国家自然科学基金(81171530)
- 作品数：4 被引量：12H指数：2
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- 相关机构：军事医学科学院武警总医院北京军区空军司令部更多>>
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- 基于RNA-Seq的羊种布鲁氏菌新转录本与非编码RNA鉴定被引量：9
- 2015年
- 目的对羊种布鲁氏菌的转录本进行测序,鉴定基因组中新的转录本和非编码RNA。方法提取羊布鲁氏菌的总RNA,去除rRNA后连接接头逆转录成cDNA,PCR扩增后进行测序,以羊布鲁氏菌16M的基因组序列为参照对测序得到的reads进行比对作图,通过生物信息学方法进行新转录本和非编码RNA的鉴定。结果测序数据分析显示,reads在基因组上覆盖度较好。与现有注释基因相比,有773个基因的5′或3′端在基因组的原有位置基础上发生了延伸,并发现了16个新的转录本。根据测序结果,共鉴定出241条候选的非编码RNA(sRNA),进一步的RT-PCR验证结果显示,预测的sRNA在体外条件下有表达。结论布鲁氏菌基因组中存在除了预测以外的新的转录本,布鲁氏菌中存在非编码RNA且在不同条件下有差异表达。
- 郭英飞王玉飞龚春丽杨明娟袁久云庄妤冰柯跃华杜昕颖汪舟佳陈泽良
- 关键词：布鲁氏菌RNA-SEQSRNA
- 非编码小RNA分子BSR1350在羊布鲁菌适应环境压力和毒力中的作用
- 2017年
- 【目的】探寻非编码小RNA分子BSR1350在羊布鲁菌适应环境压力和毒力中的作用。【方法】通过RT-PCR检测BSR1350在酸、营养缺乏、氧化应激等模拟巨噬细胞内环境的不同压力条件下的转录情况;采用融合PCR的方法构建BSR1350的缺失突变株,同时构建其回复株;比较布鲁菌野生株16M、BSR1350缺失突变株和过表达株在模拟巨噬细胞内环境条件下以及小鼠体内的生存能力。【结果】BSR1350位于羊布鲁菌16MI号染色体的反义链上,在模拟巨噬细胞内环境的应激条件下表达明显增加。BSR1350缺失后,布鲁菌抵抗高渗、氧化压力、热应激及酸性环境的能力明显下降,小鼠脾脏内的细菌载量显著下降,表明BSR1350与布鲁菌的胞内生存能力和毒力相关。【结论】非编码小RNA BSR1350在羊布鲁菌适应环境压力和毒力中起着重要作用。
- 张薇王玉飞邹德勇崔娟红孙涛郝钦芳
- 关键词：布鲁菌毒力
- 细菌RNA结合蛋白Hfq研究进展被引量：3
- 2015年
- Hfq蛋白是细菌中重要的转录后调控子,参与调节细菌的生长、代谢、压力环境适应能力等多种生命活动,影响细菌的多种生理代谢过程。在致病菌中,Hfq蛋白与细菌的毒力密切相关。Hfq主要通过结合RNA来影响其稳定性,或者是通过辅助非编码小RNA(sRNA)与mRNA结合来调节靶基因的表达。文章对Hfq在致病菌中的作用及寻找Hfq靶标RNA的研究方法进行了综述,以期为Hfq的功能研究奠定基础。
- 郭英飞袁玖云王玉飞崔明全
- 关键词：HFQRNA结合蛋白转录后调控细菌毒力
- 非编码小RNA BSR0602在布鲁菌环境适应能力中的调控作用被引量：1
- 2015年
- BSR0602是位于布鲁菌染色体上的非编码小RNA,在前期研究中我们发现,BSR0602与布鲁菌的胞内生存能力相关.为了进一步研究BSR0602对布鲁菌胞内环境适应能力的调控作用,采用双向电泳技术对布鲁菌野生株16M和BSR0602过表达株的全菌蛋白质谱进行比较分析.结果显示,BSR0602过表达后,布鲁菌转运代谢蛋白和压力适应蛋白的表达发生变化.qRT-PCR和HIS表位标记实验结果进一步证实,BSR0602在转录和翻译水平均影响氧压力适应蛋白Sod A的表达.相关表型实验结果显示,BSR0602过表达株对氧压力更为敏感,证实了BSR0602在布鲁菌适应氧压力中的作用.结果表明,非编码小RNA BSR0602作为布鲁菌的转录后调控因子,可通过调控压力适应蛋白的表达来影响布鲁菌的压力适应能力和胞内生存.
- 袁久云龚春丽庄妤冰雷霜霜陈泽良黄克和王玉飞
- 关键词：布鲁菌双向凝胶电泳转录调控
