国家教育部博士点基金(20102223120003)
- 作品数:5 被引量:23H指数:3
- 相关作者:刘淑艳李玉张傲李广赵凤云更多>>
- 相关机构:吉林农业大学延边大学教育部更多>>
- 发文基金:国家教育部博士点基金国家自然科学基金吉林省教育厅科研项目更多>>
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- 煤绒菌延长因子的引物设计及PCR反应体系优化被引量:3
- 2013年
- 自主设计了煤绒菌(Fuligo septica)延长因子序列扩增引物,成功地扩增出煤绒菌延长因子序列,其片段长约为800 bp。同时对PCR反应体系进行了优化。在25μL的最优PCR反应体系中,引物量为2.0μL,TaqDNA聚合酶为0.2μL,退火温度为54℃。在此反应体系和退火温度条件下所得条带单一、清晰,可应用于煤绒菌相关的分子系统学研究。
- 刘淑艳张傲赵凤云
- 关键词:聚合酶链式反应
- 菌物DNA条形码技术原理与操作被引量:7
- 2012年
- DNA条形码技术是通过对1个较短目的基因的DNA序列进行分析从而进行物种鉴定的方法,它通过对1个或多个相关基因进行大范围的扫描,进而鉴定未知物种或者发现新种。当传统的分类学受到阻碍时,这种技术可以发挥其优势。相对于其他生物,菌物的生活史独特而复杂,这就使得对其进行的形态学鉴定要受到菌物自身生长发育时期的限制。国内外科学家对寻找适合于大多数菌物的标准DNA条码进行过探索,但还没有找到满足全部特征的基因片段。文中对DNA条形码技术的概念、原理依据、操作步骤和优缺点方面进行了介绍,并对DNA条形码技术在我国菌物研究方面的应用前景进行了展望。
- 刘淑艳张傲李玉
- 关键词:菌物
- 菌物DNA条形码技术的研究进展被引量:9
- 2012年
- DNA条形码技术是通过对一个DNA片段的分析比对,进而对物种进行鉴定的方法。研究的基因片段可以是1个或多个,进而完成物种识别和鉴定或者发现新物种。该项技术的优势在于整个鉴定过程不受研究对象不同发育阶段的影响。由于菌物具有独特而复杂的生活史,因此对菌物的鉴定工作相对较困难。世界上许多科学家都尝试过寻找适合于大多数菌物的标准DNA条码,但还没有找到能满足条件的基因片段。笔者对DNA条形码技术的发展历史、目的基因片段的筛选和研究进展等方面进行了综述,并讨论了DNA条形码技术存在的问题和今后研究的方向。
- 刘淑艳张傲李玉
- 关键词:菌物DNA条形码分子鉴定
- 菌物基因组测定研究进展被引量:5
- 2014年
- 菌物基因组因其相对较小、基因结构较简单、容易被测序和注释、细胞周期短、易于遗传操作等优点而成为真核生物基因组研究的最佳模式生物。文中综述了菌物基因组的结构特点,整理了菌物基因组测序相关信息,并简单描述了重要模式菌物的基因组概况,为进一步开展菌物基因组研究提供重要数据信息。
- 刘淑艳李广李玉
- 关键词:基因组黏菌子囊菌担子菌卵菌
- 延长因子作为煤绒菌属DNA条形码基因的评价
- 煤绒菌属(Fuligo)是绒泡菌目中常见属之一,也是黏菌中的一个重要的属。该属的分布极广,但是其属下各种自身的变异很大,这就给形态学鉴定带来了很大麻烦。因此,设计一套快速有效的分子生物学快速鉴定体系将成为此后进一步进行的...
- 张傲刘淑艳
- 关键词:DNA条形码
- 盘基网柄菌肌动蛋白的生物信息学分析被引量:1
- 2015年
- 盘基网柄菌Dictyostelium discoideum是目前黏菌中研究最清楚的模式生物,其捕食过程与肌动蛋白的多聚化密切相关。为探讨盘基网柄菌肌动蛋白的序列特征,本研究利用生物信息学方法分析了盘基网柄菌32条肌动蛋白的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction)和可能含有的保守基序。结果表明:盘基网柄菌32条肌动蛋白与其他蛋白存在一组复杂相互作用关系和5组比较简单的相互作用关系;利用MEME SUITE分别分析盘基网柄菌32条肌动蛋白序列的保守基序和与actin17呈最佳匹配的21种生物肌动蛋白的保守基序,结果共获得6个保守基序,即motif1,motif2,motif3,Motif1,Motif2,Motif3。其中motif1,Motif1,Motif3为本研究新发现的保守基序,这3个保守基序可定位于Profilin-actin-VASP202–244(PDB ID:3CHW)三维结构的重要位置。以上结果表明actin3,actin10,actin14,actin15,actin17,actin31可能为盘基网柄菌比较重要的肌动蛋白;motif1,Motif1,Motif3可能是盘基网柄菌肌动蛋白在进化中重要的保守基序。
- 李广刘淑艳李玉陈艳秋
- 关键词:黏菌蛋白相互作用
- 煤绒菌孢子萌发和有饲培养的研究
- 黏菌是真核生物中一个独立的类群,它兼有动物和真菌的特征.黏菌的培养方法主要包括基物培养、无饲培养和有饲培养.从20世纪初期开始,一些国内外学者就对黏菌的培养做了大量的研究工作.增加了很多新种和新记录种.煤绒菌Fuligo...
- 武雪明张傲符晓英徐成伟李玉刘淑艳
- 关键词:黏菌生活史