国家科技重大专项(2011ZX09307-002-03)
- 作品数:8 被引量:24H指数:2
- 相关作者:郭跃伟李建华贾睿郭卫斌李洪林更多>>
- 相关机构:华东理工大学中国科学院第二军医大学更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 中药组成分资源和实验数据库研究被引量:1
- 2018年
- 目前已有的中药数据库缺乏中药组成分资源间的有效关联和实验支持。为此,针对植物类中药组成分,设计了一个面向组成分的资源和实验数据库。首先抽取关键的资源和实验数据,将其分为资源数据、实验能力数据和实验数据;然后定义各类数据内的实体以及实体间的关系,构建资源和实验统一数据模型;最后基于此模型实现了基于Web的中药组成分资源和实验数据库。测试实验表明,该数据库能有效地管理中药组成分资源和支持基于相关资源的实验。
- 李建华李建华郑建丽石泽智范蜜李洪林
- 关键词:中药数据建模
- 基于动态规划的实时立体匹配算法被引量:1
- 2013年
- 立体匹配通过计算和标识匹配图像的视差图来获得图像的深度信息,一般计算量大,无法满足实时性要求。本文聚焦立体匹配的匹配代价聚集和视差计算环节,在动态规划方法的基础上,提出了一种实时的立体匹配算法。根据连续性约束,提出了基于自适应形状窗口的快速匹配代价聚集算法,加速了臂长和匹配代价聚集的计算效率;利用边缘检测技术获得图像边界信息,修改动态规划的转移方程,使得边界像素可以在整个视差空间中选择视差值,降低边界处匹配视差的误匹配率。实验结果表明:通过结合上述两个步骤的改进算法,可以获得满足实时性要求、高质量的匹配视差图,整体的匹配准确率较高。
- 何高奇杨宇倪佳金祎岳文辉
- 关键词:动态规划视差
- 中国南海多棘软珊瑚的化学成分和生物活性研究被引量:1
- 2013年
- 目的研究中国南海多棘软珊瑚的化学成分。方法综合利用各种层析方法分离和纯化化合物,并利用光谱学和理化性质来鉴定化合物结构。结果从中分离得到10个化合物,分别鉴定为(3E,7E,11Z)-dola-bella-3,7,12-triene(1)、Cembrene A(2)、(1R,2E,4R,7E,11E)-cembra-2,7,11-triene-4-o1(3)、(1R,3S,4S,7E,11E)-3,4-epoxycembra-7,11,15-triene(4)、epoxynephthenol acetate(5)、pregnan-1,20-dien-3-one(6)、pregnan-1,4,20-trien-3-one(7)、pregnan-4,20-dien-3-one(8)、cholest-4-en-3-one(9)、methyl 3-oxochola-4,22-dien-24-oate(10)。结论化合物1是1个新的天然产物,化合物1,2,9,10都是首次从该属软珊瑚中分离得到。
- 贾睿冯林音严小红郭跃伟
- 关键词:化学成分生物活性
- Axinyssa属海绵的次生代谢产物及生物活性研究进展被引量:3
- 2013年
- Axinyssa属海绵分布十分广泛,含有丰富的结构新颖的次级代谢产物。这些物质具有多种生物活性,如细胞毒、抗菌、抗病毒、防附着等。本文对Axinyssa属海绵的化学成分与生物活性研究进行综述,以期为海洋天然产物的研究与开发提供参考。
- 李玉芬梁林富刘海利梁敬钰郭跃伟
- 关键词:次生代谢产物生物活性
- 两种中国南海海绵的化学成分和生物活性研究被引量:2
- 2013年
- 本文对采自中国南海的两种海绵(Petrosia sp.和Haliclona sp.)进行了系统的化学成分研究,综合利用各种层析技术(硅胶柱层析、凝胶柱层析)从中分离纯化出14个化合物,并利用波谱技术(IR、UV、NMR)对其结构进行了鉴定。从石海绵(Petrosia sp.)中分离的化合物为:3-isocyanotheonellin(1)、theonellin isothiocyanate(2)、theonellin amine(3)、theonellin formamide(4)和邻苯二甲酸二异丁酯(5);从蜂海绵(Haliclona sp.)中分离的化合物为:renierol(6)、isoquinolinequinones mimosamycin(7)、胆甾醇(8)、麦角甾醇(9)、(24R)-ergosta-7,22-diene-3β,5β,6β-triol(10)、5α,8α-epidioxycholest-6-en-3β-ol(11)、胸苷(12)、胞苷(13)、鲨烯(14)及邻苯二甲酸二异丁酯(5)。在对化合物进行广泛的生物活性筛选时发现:化合物6能有效抑制黄嘌呤氧化酶。化合物1~7,9~10,14是首次从该两种海绵中分离得到。
- 贾睿郭跃伟黄才国
- 关键词:海绵化学成分生物活性黄嘌呤氧化酶
- 改进的硅各向异性腐蚀GPU并行模拟被引量:1
- 2013年
- 硅各向异性腐蚀过程复杂,采用元胞自动机模拟硅各向异性腐蚀非常耗时。为了加速腐蚀模拟过程,研究了基于图形处理器(GPU)进行硅的各向异性腐蚀模拟。针对串行算法直接并行化方法存在加速效率低等问题,提出了一个改进的并行模拟方法。该方法增加了并行部分的负载,减少了内存管理的开销,从而提高了加速性能。实验证明该方法能够获得较理想的加速比。
- 陈劲源李建华郭卫斌
- 关键词:各向异性腐蚀元胞自动机图形处理器并行计算
- 基于信誉的新药发现平台信任机制被引量:1
- 2015年
- 针对新药研发需要跨地域、跨学科合作的特点,建立了一个面向天然产物的新药发现平台。为了促进平台上各参与方进行联合研发,进而提高新药研发效率和成功率,需要支持参与方相互间进行可信度的评估,并在合作方间建立可靠的信任关系。本文将基于信誉的信任机制引入到新药发现平台中,通过收集各研发主体相互间的评价信息,综合考虑了节点能力、在系统中的参与度、时间因素,计算节点在整个网络中的全局信誉及节点间的局部信誉。最后,对所提出信任机制的有效性和抗攻击能力进行了实验验证,结果表明,该信任机制能够有效应用于新药联合研发中。
- 范蜜李建华郭卫斌李洪林
- 关键词:信任机制药物发现
- 网络生物学在中医药研究中的应用被引量:14
- 2018年
- 随着人类基因组计划的完成,人们逐渐认识到生物系统的功能是通过基因、蛋白以及小分子之间的网络式相互作用完成的,同时发现复杂疾病往往是由于多个基因表达紊乱导致生物学过程失衡而产生的,这些促使了"多靶点"药物发现理念的兴起。中医药诊治疾病的特点是整体观和辨证论治;从分子水平上看,中药方剂具有多成分、多靶点的特点,从而可望为多靶点药物的开发提供借鉴。该文在6个方面阐述网络生物学在中医药研究中的应用,以期对中医药现代化研究提供一定参考。
- 田赛赛杨健赵静张卫东
- 关键词:复杂疾病中医药多靶点药物整体观辨证论治