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国家自然科学基金(31072007)

作品数:10 被引量:15H指数:3
相关作者:杨秀芹李朋王秋实王金奎韩丽鑫更多>>
相关机构:东北农业大学黑龙江省农业科学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金黑龙江省教育厅科学技术研究项目中国博士后科学基金更多>>
相关领域:农业科学生物学理学更多>>

文献类型

  • 10篇中文期刊文章

领域

  • 9篇农业科学
  • 2篇生物学
  • 1篇理学

主题

  • 3篇多态
  • 3篇多态性
  • 3篇克隆
  • 3篇基因
  • 2篇PCR
  • 2篇SNPS
  • 1篇单核
  • 1篇单核苷酸
  • 1篇单核苷酸多态
  • 1篇单核苷酸多态...
  • 1篇单链
  • 1篇单链构象
  • 1篇单链构象多态...
  • 1篇单增李斯特菌
  • 1篇蛋白
  • 1篇点突变
  • 1篇定点突变
  • 1篇多态性分析
  • 1篇真核
  • 1篇真核表达

机构

  • 9篇东北农业大学
  • 3篇黑龙江省农业...

作者

  • 9篇杨秀芹
  • 3篇李朋
  • 3篇王秋实
  • 2篇陈月婵
  • 2篇张姣
  • 2篇韩丽鑫
  • 2篇牛艳春
  • 2篇王金奎
  • 1篇武春艳
  • 1篇田亚光
  • 1篇许岩
  • 1篇赵燕丽
  • 1篇张立钢
  • 1篇郑鹏
  • 1篇朱蒙
  • 1篇李海涛
  • 1篇汪亮
  • 1篇黄贺
  • 1篇翟春媛
  • 1篇邵美丽

传媒

  • 6篇东北农业大学...
  • 1篇黑龙江畜牧兽...
  • 1篇遗传
  • 1篇畜牧兽医学报
  • 1篇Journa...

年份

  • 1篇2017
  • 1篇2016
  • 2篇2015
  • 1篇2014
  • 2篇2013
  • 2篇2012
  • 1篇2010
10 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
猪TLR4基因2个突变位点的PCR-SSCP分析被引量:3
2012年
为了研究Toll样受体4(TLR4)的多态性与动物对相关病原的免疫力的相关性,试验选择北京黑猪、长白猪、野猪、杜洛克猪、大白猪、民猪6个中外猪种,利用PCR-SSCP和克隆测序方法对TLR4基因第3外显子1 824位点的G/A和3'UTR 208位点的T/C多态进行群体遗传学分析。结果表明:1 824位点北京黑猪与野猪、民猪、杜洛克猪、长白猪和大白猪的基因型分布存在显著差异(P<0.05);3'UTR 208位点基因型分布在猪种间存在极显著差异(P<0.01)。
陈月婵翟春媛刘娣杨秀芹
猪PILRA基因克隆及变异剪接体鉴定被引量:2
2015年
Ⅱ型成对免疫球蛋白样受体(Paired immunoglobulin-like type 2 receptors,PILRs)是免疫球蛋白超家族成员之一,包括α和β两个亚型。PILRα在机体抵抗病原体入侵的免疫反应中发挥着重要作用,但目前尚未见关于猪PILRα的报道。为了分析其在猪抗病育种中的作用,本文克隆了猪PILRα编码基因(PILRA)并鉴定变异剪接体,利用实时荧光定量PCR方法构建其组织表达谱和诱导表达谱。结果表明,成功克隆了猪PILRA基因的3个变异剪接体V1~V3(Gen Bank登录号:KJ143679~81),预测的蛋白质多肽链分别长271 aa、254 aa和283 aa,且都具有免疫球蛋白结构域。各变异剪接体均在脾脏中表达量最高,肝脏、肺脏次之,在心脏、肾脏、胃、肌肉、淋巴、大肠、小肠和膀胱等组织中表达量较低或检测不到。Poly(I:C)能显著诱导变异剪接体V1的表达,但几乎不影响V2、V3的表达。研究结果为进一步揭示PILRA在猪抗病育种中的作用提供了基础。
李利族韩丽鑫王金奎汪亮刘娣杨秀芹
关键词:克隆
猪PILRB基因的克隆及多态性分析
2015年
Ⅱ型配对免疫球蛋白样受体(Paired immunoglobulin-like type 2 receptors,PILRs)是近年发现的免疫球蛋白超家族成员之一,含有两个亚型,PILRα和PILRβ。在机体天然免疫反应中发挥重要作用,目前猪PILRB基因基因组序列尚未得到克隆、测序。研究利用PCR方法克隆猪PILRB基因部分基因组序列并分析该区域多态性。结果表明,获得猪PILRB基因序列长1 127 bp,包含完整外显子1、内含子1、外显子2、内含子2、外显子3和部分内含子3。猪PILRB基因内含子1和内含子2为研究首次克隆,全长分别为9和314 bp。在该区域共检测到15个SNPs,其中6个为中度多态位点,共形成5种单倍体型,ACACCG为优势单倍体型。研究结果为进一步揭示这些SNPs对PILRβ功能的影响及其在猪抗病育种中的作用提供基础。
杨秀芹邵思宇李利族王秋实牛艳春张姣
关键词:克隆SNPS
Identification of Toll-like Receptor (TLR) 4 Gene in Wild Boar
2017年
Toll-like receptor (TLR) 4 plays an important role in the innate immune system and has been involved in resistance/ susceptibility to a number of diseases as revealed by studies in human and other domestic animals. Wild boar survives in natural environment without artificial interference and may be different from domestic pig in innate immune system. Here, the complete coding sequence of TLR4 and TLR4A was cloned in wild boar, and two other alternative splicing variants, TLR4B and TLR4C, were obtained. Compared to the counterpart from domestic pig (GcnBank No. AJ628065), there were five SNPs, c.510T〉C, c.960A〉G, c.962A〉G, c.1605T〉G and c.1824A〉G, in the coding sequence of wild boar TLR4A gene. TLR4 gene was expressed in all the tissues from wild boar studied with the most abundance in spleen tissue, and mRNA level was significantly lower in spleen from wild boar than that from Min pig. The allele distribution was significantly different at polymorphic loci c.962G〉A and c.1027C〉A (p〈0.01) between wild boar and Min pig. The results would contribute to understand the innate immune system in wild boar.
Du XinZhuo Jian-shuJing Xiao-yanWang ChaoLiu Ying-ziYang Xiu-qin
关键词:EXPRESSIONPOLYMORPHISM
猪GPR84和MPEG1基因的分子克隆和表达分析被引量:2
2014年
本研究旨在克隆猪GPR84和MPEG1基因的完整编码区,对其进行序列分析,并研究它们的组织表达和诱导表达情况。以民猪为试验材料,应用RT-PCR方法克隆猪GPR84和MPEG1基因并进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR方法构建组织表达谱,分析其在PK15细胞内的poly(I:C)诱导表达情况。结果表明,猪GPR84(GenBank accession No.JX280456)和MPEG1(GenBank accession No.JQ907392)基因编码区全长分别为1 191和2 154bp,预期分别编码396和717个氨基酸残基的蛋白质,与人和牛相应蛋白序列的同源性均在83%以上。猪GPR84和MPEG1基因在11种组织中均有不同程度的表达,其中GPR84基因在肺中表达量最高,MPEG1基因在脾中表达量最高,二者在肌肉中的表达量均最低。在poly(I:C)的诱导下,GPR84基因的表达增强,MPEG1基因的表达则受到抑制。本研究成功地克隆了猪GPR84和MPEG1基因的全长编码区序列,并确定了它们的组织表达和诱导表达情况,为进一步揭示GPR84和MPEG1在抗病育种中的作用提供了基础。
王秋实王秋实武春艳邵思宇李朋朱蒙杨秀芹
关键词:MPEG1克隆
猪原发性心肌症相关蛋白1基因的多态性分析被引量:1
2013年
原发性心肌症相关蛋白1(Cardiomyopathy-associated protein 1,CMYA1)基因是在横纹肌(骨骼肌)上特异表达的基因。猪CMYA1基因被认为是与背膘厚有关的QTL。本研究以猪CMYA1基因上存在的3个错义突变c.1394A>G(p.His465Arg)、c.1751A>G(p.Asp582Gly)和c.3290C>A(p.Thr1097Asp)为研究对象,利用PCR-RFLP方法分析其在大白、丹系长白、法系长白和北京黑猪4个群体中的分布情况。结果表明,在所检测的3个多态位点,各基因型在品种间的分布都存在显著差异(P<0.05);c.1394A>G和c.1751A>G都为中度多态位点(0.25G位点基因型在4个群体中的分布都符合Hardy-Weinberg平衡定律;序列分析表明c.1394A>G和c.1751A>G变异位点紧邻CMYA1蛋白的肌动蛋白结合域,并且c.1751A>G位点在人、猪、狗、牛、猕猴、小鼠等物种中高度保守。研究结果为进一步通过相关性分析揭示CMYA1基因变异与生长和胴体性状的相关性提供依据。
田亚光郑鹏黄贺杨秀芹
猪TLR5基因定点突变表达载体构建被引量:1
2012年
TLR5特异识别细菌鞭毛蛋白,在机体免疫反应中发挥重要作用,人TLR5基因突变能影响蛋白功能并与一些疾病的易感性密切相关。研究采用RT-PCR方法克隆了猪TLR5基因的全长编码区;采用PCR介导的定点突变技术得到该基因137(G/A)和1205(C/T)位点突变的两个变异体;以pcDNA3.1+为载体成功构建野生型(TLR5-WT-pcDNA3.1+)和突变型(TLR5-G137A-pcDNA3.1+和TLR5-C1205T-pcDNA3.1+)真核表达重组质粒。研究结果可为下一步细胞水平上的突变功能分析提供基础。
李海涛陈月婵牛艳春李朋刘娣杨秀芹
关键词:定点突变真核表达载体
肉中两种致病菌的双重PCR检测方法的建立被引量:3
2010年
为了建立肉中单增李斯特菌和金黄色葡萄球菌的双重PCR检测方法,以金黄色葡萄球菌nuc基因和单增李斯特菌hly基因为靶基因设计引物,通过优化退火温度和PCR反应体系,建立这两种菌的双重PCR检测方法,并分析其反应特异性和敏感性。进一步将该方法应用到人工模拟肉样中,并分析其敏感性。结果表明,建立的单增李斯特菌和金黄色葡萄球菌双重PCR检测方法应用于人工模拟肉样中具有较高敏感性,其中金黄色葡萄球菌和单增李斯特菌最低检测限分别为102和103 cfu.mL-1。该方法的建立为食品中多种致病菌的同时检测奠定了基础。
赵燕丽许岩张立钢杨秀芹邵美丽
关键词:金黄色葡萄球菌单增李斯特菌双重PCR
猪TLR4基因单核苷酸多态性对转录的影响被引量:3
2013年
TLR4能识别革兰氏阴性菌脂多糖,并将信号向下游传递,启动天然免疫反应并诱发获得性免疫反应,在机体的防御反应中发挥重要作用。研究利用PCR-RFLP方法对TLR4基因的3个SNPs位点(c.611 T>A、c.962 G>A和c.1027 C>A)进行基因型分析,同时利用荧光定量PCR法检测每个个体TLR4基因的表达量,统计学方法比较不同基因型个体间表达量的差别。发现SNPs c.611 T>A和c.962 G>A显著影响TLR4的转录(P<0.05)。结果表明,SNPs c.611 T>A和c.962 G>A引起的蛋白质合成量变化,影响机体免疫反应。
杨秀芹李朋王秋实
关键词:SNPSMRNA水平
猪miR-101表达特性分析被引量:2
2016年
miRNA是一类长20~25 nt内源性、单链、非编码小分子RNA,通过调控靶基因转录后表达参与机体各项生命活动。人类miR-101是重要疾病相关miRNA,参与维持机体健康、抵御疾病。目前有关猪miR-101研究尚不多见,为确定其在猪抗病毒免疫反应中作用,研究利用stem-loop RT-PCR方法构建猪miR-101组织表达谱和poly(I:C)诱导表达谱。结果表明,猪miR-101在肝脏组织中表达量最高,高浓度poly(I:C)能有效抑制猪miR-101转录表达。为深入阐明miR-101在猪抗病毒免疫反应中作用奠定基础,为培育高抗病性猪品种(系)提供参考。
杨秀芹万洪宇王金奎韩丽鑫杜欣禚建树
关键词:STEMLOOPRT-PCR
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