甘肃省应用技术研究与开发专项计划项目(1105TCYA002)
- 作品数:1 被引量:2H指数:1
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- 兰州市汉族人群促炎症细胞因子及其受体基因多态性的群体遗传学研究被引量:2
- 2013年
- 目的探讨兰州市汉族人群(HCL)促炎症细胞因子及其受体的基因多态性。方法采用聚合酶链式反应-高分辨熔解曲线分析法(PCR-HRM)检测1 000例HCL人群IL1B-511、-31、+3954,IL1RN,IL6-597、-572、-174,IL6R-183,IL6R-exon1,1L6R-exon2,TNFA-238、-308、-857、-863,TNFR1383和TNFR2T676G位点的基因多态性,并进行群体遗传学分析。结果在HCL人群中IL6-174、IL6-597、TNFA-238、TNFA-308、IL1B+3954、TNFA-863、IL6R-exon2以及TNFR1-383位点的次要等位基因频率(MAF)较低(0.03~0.09);IL1RN和TNFRT676G位点的MAF为0.13和0.17;TNFA-857、IL6-572、IL6R-exon1、IL6R-183、IL1B-511和IL1B-31位点的MAF较高(0.28~0.47)。HCL人群细胞因子基因多态性的分布与中国北京汉族人相似,和日本人接近,显著区别于欧洲人群和非洲人群。结论 PCR-HRM技术是一种适合于大样本基因分型的高效、价廉常规化检测方法,本研究获得IL1B-511、IL1B-31、IL1B+3954、IL6-572、IL1B-174、TNFA-238、-308、-857和TNFR、T676G位点的基因频率,可作为公共数据用于疾病关联基因的筛选。
- 阎立新李菲菲郭心灵尤崇革
- 关键词:促炎症细胞因子基因多态性