国家自然科学基金(31040083) 作品数:4 被引量:11 H指数:2 相关作者: 肖调义 刘巧林 许宝红 钟蕾 苏建明 更多>> 相关机构: 湖南农业大学 中南林业科技大学 澳大利亚国立大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 湖南省科技厅攻关项目 湖南省科技计划项目 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 更多>>
大鲵2个Sox基因HMG-box的克隆及分析 被引量:2 2012年 为探明Sox基因在物种进化中的保守性及其性别分型,以大鲵雌、雄个体为材料,参照Sox基因HMG-box保守区的序列,设计简并引物扩增,两因子均在雌、雄个体内得到217 bp PCR扩增产物,不存在性别差异。将二者编码的氨基酸序列与NCBI中其他物种Sox基因编码的氨基酸序列进行比对,其中一个基因与人、斑马鱼、家鼠、鸡、热带爪蟾、扬子鳄Sox11基因的同源性均为90%,另一个基因与罗非鱼、鸭嘴兽、家鼠、红鳍东方鲀、斑马鱼、鸡、人、非洲爪蟾和大鲵Sox14基因的同源性均为90%,故根据大鲵的学名,将这2个基因分别命名为adSox11和adSox14c。adSox11和adSox14c在大鲵精巢、卵巢、肾脏和心脏中均有不同程度表达,而在胃和肝脏中几乎不表达。 许宝红 肖调义 肖真明 苏建明 刘巧林 陈开健 王冬武 徐永福关键词:SOX基因 三角帆蚌细胞色素P450基因的克隆与表达分析 被引量:5 2012年 CYP是一类以血红素为辅基的末端加氧酶,广泛存在于人、动物、植物和微生物之中,参与许多外源性物质(药物、毒物和环境污染物质等)和内源性物质(激素、脂肪酸等)的代谢,在碳源同化、激素合成、外源物质降解和致癌物质消除等方面发挥重要作用, 肖调义 刘巧林 郭小泽 章怀云 崔树良 许宝红 钟蕾关键词:细胞色素P450 CDNA克隆 半定量RT-PCR 三角帆蚌 大鲵Dmrt2基因cDNA的克隆与表达分析 被引量:1 2012年 Dmrt2是参与性腺发育最古老的发育基因家族Dmrt家族成员之一,在维持胚胎组织的正常发育、精子的发生、神经系统和感觉器官发育等方面起重要作用。目前在哺乳动物人类、鸟类红原鸡以及水生动物青鳉中都克隆到Dmrt家族成员并证明其与性腺和生长发育的密切相关性。研究采用RACE方法克隆了大鲵Dmrt2基因全长cDNA序列共2 026 bp,开放阅读框长1 581 bp,5′非编码区长58 bp,3′非编码区长387 bp,基因序列提交GenBank的登录号为FJ859987。该基因编码蛋白含526个氨基酸,依生物信息学方法预测该氨基酸为非跨膜蛋白,无信号肽,定位在细胞质内,无分泌蛋白。CDD数据库分析该ORF框翻译的氨基酸,在93~146位含DM保守结构域(c102557)的两个成员pfam00751和smart003010,与哺乳类人mab-3、鸟类红原鸡Dmrt2、两栖类非洲爪蟾Dmrt2和水生类鲐mab-3 DM结构域存在I(异亮氨酸)、R(精氨酸)、M(甲硫氨酸)、T(苏氨酸)、C(半胱氨酸)5个氨基酸的变异;系统进化树分析表明:大鲵Dmrt2与以上四物种首先聚类,据此推测Dmrt基因在进化上高度保守,DM结构域上5个氨基酸的变异对蛋白功能的发挥可能无重要影响。实时荧光定量组织差异表达显示,Dmrt2基因在大鲵的精巢和肌肉组织中高表达,预示该基因可能在性腺发育和生长发育方面起重要作用。 许宝红 肖真明 肖调义 陈开健 刘巧林 周伟 刘敏 姚一彬关键词:实时荧光定量PCR 三角帆蚌精氨酸酶基因的cDNA克隆与组织表达分析 被引量:4 2011年 精氨酸酶(Arginase,Arg)是生物体尿素循环当中一种标志性的酶类,它不但与生物体许多疾病相关,而且是目前用于治疗肿瘤和癌症的一种重要的工具酶。根据三角帆蚌消减杂交cDNA文库获得的EST序列,运用cDNA末端快速扩增(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术获得三角帆蚌精氨酸酶基因的全长cDNA序列。生物信息学方法分析表明精氨酸酶基因cDNA序列长1720 bp,开放阅读框(65—1072)1008 bp,编码335个氨基酸,5′端非编码区为64 bp,3′端非编码区为648 bp,软件推测其编码蛋白相对分子量为36.81 kD。研究采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)方法分析该基因在不同组织中的表达规律,结果表明,该基因在肝脏、胃、肠、鳃、心脏、外套膜、斧足共7个组织中都有表达,但主要集中在肝脏、胃和肠消化器官中表达。这可能说明低等的无脊椎动物三角帆蚌的精氨酸酶兼具有Ⅰ型和Ⅱ型精氨酸酶的特征和功能,既可以参与尿素循环,又可以在生理和病理过程中发挥重要作用,但还需进一步验证。 刘巧林 许宝红 肖调义 刘敏 钟蕾 苏建明关键词:三角帆蚌 精氨酸酶 RACE 三角帆蚌细胞色素P450基因的克隆与表达分析 根据三角帆蚌(Hyriopsis cumingi)消减杂交cDNA文库获得的EST序列,运用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)获得三角帆蚌细胞色素P450(... 肖调义 刘巧林 郭小泽 章怀云 崔树良 许宝红 钟蕾关键词:细胞色素P450 CDNA克隆 半定量RT-PCR 三角帆蚌 文献传递