江苏省自然科学基金(SBK201021501) 作品数:4 被引量:57 H指数:4 相关作者: 虞德兵 徐善金 杜文兴 于海龙 张剑锋 更多>> 相关机构: 南京农业大学 南京市畜牧家禽科学研究所 更多>> 发文基金: 国家教育部博士点基金 江苏省自然科学基金 江苏省农业科技自主创新基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
基于线粒体COⅠ基因序列分析家鸭系统发育关系 被引量:12 2011年 根据北京鸭线粒体DNA(mtDNA)序列设计引物,对中国9个地方鸭和1个番鸭品种线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)基因序列进行PCR反应和测序,并从起始密码子开始分析了1 520 bp的序列。结果显示:所有家鸭个体在1 517位点出现1个T碱基缺失,番鸭与家鸭的mtDNA COⅠ基因碱基组成相似;9个鸭品种个体共检出11种单倍型,单倍型的多样度为0.856。聚类分析结果显示,所有家鸭品种间的遗传距离为0.001~0.002,种内平均值为0.001;番鸭与家鸭遗传距离为0.003~0.006。基于Kimura-2模型构建的系统发育进化树进行分析,发现所测定的鸭科物种个体大体分为3类:家鸭与栖鸭属的番鸭聚为第1类,应属于鸭亚科;雁属的白额雁、灰雁与天鹅属的黑天鹅聚为第2类,应属于雁亚科;鹊雁与中国骛一起聚为第3类,应属于鹊雁亚科。上述结果表明,基于COⅠ基因条形码,在亚科阶元上,所有鸭科物种分类与以往分类结果是一致的。因此,使用DNA条形码鉴定物种系统发育关系时,需考虑阶元划分标准。 虞德兵 陆应林 徐昊翔 徐善金 熊锴 王伟兰 杜文兴 王林云关键词:DNA条形码 线粒体 鸭AdipoR1基因3′UTR区的扩增及真核表达载体的构建 1引言脂联素在其受体AdiopoR1/2介导下发挥特定的生物学功能,参与胰岛素抗性调控、平衡糖脂代谢,在免疫疾病治疗炎症、预防动脉粥样硬化和心血管疾病等方面发挥不可替代的作用。AdipoR1主要介导球形脂联素,分布在机体... 岳慧洁 虞德兵 侯英萍 林凯 张超 朱佳伟 杨显强 杜文兴关键词:转染 文献传递 PGC-1α的功能与代谢病 被引量:18 2011年 过氧化物酶体增殖活化受体γ辅助活化因子1α(αsubunit of peroxisome proliferators-activated receptor-γcoactivator-1,PGC-1α)是过氧化物酶体增殖活化受体γ辅助活化因子1(PGC-1)的成员之一.PGC-1α是与能量代谢关系密切的1个转录辅助活化因子,在线粒体合成、调节适应性产热、骨骼肌纤维类型转换等过程中发挥重要作用.同时,还参与到糖代谢、脂代谢中,已成为治疗糖尿病、肥胖等代谢疾病的新靶点.近年来还发现,PGC-1α对治疗癌症发生及神经变性疾病有一定作用.本文主要从PGC-1α调节适应性产热、促进线粒体合成、在骨骼肌中调节纤维类型转换及葡萄糖代谢等方面对其生理功能进行阐述,并对PGC-1α与相关代谢疾病的关系进行了总结. 李博 田瑞霞 杨卫景 虞德兵关键词:PGC-1Α 生理功能 代谢疾病 鸭腺苷琥珀酸裂解酶基因序列特征及表达与肌肉肌苷酸含量的相关性分析 被引量:23 2012年 【目的】克隆鸭腺苷琥珀酸裂解酶(adenylosuccinate lyase,ADSL)基因的完整编码区(codingsequences,CDS),对其进行核酸和蛋白序列分析,研究该基因在各品种肌肉组织mRNA表达水平;对该基因mRNA表达水平与肌肉组织肌苷酸(inosine monophosphate acid,IMP)含量进行相关性分析。为揭示中国优良地方鸭种的风味基因结构、研究其生物学功能以及与重要风味物质的关系奠定理论基础。【方法】通过PCR扩增和克隆测序获得鸭ADSL基因部分cDNA序列,运用生物信息学方法分析鸭ADSL基因编码区序列、蛋白结构和进化关系,利用real-time-PCR技术检测鸭肌肉组织中ADSL基因mRNA表达水平,利用高效液相色谱法测定肌肉组织IMP含量。【结果】①鸭ADSL基因CDS全长均为1 380 bp,编码459个氨基酸,与鸡的同源性为94.77%。②ADSL蛋白为偏碱性,有较为强烈的信号肽和细胞内跨膜结构,蛋白二级结构主要由α-螺旋构成。③鸭和鸡首先聚为一类,后与人、鼠等哺乳动物聚为一类,而与两栖、鱼类相聚较远。④ADSL基因表达量品种间差异极显著(P<0.01);各品种内雌性表达量极显著高于雄性(P<0.01);同一性别内胸肌表达量极显著高于腿肌(P<0.01)(樱桃谷鸭除外,为P>0.05)。⑤IMP含量在品种间差异极显著(P<0.01);各品种内雌性含量显著高于雄性(P<0.05);同一性别内胸肌含量显著高于腿肌(P<0.05)。【结论】鸭ADSL基因CDS序列与鸡的同源性极高,在肌肉组织中该基因的表达量及对应IMP含量表现为不同品种、同一品种不同性别、同一性别不同部位间极显著或显著差异,两者并显现出显著正相关。 徐善金 虞德兵 汪峰 何宗亮 张剑锋 于海龙 杜文兴关键词:ADSL 克隆 MRNA表达 肌苷酸 高效液相色谱法 鸭血红素加氧酶-1(HO-1)基因表达及对蛋壳颜色的影响 被引量:4 2012年 以35周龄产绿壳蛋巢湖鸭、产白壳蛋巢湖鸭以及樱桃谷鸭为素材,采集每只鸭的肝脏和输卵管子宫部,提取总RNA进行cDNA反转录,利用实时荧光定量PCR(real-time PCR)方法检测样品中血红素加氧酶(heme oxygen-ase,HO-1)基因的表达水平,分析不同品种、品系间及同一品种不同器官中HO-1mRNA的表达差异。结果显示:不同品种间,HO-1基因在肝脏组织中相对表达量无显著差异(P>0.05),在子宫组织中表达量巢湖鸭极显著高于樱桃谷鸭(P<0.01)。不同品系间,HO-1基因在肝脏组织中相对表达量无显著性差异(P>0.05);巢湖鸭2个品系在子宫中的相对表达量差异不显著,但均显著高于樱桃谷鸭。在同一品种内,HO-1基因在肝脏组织中的相对表达量均极显著高于子宫组织(P<0.01)。 岳慧洁 徐善金 韦小菲 赵文超 虞德兵 杜文兴关键词:血红素加氧酶 蛋壳颜色 实时荧光定量PCR