国家自然科学基金(39900173)
- 作品数:18 被引量:82H指数:4
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- 精确定量肺组织细胞线粒体DNA拷贝数方法的建立被引量:3
- 2010年
- 目的建立一种精确定量肺组织细胞线粒体DNA拷贝数的方法。方法结合2个单独的实时荧光定量PCR对待测样本中线粒体HV1和核β-globin基因分别进行定量。以线粒体DNA HV1和核单拷贝基因β-globin分别作为线粒体和核DNA拷贝数的标记,对肺组织线粒体DNA的含量进行了精确定量[拷贝数/细胞,即相对拷贝数/二倍体核基因组(diploid nuclear genome)=2×HV1/β-globin]。结果肺组织线粒体DNA的平均拷贝数/细胞为(733±196)。结论该技术可对线粒体DNA拷贝数进行准确的测定,并计算出线粒体DNA拷贝数绝对数量的变化。
- 戴纪刚肖颖彬闵家新张国强张在永
- 关键词:线粒体DNA拷贝数
- 肺癌中线粒体转录因子A的表达及意义
- 2010年
- 目的探讨肺癌组织中线粒体转录因子A(mtTFA)的表达及意义。方法采用RT-PCR等方法 ,对肺癌及相应正常肺组织中mtTFA mRNA的表达进行检测和分析。结果肺癌组织mtTFA mRNA的平均表达量(mtTFA/β-actin)为3.029±1.177,而相应的正常肺组织平均表达量为2.917±0.963,前者虽略高于后者,但差异无统计学意义(P=0.221)。结论肺癌中mtTFA等线粒体DNA(mtDNA)转录、复制的调节因子的表达水平可能与mtDNA拷贝数的改变无关。
- 戴纪刚肖颖彬闵家新张国强张在永
- 关键词:线粒体DNA肺癌拷贝数线粒体转录因子A
- 小鼠肿瘤线粒体DNA突变研究被引量:6
- 2004年
- 目的 探讨线粒体DNA(mtDNA)突变与肿瘤发生发展的关系。方法 采用聚合酶链反应 (PCR)技术结合限制性片段长度多态性分析 (PCR RFLP)和单链构象多态性分析 (PCR SSCP)技术了解Lewis肺癌、LA795、Hca F、Hca P、CT2 6、SCC891共 6个小鼠肿瘤细胞系mtDNA的基因变异。结果 经PCR RFLP分析发现 ,这些肿瘤细胞系mtDNA编码区的tRNAIle+Glu+Met及ND1基因核酸序列 ,在 2 7个限制性内切酶酶切位点上均无差异。而在非编码区 (D loop) ,与对照小鼠相比 ,Hca F出现了HinfI的新酶切位点 ;用PCR SSCP分析方法对这些肿瘤细胞系mtDNA的D loop的 5′及 3′端作进一步分析 ,在 6个肿瘤细胞系中 ,有 4个在mtDNA非编码区上存在着突变。结论 D loop是肿瘤细胞mtDNA突变的高发区 。
- 戴纪刚闵家新张国强魏泓肖颖彬
- 关键词:肿瘤细胞系小鼠肿瘤线粒体DNA突变非编码区LEWIS肺癌MTDNA突变
- 小鼠转移性肝癌细胞系基因组不稳定性的比较研究被引量:1
- 2004年
- 目的 观察小鼠高、低转移性肝癌细胞系Hca/16A3-F(F)和Hca/A2-P(P)发生基因组不稳定性的情况,探讨它们与肝癌发生及转移之间的关系。方法 随机选择42个微卫星多态标记,采用聚合酶链式反应-简单重复序列多态性(SSLP)法对F和P细胞进行分析。结果 小鼠高、低转移性肝癌细胞系的微卫星基因座表型与近交系C3H小鼠等位基因相比,在P细胞有30个基因座与近交系C3H小鼠相同,8个基因座丢失等位基因,5个基因座出现额外条带,4个基因座发生带移位。F细胞有28个微卫星基因座与近交系C3H相同,12个基因座发生等位基因丢失,4个基因座出现额外条带,1个基因座发生带移位。P和F细胞的等位基因条带存在明显差异。结论 小鼠高、低转移性肝癌细胞系存在基因组不稳定性,并在小鼠肝癌的发生发展中起重要作用,源自纯合性小鼠的一个肿瘤的两个亚克隆细胞系存在不同的遗传学特征。
- 张树辉丛文铭史景泉魏泓
- 关键词:小鼠微卫星DNA基因组不稳定性
- 原发性肺癌线粒体DNA控制区微卫星不稳定性的研究被引量:1
- 2010年
- [目的]探讨线粒体DNA控制区微卫星不稳定性(mitochondrial microsatellite instability,mtMSI)与肺癌的相关性。[方法]采用PCR-SSCP(PCR single-stranded conformation polymorphism,PCR-SSCP)和序列测定技术对37例肺癌组织及癌旁组织线粒体DNA控制区的3个微卫星位点进行了分析。[结果]37例肺癌样本中共检出mtMSI12例(32.4%),肺癌mtMSI发生率与患者性别、年龄及肿瘤的病理类型无相关性(P>0.05),吸烟组(包括曾经吸烟者)与非吸烟组mtMSI发生率两者有显著差异(P<0.05)。[结论]线粒体DNA控制区的遗传不稳定性在一些肺癌的发生中可能起一定作用。
- 戴纪刚张在永肖颖彬闵家新张国强吴秋平余祖斌
- 关键词:线粒体DNA肺癌微卫星不稳定性
- 线粒体DNA缺失细胞系的建立被引量:9
- 2005年
- 目的 线粒体DNA缺失细胞系的建立和鉴定。方法 利用EB可以插入无核蛋白保护的线粒体DNA分子 层状排列的碱基对之间抑制mtDNA复制的特点,将Lewis肺癌细胞在含有低剂量的EB、丙酮酸钠、尿嘧啶的培养液长期培 养。结果 经EB诱导,可培育出具有嘧啶依赖性的mtDNA缺失细胞系。结论 线粒体DNA缺失细胞系的建立,为进一 步研究线粒体DNA分子的基因及功能提供了条件。
- 戴纪刚闵家新张国强吴秋平周人杰魏泓
- 关键词:线粒体DNA缺失细胞系MTDNA缺失DNA复制碱基对核蛋白
- 肺癌组织中线粒体基因组4977bp大片段缺失状况分析被引量:4
- 2005年
- 戴纪刚肖颖彬闵家新张国强姚珂周人杰
- 关键词:线粒体基因组肺癌组织癌旁正常组织组织病理类型患者年龄
- 几种肿瘤细胞株线粒体DNA多态性
- 2005年
- 目的 了解和分析线粒体DNA突变与肿瘤发生发展的关系。方法 应用PCR RFLP和PCR SSCP技术对Lewis肺癌等肿瘤细胞株mtDNA的D loop ,ND3andtRNAMet+Glu +Ile基因片段进行了分析。结果 mtDNA编码区的tR NAMet+Glu +Ile及ND1基因核酸片段经HaeⅢ等 16种内切酶消化后 ,这些肿瘤细胞株表现出完全相同的酶切图谱。而D loop片段 ,小鼠肿瘤Hca F出现了与对照小鼠不同的酶切方式 ;用PCR SSCP分析方法对这些肿瘤细胞株mtDNA的D loop的 5′及 3′端作进一步分析 ,在研究的 6个肿瘤中 ,有 4个在mtDNA非编码区上存在着突变。结论 mtDNA突变在肿瘤的发生发展中可能起一定作用。
- 戴纪刚闵家新魏泓张国强周人杰
- 关键词:肿瘤线粒体DNA突变
- 三个鼠源性肿瘤细胞系的RAPD分析被引量:3
- 2002年
- 目的 探讨鼠源性肿瘤细胞系基因组不稳定程度或基因组损伤与肿瘤发生的关系。方法 用 14 5条RAPD引物对鼠源性Lewis肺癌、SCC891乳腺癌及B16黑色素瘤及其相应正常组织基因组DNA进行RAPD扩增 ,扩增产物在含溴化乙锭的 1.5 %琼脂糖凝胶中电泳 ,紫外透射仪上观察照相。结果 14 5条引物绝大多数能扩增出清晰、明显的条带。多数引物扩增出的条带呈单态性 ,在肿瘤及其相应正常组织之间无差异。部分引物扩增出的DNA序列在肿瘤组织与其相应正常组织间存在差异 ,表现为多态性 ,即肿瘤组织与其相应正常组织的DNA片段相比 ,出现带的缺失、增加、移动和强度变化。扩增Lewis肺癌的 10 5条引物中有 2 5条表现出多态性 ;扩增B16黑色素瘤的 10 5条引物中有 2 4条表现出多态性 ;扩增SCC891乳腺癌的 12 0条引物中有 18条表现出多态性。结论 RAPD扩增结果表明三个恶性度较高的瘤株 ,其基因组损伤程度亦较高 ,表现为基因拷贝数的增加或等位基因的丢失 。
- 李淑蓉陈意生魏泓
- 关键词:肿瘤随机扩增多态DNARAPD
- 非小细胞肺癌线粒体基因组大片段缺失突变研究被引量:3
- 2006年
- 目的明确mtDNA4977bp大片段缺失在肺癌组织、癌旁正常组织及非癌患者肺组织中的分布频率,探讨mtDNA4977bp大片段缺失与肿瘤的关系。方法采用长距离PCR方法对37例肺癌组织和相应的癌旁正常组织、20例非癌患者正常肺组织mtDNA4977bp缺失进行了检测。结果肺癌组织、癌旁正常肺组织及非癌患者正常肺组织中均检测出存在有线粒体DNA4977bp片段缺失。37例肺癌组织标本中有20例(54.1%)检测到4977bp缺失,37例相应的癌旁肺组织22例(59.5%)有缺失,其中8例在肺癌组织中未显示而却在癌旁正常组织检测到缺失,20例非癌患者正常肺组织中也有6例出现4977bp片段缺失。线粒体DNA4977bp缺失与年龄、吸烟因素有关。结论线粒体DNA4977bp缺失并非肺癌特异性突变,在癌变过程中不太可能起重要的作用,而可能仅仅是肿瘤发生发展过程中环境和遗传因素作用的反映。
- 戴纪刚肖颖彬闵家新张国强向明章吴秋平姚珂周人杰余祖斌
- 关键词:线粒体DNA肺癌突变