国家自然科学基金(30471579)
- 作品数：5 被引量：8H指数：1
- 相关作者：林治华王远强王槐亮吴玉章龙海霞更多>>
- 相关机构：重庆工学院第三军医大学成都中医药大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金重庆市自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”更多>>
- 相关领域：理学医药卫生农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 鼠Ⅲ型肝炎病毒H-2K^K限制性CTL表位的初步鉴定
- 2010年
- 目的预测和初步鉴定鼠Ⅲ型肝炎病毒(MHV-3)的CTL表位,为基于慢性肝炎病毒抗原表位的免疫治疗奠定理论基础。方法利用超基序、量化基序及人工神经网络方案相结合预测MHV-3 S蛋白的H-2K^K限制性CTL表位;用分子模拟对候选表位肽做进一步筛选;人工合成相关待测表位肽,利用T2-K^K细胞株测定各肽与H-2K^K分子的结合力。结果结合超基序、量化基序、人工神经网络预测结果及分子模拟结果,预测出了4条候选表位肽。MHC亲和力实验表明,在候选的4条表位肽中,IEPYNGVI(141-148)、YELSGYTV(306-313)与H-2K^K呈中等亲和力结合,荧光系数分别为1.25及1.04。结论表位预测的结果与亲和力分析结果一致性较好,两者联合应用初步认为IEPYNGVI(141-148)及YELSGYTV(306-313)为MHV-3 S蛋白H-2K^K限制性CTL表位的可能性最大,为下一步体内鉴定及基于小鼠肝炎病毒抗原表位的免疫治疗奠定基础。
- 龙海霞程晓明王远强林勇倪兵朱波吴玉章林治华
- 关键词：MHV-3CTL表位
- 基于经验打分函数估算CTL表位肽的亲和性
- 2005年
- 王槐亮仲兆明李诚沈硕林治华
- 关键词：CTL打分函数主要组织相容性复合物亲和性MHC杀伤
- 肿瘤血管内皮抗原TEM8的HLA-2.1限制性低亲和性CTL表位预测及改造分析
- 2005年
- 目的 初步筛选肿瘤血管内皮标志物8(tumorendothelialmarker 8,TEM 8)HLA A2 1限制性低亲和性CTL表位,并预测修饰后的表位与HLA A2 1之间亲和性的变化。方法 采用超基序、3D QSAR、蛋白酶解预测等相结合的办法筛选HLA A2 1限制性低亲和性CTL表位,并通过氨基酸置换适当修饰,最后对部分候选的多肽进行分子动力学模拟。结果 筛选出8个低亲和性CTL候选表位,经修饰后的表位与HLA A2 1之间的亲和性均有不同程度的提高。结论 初步预测和修饰的表位系列可为下一步实验提供了依据。
- 阮志华吴玉章支轶王惠明唐艳林治华吕燕波
- 关键词：CTL表位
- 生物多糖的研究进展被引量：8
- 2008年
- 对多糖的研究进展进行了综合论述,包括多糖的结构研究,提取、分离纯化、定性定量方法,以及在增强免疫、抗肿瘤、抗病毒、抑菌抗炎、抗衰老、清热利胆、保护生殖细胞等方面重要生物活性的研究进展,并对应用前景进行了展望.
- 张万秋朱大勇林治华
- 关键词：多糖生物活性
- HLA-A^＊0201限制性CTL表位肽分子力场分析
- 2007年
- 运用比较相似性指数分析(CoMISA)方法研究了203个HLA-A*0201限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的关系,另外30个表位九肽作为预测集用于检验模型的预测能力.得到构效关系模型结果q2=0.548,r2=0.963,F=553.4,SD=0.154.在CoMSIA计算中,当引入疏水场时,三维构效关系模型能得到明显改善.通过该三维构效关系模型,可较精确地估算预测集中30个CTL表位肽与HLA-A*0201间的亲和力(r2pred=0.532,SD=0.454).通过分析分子场等值面图在空间的分布,可以观察到表位肽分子周围的立体及疏水特征对表位肽H与A-A*0201间结合亲和力的影响,从而为进一步对CTL表位肽进行结构改造,并基于此进行治疗性疫苗分子设计提供理论基础.
- 林治华王槐亮李杰龙海霞万谨王远强
- 关键词：表位
