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上海市科学技术委员会资助项目(09411967900)
作品数:
2
被引量:3
H指数:1
相关作者:
王明贵
徐晓刚
吴湜
叶信予
林东昉
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相关机构:
复旦大学
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发文基金:
上海市科学技术委员会资助项目
国家重点基础研究发展计划
艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项
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复旦大学
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胡付品
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林东昉
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1篇
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新型肠球菌万古霉素耐药基因簇——vanM基因簇
被引量:2
2009年
目的从屎肠球菌临床分离株中克隆一种介导屎肠球菌对万古霉素耐药的新基因簇。方法采用16S rRNA测序对临床株Efm-HS0661进行菌种确认,并行多位点序列分型(MLST);通过药敏试验及接合试验,了解菌株耐药性及其可转移性;通过PCR扩增、步移法测序、限制性内切酶片段克隆获取万古霉素耐药基因及其周边序列,并将获得序列与已知万古霉素耐药基因簇进行比对。结果临床株经16S rRNA测序确认为屎肠球菌,MLST分型属ST78型;该菌株对万古霉素及替考拉宁耐药,且可通过接合试验发生转移;测序获得一6 592bp核苷酸序列,为含6个万古霉素耐药相关基因的基因簇,其基因结构与已知耐药基因簇不同,命名为vanM型基因簇。其中vanM全长1 032bp,其编码蛋白VanM与VanA、VanB、VanD、VanF基因氨基酸序列同源性分别为79.7%、69.7%、66.0%和78.5%。结论从万古霉素耐药屎肠球菌临床株中发现了一种新型万古霉素耐药基因簇———vanM型基因簇。
徐晓刚
吴湜
叶信予
郭燕
林东昉
胡付品
朱德妹
王明贵
关键词:
万古霉素
耐药
基因簇
屎肠球菌
屎肠球菌磷霉素耐药基因的高通量测序筛选
被引量:1
2011年
目的从对磷霉素耐药的屎肠球菌临床分离株中筛选介导屎肠球菌对磷霉素耐药的基因,并验证其作用。方法通过药物敏感测定及接合转移实验,了解磷霉素耐药屎肠球菌的耐药性及其可转移性。通过Solexa高通量测序筛选磷霉索耐药基因,并对该耐药基因进行克隆确认其基因功能。结果屎肠球菌临床株Elm—HS0661对糖肽类抗生素及磷霉索耐药,且可通过接合转移试验发生磷霉素耐药性的转移。Solexa高通量测序及比对筛选获得-2414bp核苷酸序列,含有全长420bp的fosB基因,与已知厂0sB基因氨基酸序列同源性达99.8%。含该基因的DH5α克隆转化子的磷霉素最低抑菌浓度较不含者明显升高。结论Solexa高通量测序技术可用于临床菌株未知耐药基因的快速筛选,质粒介导的磷霉素耐药基因fosB可导致屎肠球菌对磷霉素耐药。
徐晓刚
林东昉
叶信予
吴湜
胡付品
王明贵
关键词:
磷霉素
药物耐受性
肠球菌
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