中国水产科学研究院水产种质资源与养殖技术重点开放实验室开放基金(2006A003)
- 作品数：3 被引量：13H指数：2
- 相关作者：喻达辉郭奕惠黄桂菊李莉好朱克诚更多>>
- 相关机构：中国水产科学研究院南海水产研究所中国水产科学研究院更多>>
- 发文基金：中国水产科学研究院水产种质资源与养殖技术重点开放实验室开放基金番禺区科技计划项目广东省科技计划工业攻关项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 中国主要养殖罗非鱼亲缘关系的COI序列分析被引量：11
- 2009年
- 对中国主要养殖的尼罗、奥利亚、莫桑比克、杂交种尼奥（尼罗×奥利亚）、奥尼（奥利亚×尼罗）和红罗非鱼（莫桑比克×尼罗）的线粒体COI基因的部分序列进行了PCR扩增、克隆和测序分析，探讨罗非鱼种间亲缘关系和种类鉴别标记。6种罗非鱼中大部分个体均获得长586-708bp的基因序列。其碱基组成GC含量为47．7％。序列分析表明，莫桑比克罗非鱼2个个体分为2个单倍型，单倍型之间的碱基差异为1个碱基，其余几种罗非鱼均只有1个单倍型。其中，尼罗和尼奥、奥利亚和奥尼的单倍型序列相同，但种间核苷酸序列差异达4．3％-7．7％。根据聚类分析结果可将这6个（杂）种分为3个组：尼罗-尼奥，红罗-莫桑比克和奥利亚-奥尼罗非鱼组。其中前2组亲缘关系较近，与后1组亲缘关系较远。表明C01可作为罗非鱼种类判别和亲缘关系分析的重要标记。
- 郭奕惠喻达辉黄桂菊李莉好符云叶卫
- 关键词：罗非鱼COI基因亲缘关系
- 细胞核rDNA序列分析5种罗非鱼的亲缘关系被引量：3
- 2009年
- [目的]探索五种罗非鱼的亲缘关系。[方法]从尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼、杂交种尼奥罗非鱼、莫桑比克罗非鱼和红罗非鱼基因组中提取DNA,通过PCR扩增其ITS1基因序列及18S、5.8S部分序列并进行序列分析。[结果]扩增片段大小约700 bp,测序结果显示获得的序列包括完整的ITS1区以及18S和5.8S部分序列。序列长度变异主要在ITS1区,18S和5.8S片段的序列长度没有发生变化。罗非鱼5个种的ITS1序列的碱基组成差别不大。从UPGMA聚类结果上看,尼罗罗非鱼与尼奥罗非鱼聚为一支;莫桑比克罗非鱼与奥利亚罗非鱼聚为一支,红罗非鱼再与莫-奥聚合。[结论]五种罗非鱼的ITS1及18S、5.8S部分序列分析结果表明,尼罗和尼奥罗非鱼亲缘关系较近,奥利亚与莫桑比克罗非鱼亲缘关系较近,红罗非鱼可能与奥利亚和莫桑比克罗非鱼有一定的亲缘关系。
- 郭奕惠喻达辉黄桂菊符云叶卫
- 关键词：罗非鱼亲缘关系
- 红罗非鱼MyoD基因克隆及序列分析
- 2014年
- MyoD基因是MRFs家族中的一员,能调控肌肉细胞活性和增殖,在肌肉形成过程中起正调控作用。采用同源基因克隆和RACE方法获得红罗非鱼Myo D基因的c DNA序列。开放阅读框长903 bp,编码300个氨基酸,其中第1-114个氨基酸为碱性结构(Basic domain),第109-165个氨基酸为螺旋-环-螺旋结构(Helix-Loop-Helix domain),第199-213个氨基酸为周期蛋白依赖性蛋白激酶4(CDK4)结合区域,第233-249为Helix III结构,无信号肽序列。Myo D蛋白的二级结构为螺旋-环-螺旋二聚体。基于Myo D构建的鱼类系统进化树显示红罗非鱼,尼罗罗非鱼和奥利亚罗非鱼聚为一支。
- 郭奕惠范嗣刚黄桂菊朱克诚喻达辉
- 关键词：克隆罗非鱼
