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多胸椎蒙古羊hoxc8 exon-1甲基化浓度的免疫沉淀实时定量PCR分子标记: ＜正＞引言蒙古羊中多脊椎个体比例达到25%,其胸椎和腰椎比普通羊多1～2枚,因而体型大,身躯长,具有优良的肉质特性和出色的产肉性能。虽然人们早已知道蒙古羊的这个解剖特征,但一直没有发现其形成的原因; 赵静陈琦张立岭马月辉; 关键词：DNA甲基化; 文献传递

绵羊HOXC8基因的DNA甲基化研究被引量：4: 2011年; 本研究测定了蒙古羊和德国美利奴肉羊,道塞特肉羊,澳洲美利奴细毛羊Hoxc8全基因序列。蒙古羊与这3个外国品种的Hoxc8基因,只有内含子存在8个碱基差异。但是exon-1的甲基化模式存在极大差异。蒙古羊14枚胸椎个体的甲基化程度高于13枚胸椎个体。蒙古羊甲基化程度普遍高于外国品种。蒙古羊特有的可遗传甲基化位点共有6个(5,69,1,62,6,27),国外品种在这些位置不发生甲基化。并且,这6个位点的甲基化程度高低可能决定了第14枚胸椎的长短和骨化程度。; 赵静张立岭陈琦巴图; 关键词：绵羊 CPG

多脊椎蒙古羊Hoxc8 exon-1甲基化分析被引量：11: 2009年; 研究旨在探索多脊椎蒙古羊多脊椎性状与Hoxc8 exon-1的甲基化比例是否可以成为多脊椎蒙古羊早期选种的DNA分子标记。克隆多脊椎蒙古羊(14个胸椎)和正常蒙古羊(13个胸椎)的Hoxc8 exon-1,超声波破碎基因组DNA并变性。用5-甲基胞嘧啶抗体做选择性免疫反应,经抗体结合磁珠免疫沉淀,分离纯化甲基化DNA。设计2对多脊椎蒙古羊Hoxc8exon-1引物进行实时定量PCR,分别分析免疫沉淀后的甲基化DNA浓度。引物P2扩增,6只多脊椎蒙古羊和4只正常蒙古羊样本校正后的甲基化DNA浓度分别为11.50%、11.00%、5.28%、4.49%、2.89%、2.41%和1.20%、0.60%、0.35%、0.03%,两实验组差异显著(P<0.05)。引物P1扩增,两实验组甲基化DNA浓度差异不显著(P>0.05)。P2引物扩增Hoxc8exon-1的甲基化DNA浓度可以作为多脊椎蒙古羊早期选种的DNA分子标记。; 陈琦赵静张立岭马月辉; 关键词：DNA甲基化

利用交错式热不对称PCR法获取多脊椎蒙古羊Hoxc8启动子序列的研究被引量：2: 2012年; [目的]探索获得蒙古羊Hoxc8基因启动子序列的方法。[方法]尝试利用交错式热不对称PCR法,获得蒙古羊Hoxc8启动子序列。[结果]通过PCR获得的序列不理想,测序结果无法与已知序列相匹配。虽然利用交错式热不对称PCR法未获得蒙古羊的Hoxc8的启动子序列,但可为今后的相关研究提供借鉴。[结论]该研究为进一步分析蒙古羊Hoxc8的启动子区域的甲基化状态奠定了基础。; 陈琦赵静张立岭马月辉; 关键词：启动子

多脊椎蒙古羊Hoxc8 exon-1和exon-2的序列分析被引量：2: 2011年; 参考牛的Hoxc8基因序列设计引物,扩增正常蒙古羊(胸椎数13)和多脊椎蒙古羊(胸椎数14)Hoxc8的exon-1和exon-2基因,对得到的序列进行生物信息学分析。结果表明,经序列比对二者的DNA序列,除两侧个别碱基有差异外,中间序列完全一致。蒙古羊Hoxc8的exon-1和exon-2序列分别与其他物种进行同源性比对,蒙古羊Hoxc8 exon-1与人、小鼠、大鼠、犬的同源性达到96%以上,与斑马鱼的同源性为75.8%;exon-2与大猩猩、犬、人、小鼠、大鼠的同源性达到91%以上,与斑马鱼的同源性为74%。; 陈琦赵静张立岭马月辉

蒙古羊Hoxd11基因CpG位点分布特征分析被引量：3: 2010年; 蒙古羊的Hoxd11基因全长1 772 bp。其中exon-1为778 bp,exon-2为236 bp,内含子为758 bp(Gen-Bank Accession No.GU059862)。Hoxd11 exon-1序列共有120个CpG,其中位于密码第1～2位的CpG共8个,全都编码精氨酸。位于密码第2～3位的CpG共47个,占所有CpG的39.17%(47/120),分别编码5个丝氨酸,18个脯氨酸,2个苏氨酸,22个丙氨酸。Hoxd11 exon-1的CpG数量明显高于第2外显子(12个)。Hoxd11exon-1序列中的高密度CpG,提示这个序列有可能是甲基化的高发区。这对于进一步分析这个基因对调控腰椎发育的作用,具有重要意义。; 赵静张立岭巴图; 关键词：CPG 蒙古羊外显子

小型猪微卫星标记多重PCR体系的建立与应用被引量：5: 2009年; 目的建立实验用小型猪微卫星标记的多重PCR体系和进行实验猪群的遗传监测。方法利用3种不同荧光标记的微卫星引物结合ABI3700遗传分析仪测序的方法,通过筛选和优化反应条件,建立可用于实验用小型猪遗传质量控制的稳定的多重PCR反应体系。在此基础上进一步检测实验用小型猪近交群体的遗传变异以验证建立体系的效率。结果筛选出了2组理想的组合:组合1包括SW742、S0228和S0218座位,复性温度58℃和56℃;组合2包括S0155、SW902和S0227三个座位,复性温度为60℃和58℃。组合内不同座位标记不同的荧光染料。还以此检测了实验用小型猪群体中的遗传变异。结论初步建立了中国三种实验用小型猪微卫星标记检测的多重PCR体系,为快速、大通量、准确的小型猪遗传监测提供了初步的技术基础。; 公维华张宁波程佳月杨述林黄宏刚冯书堂王爱德甘世祥李奎; 关键词：微卫星多重PCR

重亚硫酸盐测序确定多胸椎蒙古羊hoxc8 exon-1 CpG岛甲基化位置与密度: ＜正＞引言蒙古羊中多脊椎个体的胸椎和腰椎变异具有基因组印记（Genomic Imprinting）遗传特征,CpG岛中胞嘧啶的甲基化是印记所必需的。亚硫酸盐基因组测序（Bisulfite Sequencing）PCR专一...; 张立岭陈琦赵静马月辉; 关键词：CPG岛; 文献传递

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