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艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项(2008ZX10002-017)
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
相关作者:
康晓楠
李杨
杨蓉
刘银坤
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相关机构:
同济大学附属东方医院
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发文基金:
上海市浦江人才计划项目
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艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项
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相关领域:
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崔杰峰
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1篇
2010
共
1
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应用SELDI-TOF-MS筛检肝癌血清特异相关候选蛋白的研究
被引量:1
2010年
目的筛查潜在的小分子量低丰度的HCC血清相关候选蛋白,为肝癌复杂病理机制的全面阐明、理想早期诊断标志物的发现提供新思路。方法分别收集81例伴有HBV感染和肝硬化背景的HCC患者血清,43例慢性乙型肝炎和36例肝硬化患者血清,采用弱阳离子交换蛋白芯片(WCX2)介质结合SELDI-TOF-MS对患者血清蛋白谱进行检测,并通过BiomarkerWizard软件对生成的蛋白指纹峰分别进行差异归类比较,然后采用消减差异分析确定HCC特异相关候选蛋白。标本检测前,对芯片检测系统的重复性进行分析。结果同一标本同一芯片内强度CV为17.46%,m/z平均CV为0.024%,不同芯片间强度CV为17.74%,m/z平均CV为0.024%。将信噪比大于5,且超过20%标本具有的蛋白峰认定为有意义峰,在2000~30000m/z范围内,共有128个蛋白指纹峰被确认。HCC与肝硬化患者血清蛋白指纹峰的差异比较分析显示,87个差异蛋白指纹峰有统计学意义(P〈0.05),其中强度差异在2倍以上的蛋白指纹峰有45个,在HCC患者血清中2倍上调的15个,2倍下调的30个。从HCC与慢性乙型肝炎血清蛋白指纹峰的差异分析发现,差异有统计学意义的蛋白指纹峰52个(P〈0.05),其中强度相差2倍以上的蛋白指纹峰有9个,HCC患者血清中2倍上调的2个,2倍下调的7个。从肝硬化与慢性乙型肝炎患者血清蛋白指纹峰的差异比较分析发现,差异有统计学意义的蛋白指纹峰79个(P〈0.05),其中强度相差2倍以上的蛋白指纹峰有28个,在肝硬化患者血清中2倍上调的17个,慢性乙型肝炎患者血清中2倍上调的11个。经消减差异分析筛查,确定在HCC患者血清下调表达的5个公共差异蛋白(2870、3941、2688、3165、5483m/z)及在肝硬化和HCC血清均上调表达的2个公共差异蛋白(3588、2017m/z),但蛋白2017m/z在HCC与健康人比较的本所
崔杰峰
杨蓉
刘银坤
康晓楠
黄成
孙瑞霞
李杨
关键词:
生物学标记
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