陕西省科学技术研究发展计划项目(2012K16-12-03)
- 作品数：9 被引量：21H指数：3
- 相关作者：孙养信安翠红陈宝宝范锁平霍丽霞更多>>
- 相关机构：陕西省疾病预防控制中心中国疾病预防控制中心传染病预防控制所西安交通大学更多>>
- 发文基金：陕西省科学技术研究发展计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 陕西省洛渭三角洲地区黄鼠染色体核型分析被引量：1
- 2014年
- 目的探究陕西省境内洛河与渭河交汇的三角洲地区黄鼠的染色体数目,为分类鉴定提供依据。方法采用骨髓细胞直接制备染色体的方法,经制片后镜检。结果共观察2只黄鼠标本的47个细胞,其中染色体数目为2n=38的细胞有45个,占观察总数的95.74%。结论陕西省境内洛河与渭河交汇的三角洲地区黄鼠应为阿拉善黄鼠。
- 孙养信陈宝宝卢银让安翠红霍丽霞
- 关键词：阿拉善黄鼠染色体核型
- 陕西省黄鼠的遗传学特征分析被引量：1
- 2017年
- 目的明确分布于陕西省的黄鼠的遗传学特征。方法测定COI、Cyt-b基因序列,与内蒙古科右中旗、正镶白旗达乌尔黄鼠、宁夏海原县阿拉善黄鼠同类基因序列进行比对,分析遗传距离,构建系统发育NJ树。结果陕西省定边县黄鼠COI基因序列与宁夏阿拉善黄鼠的遗传距离≤0.5%,与内蒙达乌尔黄鼠遗传距离在7.9%~9.3%之间,Cyt-b基因序列与宁夏阿拉善黄鼠的遗传距离为≤2.2%,与内蒙达乌尔黄鼠遗传距离在8.9%~11.2%之间。基于COI和Cyt-b基因的NJ系统树可见所有样本序列形成两个高支持度的单一分支,陕西定边县黄鼠与宁夏阿拉善黄鼠聚为一类,两者与内蒙达乌尔黄鼠形成两个独立分支,基于COI基因的NJ系统树显示陕西各地样本聚为一类。结论陕西省的黄鼠应为阿拉善黄鼠。
- 安翠红陈宝宝范锁平孙养信吕文鲁亮
- 关键词：黄鼠DNA条形码COI基因阿拉善黄鼠达乌尔黄鼠
- 用DNA条形码技术鉴定阿拉善黄鼠和达乌尔黄鼠被引量：8
- 2014年
- 目的 探索阿拉善黄鼠和达乌尔黄鼠的分类鉴定方法。方法 运用DNA条形码技术测定两地黄鼠的线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ）基因序列,分析遗传距离,构建系统发育NJ树。结果 11份阿拉善黄鼠的种内遗传距离〈2%,4份达乌尔黄鼠的种内遗传距离〈1%,两地黄鼠的遗传距离介于8%~9%之间,同时,NJ树将两地黄鼠分成2个独立分支。结论 阿拉善黄鼠为独立物种。DNA条形码技术可用于黄鼠种类鉴定。
- 陈宝宝孙养信安翠红霍丽霞范锁平
- 关键词：DNA条形码阿拉善黄鼠达乌尔黄鼠
- 陕西省鼠疫自然疫源地新纪录鼠种的鉴定被引量：2
- 2012年
- 目的对陕西省鼠疫疫源地定边县鼠疫监测中新纪录鼠种进行分类鉴定。方法运用形态学方法及DNA条形码技术进行鉴定分析。结果体长120～140mm,体重41.75～71.58g,颅全长<32mm,尾长超过体长1/3,全身灰褐色,腹面沙黄色;线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基基因序列与其他地区东方田鼠标本种内遗传距离最大为1%。结论定边县鼠疫疫区鄂尔多斯高原荒漠草原南部边缘地带盐碱滩地中捕获的田鼠标本,经形态鉴定及DNA条形码比对确定为东方田鼠。首次在陕西省定边县鼠疫自然疫源地记录东方田鼠,为进一步在该地区进行病媒、鼠疫及相关疾病监测提供了基础依据。
- 安翠红陈宝宝范锁平孙养信李伟华鲁亮李贵昌
- 关键词：鼠疫疫源地东方田鼠
- DNA条形码技术在鼠疫疫区啮齿动物残体鉴定中的应用被引量：8
- 2014年
- 目的 应用DNA条形码技术对陕西省鼠疫疫区啮齿动物残体进行宿主分类鉴定,分析DNA条形码技术鉴定方法的可行性.方法 收集外形经形态学鉴定的7个鼠种8个不同部位62份残体样本,提取组织中DNA,经PCR、电泳、测序及结果比对等步骤,分析线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基（COI）基因序列.将COI基因序列利用美国国家生物技术信息中心（NCBI）运行BLAST程序进行序列同源性比较;利用邻接（NJ）法构建COI基因序列的NJ系统树.结果 除3份毛发外,足部、尾巴、皮毛、肌肉、肋骨、耳朵、眼球均扩增出COI基因,扩增产物片段的大小与预期片段的大小相近（700 bp）,且条带单一.DNA测序获得了59份残体标本的COI基因,其中长爪沙鼠、黑线仓鼠、子午沙鼠、三趾跳鼠、小毛足鼠、褐家鼠、五趾跳鼠序列同源性比较显示,COI基因与对应宿主所对应的基因均具有高度的同源性（99.0％,98.1％,99.8％,98.9％,99.5％,99.1％,98.3％）.NJ法显示,59份残体标本的COI基因构建出7个序列的NJ系统树,同鼠种不同标本聚为一类.结论 DNA条形码技术能够对鼠疫疫区啮齿动物残体进行物种分类鉴定,鉴定结果可靠.
- 安翠红陈宝宝孙养信范锁平霍丽霞
- 关键词：DNA条形码
- 陕西地区黄鼠分类地位的研究被引量：2
- 2015年
- 目的明确陕西地区黄鼠的分类地位。方法用形态学方法比对分析;用DNA条形码技术测定COI基因序列,分析遗传距离,构建系统发育NJ树;用骨髓细胞直接制备染色体,经制片后镜检进行核型分析。结果陕西黄鼠尾长占体长1/3左右;上齿列长与齿隙长之比为1∶0.96;听泡长占听泡宽的120%;眶间宽占颅全长的21%。DNA条形码技术检测5地黄鼠样本相似度在97.8%以上;NJ系统树可见所有样本形成两个高支持度的单一分支。染色体数目2n=38的细胞占87.23%。结论陕西地区黄鼠为阿拉善黄鼠。
- 孙养信陈宝宝安翠红范锁平霍丽霞卢银让
- 关键词：DNA条形码COI基因黄鼠阿拉善黄鼠达乌尔黄鼠
- DNA条形码技术在陕西省鼠形动物鉴定中的应用被引量：2
- 2020年
- 目的探究应用DNA条形码技术进行分子生物学鉴定的可行性,弥补形态学鉴定缺陷。方法结合鼠疫监测工作,使用样方法、5 m夹笼法、夹夜法采集鼠形动物标本,所有标本形态学初步鉴定后基于线粒体细胞色素C氧化酶I亚基基因(COI基因)进行分子鉴定,计算遗传距离,构建系统发育树。结果获得709只鼠形动物的COI基因序列,隶属于3目10科24属38种。COI基因序列显示种内遗传距离在3.6%以内,平均为1.4%,种间遗传距离大于5.6%,种间遗传距离显著大于种内遗传距离,属间、科间遗传距离界限不明显,对多只鼠形动物形态学鉴定结果进行了纠正。系统发育树显示同种个体聚为高支持度的单一分支,发现索氏仓鼠和中国仓鼠2个隐存种。结论DNA条形码技术可对鼠形动物进行有效的鉴定,但因数据库的不完善,仍需将传统的分类学鉴定方法和现代分子生物学鉴定方法结合,以保证鉴定结果的准确性。
- 陈宝宝孙养信范锁平吕文聂守民李胜振安翠红
- 关键词：DNA条形码鼠形动物COI基因
- DNA条形码技术在陕西省鼠疫疫区宿主动物鉴定中的应用被引量：7
- 2014年
- 目的 探讨DNA条形码技术在鼠疫疫区宿主动物鉴定中的应用,并建立陕西省鼠疫疫区宿主动物DNA条形码数据库.方法 运用DNA条形码技术检测陕西省定边县鼠疫疫区3目6科12属14种139只宿主动物以及7个鼠种8个不同部位的62份残体标本线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基基因序列.结果 种内遗传距离≤2％,种间遗传距离为8.9％～ 15.1％;邻接法系统树能区分14个不同物种的类群;采集的残体标本能检测到目的基因并用于鉴定;研究中还纠正了既往定边县鼠疫疫区黄鼠命名.结论 DNA条形码技术能弥补形态学鉴定的不足,可用于鼠疫疫区宿主动物及残体标本的分类鉴定.
- 安翠红孙养信陈宝宝范锁平霍丽霞佘建军吕文
- 关键词：DNA条形码
- DNA条形码技术在黑线仓鼠分类研究中的应用被引量：2
- 2016年
- 目的运用DNA条形码技术对陕西省境内黑线仓鼠标本进行种别鉴定。方法在陕西省陕北地区的定边、靖边县和关中地区的大荔县，采集65份黑线仓鼠标本（定边县58份、靖边县2份、大荔县5份），基于线粒体细胞色素C氧化酶I亚基（COI）基因进行序列分析，计算遗传距离，邻接法（NJ）构建系统发育树。结果定边县2份黑线仓鼠样本（13．16、13．21）与定边县其他56份样本的遗传距离为912％～10．0％，而56份样本与靖边县黑线仓鼠样本的遗传距离≤1％，与大荔县黑线仓鼠样本的遗传距离为7．2％～813％；靖边、大荔县内部样本的遗传距离≤l％。NJ系统树中，3个县黑线仓鼠样本分成两个高置信度的大分支，定边县2份样本（13．16、13-21）聚为一类，其余样本单独成支；定边县其余56份样本与靖边县样本在一个小分支上，大荔样本占据另一小分支。结论陕西省陕北、关中地区存在3种黑线仓鼠亚种，定边县有两种，大荔县为另一亚种。
- 陈宝宝安翠红孙养信范锁平霍丽霞吕文佘建军
- 关键词：黑线仓鼠DNA条形码
