台州市科技计划项目(061KY53) 作品数:6 被引量:6 H指数:1 相关作者: 刘池波 梁勇 潘春琴 牟思华 张瑾 更多>> 相关机构: 台州市立医院 更多>> 发文基金: 台州市科技计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
应用SELDI-TOF-MS技术分析少精子症患者精浆中的差异表达蛋白 被引量:1 2009年 目的:用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析少精子症患者和正常对照组精浆蛋白质指纹图谱的变化,建立能鉴别少精子症患者和正常对照组精浆标志物的诊断模型。方法:收集33例少精子症和31例正常对照的精浆,用CM10(弱阳离子交换芯片)蛋白质芯片和SELDI-TOF-MS检测蛋白质指纹图谱的表达。用Biomarker Patterns Software分析软件进行数据处理,建立区分少精子症患者与正常对照组精浆中蛋白质指纹图谱差异表达模型,并用此模型对33例少精子症患者及31例正常对照组进行盲法交叉验证。结果:在相对分子质量2000~20000范围内,共检测到185种有差异的蛋白峰,其中23种有统计学意义(P〈0.05)。建立了由3种差异蛋白质组成的少精子症诊断模型,其敏感性为90.9%(30/33),特异性为93.5%(29/31),双盲法验证结果其敏感性为87.9%(29/33),特异性为90.3%(28/31)。结论:用SELDI-TOF-MS技术初步建立的区分少精子症与正常对照精浆蛋白质差异表达模型可以区别少精子症和正常对照。 刘池波 梁勇 潘春琴 张瑾关键词:蛋白质芯片 少精子症 生物标志物 应用SELDI技术检测精浆抗精子抗体阳性不育患者精浆中差异蛋白 2009年 目的探讨用蛋白质芯片技术筛选精浆抗精子抗体阳性不育患者精浆中蛋白质表达谱,寻找精浆中的差异蛋白。方法采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)和CM10蛋白质芯片对30例精浆抗精子抗体阳性不育患者精浆和30例健康人精浆的蛋白质谱图进行了检测,使用PBSⅡ-C型蛋白质芯片阅读机读取数据,获得的结果采用CIPHERGEN公司的Biomarker wizard和Biomarker Patterns System软件分析。结果精浆抗精子抗体阳性不育患者与正常人精浆蛋白质谱相比有12个显著差异蛋白质,其中6个蛋白质在患者精浆中高表达,6个蛋白质在患者精浆中低表达。Biomarker Patterns System软件用12个显著差异蛋白质中的2个标志分子建立精浆抗精子抗体阳性不育患者诊断的分类树模型。检测灵敏度为90%、特异性为93.3%。结论实验证明利用蛋白质组学和生物信息学方法可以从精浆中筛选出精浆抗精子抗体阳性不育患者相关的标志蛋白质,而且蛋白质芯片技术对于发现和筛选精浆中的精浆抗精子抗体阳性不育患者的标志蛋白质是一种有效、快速的工具。 刘池波 潘春琴 梁勇关键词:芯片分析技术 抗精子抗体 应用SELDI技术检测精索静脉曲张患者精浆中的差异表达蛋白 2009年 目的探讨用蛋白质芯片技术筛选精索静脉曲张患者精浆中蛋白质表达谱,寻找差异蛋白。方法采用表面增强激光解离飞行时间质谱技术(surface-enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS),运用CM10蛋白质芯片检测30例精索静脉曲张患者和30例正常对照精浆中蛋白质谱,获得的蛋白质谱采用Biomark-er Wizard软件分析,初步筛选蛋白质峰,结合生物信息学的支持向量机(support vector machines,SVM)方法建立并测试精索静脉曲张患者精浆中的蛋白质指纹图谱。结果在芯片上捕获到163种蛋白质,用质谱仪筛选出精索静脉曲张患者与正常对照组相比的16种差异蛋白,其中有3个蛋存在显著性差异。结论精索静脉曲张患者与健康者精浆中存在较多差异蛋白质,本研究对进一步探索精索静脉曲张的病因及其临床治疗具有重要意义。 刘池波 管涛 梁勇关键词:蛋白芯片 精索静脉曲张 男性不育患者精浆中差异表达蛋白的筛选与鉴定 被引量:4 2009年 目的:初步探讨蛋白质组技术在精浆研究中的应用,建立男性少精、无精症患者及健康者精浆双向凝胶电泳图谱;筛查并鉴定三者间的差异表达蛋白质。方法:采用双向凝胶电泳(2-DE)分离少精症、无精症患者和健康者精浆总蛋白,银染显色,ImageMaster 2D Elite软件分析,从中选取差异表达蛋白质,通过基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定差异表达的蛋白质。结果:获得分辨率较好的精浆双向凝胶电泳图谱;得到5个在少精症、无精症患者与健康者精浆中差异有显著性的蛋白质斑点,进行鉴定,结果表明这些特异蛋白分别为Serpin B6(Placental thrombin inhibitor)(Cytoplasmic antiproteinase)(CAP)(Protease inhibitor6)(PI-6)、Septin-1(LARP)(Serologically defined breast cancer antigen NY-BR-24)、Kallikrein-6 precursor(Protease M)(Neurosin)(Zyme)(SP59)、Hemoglobin beta chain、Beta-defensin 108 precursor(Beta-defensin 8)(DEFB-8)。结论:在少精症、无精症患者与健康者精浆中存在差异表达蛋白质,利用蛋白质组学这一高通量的筛查技术可望从中发现与少精、无精相关的精浆标志物。 潘春琴 刘池波 梁勇 牟思华关键词:不育 男(雄)性 双向凝胶电泳 蛋白芯片技术筛选无精症患者精浆中标志蛋白质 被引量:1 2009年 目的:利用蛋白质芯片和生物信息学方法从无精症患者精浆中筛选标志蛋白质。方法:采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)和IMAC3蛋白质芯片对30例无精症患者精浆和57例健康人精浆的蛋白质谱图进行了检测,使用PBSⅡ-C型蛋白质芯片阅读机读取数据,获得的结果采用CI-PHERGEN公司的Biomarkerwizard和BiomarkerPatternsSystem软件分析。结果:无精症患者与正常人精浆蛋白质谱相比有16个显著差异蛋白质,其中6个蛋白质在患者精浆中高表达,10个蛋白质在患者精浆中低表达。BiomarkerPatternsSystem软件用16个显著差异蛋白质中的3个标志分子建立无精症诊断的分类树模型。检测灵敏度为86.7%(26/30)、特异性为96.5%(55/57)。结论:实验证明利用蛋白质组学和生物信息学方法可以从精浆中筛选出无精症相关的标志蛋白质,而且蛋白质芯片技术对于发现和筛选精浆中的无精症标志蛋白质是一种有效、快速的工具。 牟思华 刘池波 梁勇 潘春琴关键词:芯片分析技术 无精症 蛋白质 SELDI-TOF-MS在男性不育研究中的应用前景 2009年 人类基因组计划已进入功能基因组时代,作为基因功能的直接体现者——蛋白质及其之间的相互作用越来越引起基础医学和临床医学家的关注,正因为如此蛋白质组学(proteomics)研究成了生命科学最重要的焦点之一。为了阐明蛋白质在上述生命现象中的作用和相关机制,设计了许多新的方法技术,如二维电泳、质谱分析、微距阵列等,在一些特定情况下,这些方法虽然显示出各自不同的优点.但同样也存在着难以开展大规模、超微量、高通量、全自动筛选蛋白质等方面的问题,因而设计更全面、同时研究多种蛋白质相互作用的技术.在功能基因组和蛋白组学研究中建立一个更有效的技术平台。已成为本领域中优先关注的问题。 蔡艳群 刘池波 梁勇 潘春琴 牟思华 王海宝关键词:男性不育 蛋白质芯片