化性质、氨基酸同源性等进行预测和分析,同时采用半定量方法检测MyoG基因在泸宁鸡不同组织中的表达水平。结果表明：泸宁鸡MyoG基因序列长度为741bp,其中开放阅读框（ORF）长度为684 bp,编码227个氨基酸,具有碱性螺旋-环-螺旋结构（bHLH）,与哺乳动物的同源性为70%~71%,与原鸡、火鸡、绿头鸭、游隼的同源性为91%~99%。组织表达谱结果表明,MyoG基因在泸宁鸡腿肌、胸肌、肝脏、肾脏、脑、脾脏、心脏中均有表达,在腿肌、胸肌、心脏中表达水平较高,在肝脏、肾脏和脑中表达水平较低,说明Myo G基因的表达主要集中于肌肉组织。
- 梅寒徐亚欧吕明张明刘红丽左斌石浩聂晓庆林亚秋
- 关键词：MYOG基因基因克隆
- 藏鸡THRSP基因的克隆及生物信息学分析被引量：1
- 2015年
- 对藏鸡THRSP基因进行克隆、序列测定及生物信息学分析.结果表明:获得的藏鸡THRSP基因核苷酸序列为428 bp(Gen Bank登陆号:KT153607),在50-258 bp处存在1个Cp G岛,ORF长度为390 bp,编码129个氨基酸,其中Leu所占比例为10.9%.THRSP蛋白分子量为14.18 ku,等电点(p I)为4.61,属于不稳定酸性核蛋白,存在8个磷酸化位点和5个O糖基化位点.预测其二级结构中α螺旋占51.2%,β折叠占3.1%,无规则卷曲占45.7%.同源性分析结果表明:藏鸡与原鸡THRSP基因核苷酸及预测的氨基酸序列同源性为100%,两者亲缘关系最近.
- 聂晓庆徐亚欧吕明左璐璐李想林亚秋
- 关键词：藏鸡基因克隆生物信息学分析
- 藏鸡A-FABP基因和H-FABP基因的克隆及生物学信息分析
- 2015年
- 以藏鸡为研究对象,根据NCBI上登录的原鸡A-FABP和H-FABP基因序列设计引物,利用RT-PCR方法克隆藏鸡A-FABP和H-FABP基因的CDS区,并进行生物信息学分析.结果表明:藏鸡A-FABP和H-FABP基因的ORF分别为399 bp、402 bp,编码132、133个氨基酸;A-FABP和H-FABP分子量分别为14.91ku、14.84ku,等电点分别为6.34、5.92,均为亲水蛋白,无信号肽和跨膜结构.磷酸化位点分别有9、6个,O糖基化位点分别有10、5个;藏鸡A-FABP和H-FABP的氨基酸序列与原鸡的同源性最高,分别为99%、100%,在鸟类动物中序列比较保守.
- 梅寒王强徐亚欧吕明左璐璐聂晓庆林亚秋
- 关键词：藏鸡A-FABP基因H-FABP基因克隆
- 泸宁鸡肌肉硫胺素沉积规律研究被引量：2
- 2015年
- 以四川省优质地方鸡种泸宁鸡为素材,分别从不同时期(81、119、154、210日龄)的200只鸡中随机选取8公8母,采用高效液相色谱法测定不同组织、日龄、性别肌肉中硫胺素的含量。结果显示,公母鸡腿肌硫胺素含量极显著高于胸肌(P<0.01);公母鸡胸肌、腿肌硫胺素含量均在119日龄达到最高;随着日龄的增加,胸肌与腿肌硫胺素含量先上升后下降;胸肌硫胺素含量119日龄与81日龄、210日龄差异显著(P<0.05),其余各日龄间差异不显著(P>0.05);腿肌硫胺素含量各日龄间差异均显著(P<0.05)。硫胺素含量与屠宰性状相关性分析结果显示,119日龄胸肌硫胺素含量与胸肌重呈极显著相关(P<0.01),腿肌硫胺素含量与腹脂重呈极显著相关(P<0.01)、与腿肌重呈显著相关(P<0.05)。
- 聂晓庆徐亚欧阳明华陆岩冰王培王海梅寒刘红丽左斌石浩林亚秋
- 关键词：屠宰性状相关系数
- 笼养和放养条件下优质肉鸡屠宰性能及肉质性状比较分析被引量：9
- 2013年
- 选择四川大恒家禽育种有限公司培育的S07系(经过连续4个世代选育)1日龄公鸡400只,笼养育雏至5周龄末开始笼养和林下放养分组饲养,不同分组采用相同的饲喂方案,10周龄末和22周龄末开展屠宰试验及肉质测定分析,比较两种饲养条件下优质肉鸡的屠宰性能和肉质风味。结果显示:笼养组活体重、屠体重、腹脂率极显著高于放养组(P<0.01),全净膛率和半净膛率显著高于放养组(P<0.05),而屠宰率、腿肌率和胸肌率均无显著性差异;笼养组鸡肉肌内脂肪含量、肌纤维密度极显著高于放养组(P<0.01),肌苷酸含量差异不显著,肌内脂肪含量、肌苷酸含量随饲养日龄增加而增加,但饲养后期肌内脂肪沉积速度高于肌苷酸。
- 杨朝武杜华锐蒋小松江容娥邱莫寒李晴云李雯张增荣宋小燕余春林胡陈明刘岚姜小雨
- 关键词：优质肉鸡放养鸡屠宰性能肉质性状
