国家高技术研究发展计划(2012AA02A203)
- 作品数:5 被引量:18H指数:2
- 相关作者:于颖彦刘炳亚傅国辉朱正纲计骏更多>>
- 相关机构:上海交通大学医学院附属瑞金医院上海交通大学内蒙古医科大学更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划国家自然科学基金上海市科委国际合作基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 深低温冻存胃癌样本的核酸与蛋白质质量控制研究被引量:8
- 2016年
- 目的:探索上海市瑞金医院低温冻存0~10年胃癌样本的核酸与蛋白质质量。方法:随机抽取2003年至2014年间库存手术切除胃癌标本24对(共48份)。1%琼脂糖凝胶电泳检测DNA与RNA纯度及完整性,同时增加了RIN值评估法检测RNA完整性;BCA法检测样本蛋白质浓度,考马斯亮蓝法测定蛋白质分子完整性。结果:将组织标本按冻存年限分成四组(〈2年、3~5年、6~8年和〉9年),各组之间DNA完整性差异无统计学意义(P〉0.05),正常胃组织的DNA降解程度比胃癌组织高(P=0.023);四组之间的RIN值检测显示,冻存6年以上组的RIN值有明显下降(P=0.018);各组间的蛋白质浓度无显著性差异,考马斯亮蓝法测定蛋白质分子条带完整性存在显著性差异。冻存〉9年组仅出现少量低分子量条带(平均36.5kD),冻存6~8年组尚有中等分子量(平均65.63kD)条带,冻存3~5年组有高分子量(平均127.5kD)条带,冻存短于2年组仍可见大分子量(平均160kD)条带。结论:长期低温冻存对DNA影响最小,超过5年组RNA和大分子量蛋白质降解较多,但中小分子量蛋白质保存完好。
- 张佳年计骏刘炳亚朱正纲傅国辉于颖彦
- 关键词:生物样本胃癌核酸蛋白质
- 神经示踪技术在感觉神经化组织工程骨评价中的应用被引量:2
- 2015年
- 目的 探讨应用神经示踪技术观察感觉神经植入组织工程骨后感觉神经束的生长情况. 方法 将12只新西兰白兔随机分为A组(预植入隐神经的组织工程组)和B组(不植入隐神经的组织工程组)(n=6).每只兔制造右侧股骨长为15 mm的骨缺损并以钢板固定后,植入组织工程骨.A组切断隐神经远端后植入侧槽中,B组只切断隐神经而不植入侧槽中.术后15d行第2次手术,注射荧光神经示踪剂(Dil),并以14d为存活期.存活期后(术后1个月)取下组织工程骨,制作硬组织切片后以荧光显微镜进行定性分析.另将12只新西兰白兔制作感觉神经束植入模型后,分别于2、4、8、12周取材观察神经纤维的生长情况. 结果 模型制作后1个月:A组可以观察到由神经运输来的Dil荧光,B组中则无荧光.预植入组织工程骨侧槽中的感觉神经在1个月可以生长入组织工程骨的孔内.预植入的感觉神经在2周时未观察到荧光,4、8、12周可以观察到荧光.预植入的感觉神经纤维在2~4周长入组织工程骨中,8、12周时仍然存在. 结论 神经示踪技术可以被用来研究预植入感觉神经的组织工程骨中神经束的生长情况.植入组织工程骨后的感觉神经束生长到了组织工程骨的孔道中.
- 吴岩欧阳宏伟毕龙裴国献张慧
- 关键词:神经示踪
- 小分子非编码RNA与RNA激活
- 2013年
- 在人类基因转录组序列中,除了编码蛋白质的RNA序列之外,还存在许多小片段的非编码RNA(non.codingRNA)序列。以往曾认为这些序列是基因剪切编辑中产物,其功能意义并不清晰。随着对人类基因组研究以及基因功能研究的深入,对小分子非编码RNA(以下简称小RNA)的功能认识正在逐步加深。
- 潘胜利于颖彦
- 关键词:非编码RNARNA序列人类基因组编码蛋白质基因功能转录组
- 我国胃肠道肿瘤生物样本库建设与发展15年回顾被引量:7
- 2016年
- 肿瘤生物样本库是转化医学研究与精准医学研究的重要基础设施,在欧美等国家倍受重视。纵观我国胃肠道肿瘤生物样本库建设与发展走过的15年历程,在样本库建设形式上经历了最早的项目驱动性科室建设模式,发展到区域生物样本库网络融合模式,再到即将纳入国家重大基础研究设施建设规划模式。在样本库建设内容上,从最初仅收集患者外周血与肿瘤组织模式,至患者体液(血液与尿液)、组织及临床病理学信息同步收集与信息化管理模式。高质量的肿瘤生物样本是支撑我国胃肠道肿瘤研究领域开展国内或者国际重大合作研究项目的材料与信息资源保障。本文详尽介绍了我国胃肠道肿瘤生物样本库建设15年来的经验与存在问题,尤其对研究人员关心的长期低温冻存肿瘤组织生物样本的质量控制问题进行了介绍。
- 于颖彦
- 关键词:胃肠道肿瘤生物样本库
- 提取线粒体DNA方法的比较及较纯线粒体基因获取方法的确立被引量:2
- 2015年
- 目的:对2种常用的线粒体DNA提取方法进行比较,分析提取物中核DNA的存在情况,同时建立新检测方法降低线粒体假基因干扰。方法:以仅在核DNA中存在的基因β-actin作为核DNA存在的标定基因,通过PCR方法扩增线粒体DNA上的一段基因MTND5-2,并以β-actin做参比,比较常用的2种提取线粒体DNA方法的优劣,即碱法Ⅰ(先提取完整线粒体后从中获得线粒体DNA)和碱法Ⅱ(根据线粒体DNA与核DNA的结构差异,从中获得双链环状的线粒体DNA)。结果:2种线粒体DNA提取方法并不能获得仅含线粒体DNA的纯提取物,碱法Ⅰ获得的线粒体DNA纯度相对较高;以碱法Ⅰ提取物为模板进行PCR,可获得更多较纯的线粒体目的基因。结论:碱法Ⅰ较碱法Ⅱ可获得更纯的线粒体来源的目的基因;新建方法可获得较纯的线粒体基因,且是一种简单、方便、经济的方法。
- 李恋沈晓玲包丽丽邢蕊李文梅崔建涛吕有勇
- 关键词:线粒体假基因