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宁夏地区2008年柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析被引量：19: 2010年; 目的研究宁夏地区2008年引起手足口病（HFMD）暴发的柯萨奇病毒A组16型（CVA16）的基因特征.方法对宁夏地区2008年HFMD患者临床标本中分离到的CVA16,采用反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）进行VP1编码区基因扩增,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析.根据VP1区核苷酸序列与国内其他省份以及国际报道的CVA16株序列（来源于基因库）构建基因亲缘关系树.结果共分离到70株CVA16,其在VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为90.8%～100.0%和98.9%～100.0%.亲缘进化树显示全部CVA16株可分为A和B两个基因型,B基因型又可分为B1和B2两个基因亚型.宁夏地区CVA16全部属于B1基因亚型,同时包含B1a和B1b两条进化分支,提示存在两大传播链.结论宁夏地区分离的CVA16株与国内其他地区CVA16株类似,有B1a和B1b两个进化分支在共同循环,且与周边国家和地区流行的CVA16在基因亲缘关系和流行时间关系上都很接近,存在共同进化和循环.; 王东艳陈慧严冬梅张勇安军静马江涛祝双利马学旻安洪秋许文波; 关键词：手足口病柯萨奇病毒A组16型

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“十一五”国家科技支撑计划(2008BAI56B00)