国家科技支撑计划(2009BADB4B05-3)
- 作品数:1 被引量:0H指数:0
- 相关作者:岳晓娟胡冬梅翟新验田克恭周智更多>>
- 相关机构:中国动物疫病预防控制中心学研究院甘肃农业大学更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目国家科技基础性工作专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 猪繁殖与呼吸综合征病毒Myanmar株全基因序列的测定与遗传变异分析
- 2012年
- 2010年首次从缅甸某发病猪场采集的疑似猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and re-spiratory syndrome,PRRS)病料中分离到一株PRRSV,命名为PRRSV Myanmar株。应用RT-PCR方法分段扩增出Myanmar株的各基因片段,并将扩增产物分别连接到pEASY-T3载体并进行测序。序列测定结果表明,Myanmar株基因组全长15 411bp(不包括PolyA尾),包含10个开放阅读框,5′UTR长189nt,3′UTR长151nt。全基因序列与经典PRRSV VR2332株核苷酸序列的一致性为99.3%,与高致病性PRRSV NVDC-JXA1株核苷酸序列的一致性为89.5%。在非结构蛋白Nsp2区域并未出现特征性的30个氨基酸的缺失,而与欧洲型标准毒株(LV)核苷酸序列的一致性为54.6%。上述结果说明Myanmar株在基因型上属于经典美洲型。同时,遗传进化树分析显示,Myanmar株与PRRSV 01NP1.2株、RespMLV株、BJ-4株及PL97-1株的亲缘关系最近。
- 岳晓娟胡冬梅张倩周智遇秀玲杨仕标翟新验胡永浩田克恭
- 关键词:猪繁殖与呼吸综合征病毒全基因组遗传进化树