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浙江省教育厅科研计划项目(20040899)
作品数:
3
被引量:22
H指数:3
相关作者:
孙雪
吴晓微
周成旭
马斌
汪一冰
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相关机构:
宁波大学
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发文基金:
浙江省教育厅科研计划
宁波市自然科学基金
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相关领域:
生物学
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文献类型
3篇
中文期刊文章
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3篇
生物学
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小球藻
1篇
蛋白核小球藻
1篇
亚基
1篇
氧酶
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叶绿
1篇
叶绿体
1篇
同源性
1篇
内转录间隔区
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球藻
1篇
种间
1篇
种间关系
1篇
转录间隔区
1篇
系统树
1篇
小亚基
1篇
克隆与序列分...
1篇
基因
1篇
加氧酶
1篇
PSBA
1篇
PSBA基因
1篇
RBCL基因
机构
3篇
宁波大学
作者
3篇
孙雪
2篇
吴晓微
1篇
陆开形
1篇
张晓龙
1篇
马斌
1篇
周成旭
1篇
裴鲁青
1篇
李兴文
1篇
汪一冰
传媒
1篇
海洋科学
1篇
水产学报
1篇
水产科学
年份
1篇
2009
2篇
2008
共
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小球藻psbA基因的克隆与序列分析
被引量:8
2008年
psbA基因编码光合系统Ⅱ反应中心的D1蛋白,是叶绿体基因组中一个重要的光调控基因。对小球藻属4个种的6株小球藻psbA基因进行了PCR扩增和测序,并结合GenBank上已有的2条小球藻psbA基因序列,使用MEGA3.1软件对psbA序列进行了遗传距离值的计算和系统发育树的构建。结果显示8株小球藻psbA基因的遗传距离值为0.012~0.167。除了原始小球藻F-2和蛋白核小球藻820分别与蛋白核小球藻F-5、F-9及与普通小球藻Cvq关系极近之外,其他6株小球藻基本上按照种的划分进行聚类,该结果与用小球藻的ITS和rbcL序列分析的结果一致。
吴晓微
孙雪
陆开形
汪一冰
张晓龙
关键词:
小球藻
PSBA
系统树
蛋白核小球藻核酮糖-1,5-二磷酸羧化/加氧酶小亚基部分基因序列的克隆与分析
被引量:9
2008年
以单细胞绿藻蛋白核小球藻(Chlorella pyrenoidosa)(藻株编号为NMBluh015-1)为实验材料,利用几种绿藻中的核酮糖-1,5-二磷酸羧化/加氧酶(Rubisco)的小亚基(rbcS)的保守序列,设计简并引物,克隆到rbcS的一条cDNA(245 bp)和3条DNA序列(其编号为CP1、CP2和CP3,长度依次为1425 bp、810 bp、705 bp)。序列比较结果表明,该蛋白核小球藻rbcS cDNA核苷酸序列与普通小球藻(C.vulgaris)、杜氏藻(Dunaliella tertiolecta)(rbcS1和rbcS2)及蛋白核小球藻"太阳小球藻"株的相似性依次为93%、92%(91%)和90%,而其编码的氨基酸序列与杜氏藻相似性最高(80%);3条rbcS DNA序列与绿藻及高等植物rbcS部分序列表现了较高的同源性,其中2条DNA(CP2和CP3)部分区段同源性很高。实验结果表明扩增得到的cDNA和DNA序列为蛋白核小球藻rbcS基因。
孙雪
马斌
周成旭
关键词:
同源性
小球藻核rDNA ITS与叶绿体rbcL基因序列分析及应用
被引量:6
2009年
用核基因组rDNA的内转录间隔区(ITS)和叶绿体rbcL基因对小球藻属(Chlorella)6株小球藻的种间和种内关系进行了分析。克隆序列与GenBank数据库检索到的相关小球藻序列(ITS和rbcL序列各为15条)一起进行比较分析。结果显示:ITS序列长度在小球藻种内高度保守,在种间变异较大;而rbcL序列长度在种间和种内水平都高度保守。15株小球藻ITS序列间遗传距离在0.000~0.663之间;而15株小球藻rbcL序列间距离在0.000~0.216之间。6株实验藻中原始小球藻F-2与蛋白核小球藻F-5、F-9近似种内关系;蛋白核小球藻820与普通小球藻Cvq亲缘关系极近;椭圆小球藻Ce与其它5株小球藻亲缘关系最远。研究表明将变异程度较高的核ITS序列与相对保守的叶绿体rbcL基因相结合可以用于小球藻系统发生分析和分子鉴定。
孙雪
吴晓微
李兴文
裴鲁青
关键词:
小球藻
内转录间隔区
RBCL基因
种间关系
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