国家自然科学基金(60371034) 作品数:22 被引量:76 H指数:4 相关作者: 易东 李辉智 张彦琦 郭波涛 王文昌 更多>> 相关机构: 第三军医大学 西南政法大学 香港城市大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 自动化与计算机技术 电子电信 更多>>
神经网络法在喹诺酮类化合物定量构效关系中的应用 被引量:2 2005年 目的:以神经网络法研究喹诺酮类化合物定量构效关系。方法:利用Matlab软件包构建一个3层BP神经网络,对数据集进行计算,并将结果与线性回归法的计算结果进行比较。结果:神经网络法的误差平方和为0 .3042 ,小于线性回归法,预测的相关系数为0. 86。结论:神经网络法在喹诺酮类化合物定量构效关系研究中获得了比回归法更精密的拟合结果。 郭波涛 黄明辉 柏干荣 杨梦苏 易东关键词:BP神经网络 定量构效关系 MATLAB 核平滑半参数回归模型在重复测量资料中的应用 被引量:4 2007年 目的探讨应用核平滑的半参数模型处理重复测量资料。方法利用核平滑和带约束的最小二乘法估计参数,并采用Bootstrap建立可信区间。结果用Matlab程序应用模拟数据得到相应结果。结论核平滑半参数模型可作为处理重复测量资料的一种方法。 郭波涛 易东 王文昌关键词:半参数模型 从时间序列基因芯片数据中挖掘跨事务关联规则 被引量:1 2008年 目的探讨从时间序列基因芯片数据中发掘基因之间的作用关系。方法采用跨事务关联规则挖掘技术及Gene Ontology标注库对时间序列基因芯片数据进行分析处理。结果根据6个不同发育时间段的基因芯片表达数据,采用2倍法从10080个探针中筛选出119个差异表达基因参与规则挖掘,产生的规则达1300多条,筛选保留J-Measure值最大的10条关联规则并构建基因关联网络图。结论跨事务关联规则能够描述时序基因之间的作用关系,根据关联规则可以对基因的表达状态进行预测。 彭斌 李辉智 易东关键词:数据挖掘 邻近点插值方法在癌症诊断中的应用 被引量:1 2008年 对50例非癌症患者和100例癌症患者分组,运用邻近点插值的数学模型诊断。对诊断对象的腺苷三磷酸酶(ATP酶)和琥珀酸脱氢酶(SDH酶)活性两项指标利用邻近点插值,其诊断正确率可以高达98.2%,增加训练样本集的覆盖面,诊断正确率将趋于100%。邻近点插值是癌症诊断的高效数学模型。 罗万春 陈洪 刘恩 龚利红 蔡昌启 易东关键词:癌症 ATP酶 基因芯片表达数据的标准化策略研究 被引量:22 2004年 目的 从统计学、数学和生物信息学相结合的角度 ,探讨针对不同密度基因芯片 (microarray ,genechip)如何进行数据标准化处理与分析 ,寻找表达上有显著性差别的基因。方法 在Excel和Spss软件中 ,采用总强度标准化法 (totalintensitynormalization ,TIN )和局部加权线性回归标准化法 (locallyweightedlinearregressionnormalization ,LWLRN)对高低密度芯片数据进行分析处理。结果 这些方法能有效地减少系统误差产生的影响 ,使处理后的数据更加具有可比性和可靠性。结论 本研究提供的分析方法在减少系统误差基础上能较好地找出芯片上有显著性差异表达的基因 ,不过标准化方法还处于起步和发展的阶段 ,需进一步完善 ;但随着非线性技术的不断完善 ,计算机软硬件的快速发展 。 伍亚舟 张彦琦 黄明辉 杨梦苏 曾志雄 易东关键词:显著性差异 酵母基因调控网络的微分方程模型研究 被引量:8 2006年 目的寻求一种新的描述基因调控网络的微分方程模型。方法建立微分方程并应用于酵母基因的时间序列表达数据,最后与试验结果比较。结果微分方程模型所得结论基本与试验结果吻合,并作出了预测。结论该模型弥补了其他线性微分方程模型的不足,是一种新的有价值的微分方程模型。 郭波涛 李辉智 王文昌 易东关键词:酵母 基因调控 微分方程 基于感知器的临床疾病诊断模型 2008年 目的:建立临床诊断的数学模型。方法:构建感知器神经网络,以癌症诊断为例,对50例非癌症患者和100例癌症患者的腺苷三磷酸酶(ATP酶)和琥珀酸脱氢酶(SDH酶)活性2项指标分组进行训练和仿真诊断。结果:2个检测样本的诊断正确率分别为96%和97.33%。结论:可以用感知器神经网络建立临床的疾病诊断系统。 罗万春 刘岭 龚利红 黄英辉 李立奇 易东关键词:感知器 人工神经网络 Online electrophysiological spike discrimination with wavelet-fractal signatures 2006年 Objective: To study extracellular multi-neuron activity in the nervous system based on wavelet-fractal technique. Methods: The wavelet transform was employed to decompose the original signal and obtain 4 sub-patterns. The dividing fractal dimensions of these sub-patterns were computed. A knn-classier was used to classify feature vectors. Results: Not all the elements in feature vector DimDC were very powerful for this pattern recognition problem through the empirical study of noise signals. The most effective feature vector was defined as DimDC= (d3:d4) above. Conclusion:Wavelet fractal algorithm has high accuracy and provides a powerful tool for clinical application. 易东 严中红 郑永丽 李辉智关键词:FRACTAL 基因芯片表达数据分析方法研究进展 被引量:3 2005年 张彦琦 李辉智 易东关键词:微阵列 基因表达 数据分析 非线性回归的线性拟合加权最小二乘估计 被引量:14 2008年 目的探讨非线性回归的线性化拟合技术,改善线性化技术对非线性回归的拟合效果。方法通过设立适当的权重,采用加权最小二乘法对非线性回归的线性化方程进行拟合。结果在讨论非线性模型与相应的直线化模型误差间关系的基础上,导出了利用线性化方程进行加权最小二乘估计的权重,使得利用加权最小二乘估计得到的模型参数的估计误差近似于直接对非线性模型进行估计得到的估计误差,建立了非线性回归的加权线性化拟合技术。结论非线性回归的加权线性化拟合技术能较好地改善线性化技术对非线性回归的估计效果。 赵增炜 刘岭 王文昌关键词:线性化 加权最小二乘法