四川省应用基础研究计划项目(07JY029-072)
- 作品数:7 被引量:37H指数:4
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- 变异链球菌、血链球菌及嗜酸乳杆菌代谢组学鉴定的初步研究被引量:18
- 2008年
- 目的了解变异链球菌、血链球菌和嗜酸乳杆菌的代谢谱图,探讨基于核磁共振的代谢组学方法在口腔致龋菌快速鉴定中的应用。方法分别在改良TPY液体培养基中接种相同密度的变异链球菌、血链球菌及嗜酸乳杆菌菌悬液,采用比浊法计算细菌数,绘制生长曲线。选择这3种细菌生长稳定期的培养液检测核磁共振波谱,用主成分分析法进行数据分析。结果主成分分析显示3组数据内部有集中的聚类关系,可以区分这3种细菌。结论代谢组学分析是一种有良好发展前景的口腔细菌的快速鉴定方法。
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- 关键词:代谢组学核磁共振细菌
- 口腔微生物的多相分类被引量:2
- 2010年
- 随着分子生物学技术的迅速发展,口腔微生物的分类亦从传统的表型分类进入到各种分子水平分类。多相分类综合了表型和遗传型以及系统发育特征,更加客观地反映了生物间系统进化的关系。本文就蛋白质电泳图谱、G+C摩尔分数、分子杂交、16S rRNA序列分析和代谢组学等口腔微生物多相分类方法作一综述。
- 袁艺肖丽英李继遥
- 关键词:口腔微生物表型遗传型
- 细菌和真菌的代谢组学研究被引量:3
- 2008年
- 代谢组学是20世纪90年代中期发展起来的一门对生物体或细胞等所有小相对分子质量代谢产物进行定量和定性分析的新技术。这门新兴的学科凭借其整体论优势在最近几年得到了迅速的发展,广泛地应用到了功能基因组学、生物医学、微生物学等领域。下面就代谢组学的研究方法及其在细菌和真菌领域的研究进展作一综述。
- 熊萍肖丽英李继遥
- 关键词:代谢组学核磁共振模式识别细菌
- 口腔常见放线菌代谢组学鉴定的初步研究被引量:5
- 2009年
- 目的初步将基于核磁共振氢谱(1H-NMR)的代谢组学方法应用于口腔常见放线菌——内氏放线菌和衣氏放线菌的鉴定。方法在BHI液体培养基中接种内氏放线菌和衣氏放线菌,用比浊法测定菌液密度,绘制生长曲线,选择稳定期的培养液检测核磁共振波谱,用主成分分析法进行数据分析。结果主成分分析法显示2组数据内部有集中的聚类关系,可以区分2种放线菌。结论代谢组学分析技术有望应用于口腔放线菌的快速鉴定。
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- 关键词:代谢组学核磁共振主成分分析
- 牙周可疑致病菌代谢组学鉴定的初步研究被引量:10
- 2009年
- 目的分析比较牙周可疑致病菌的核磁共振代谢图谱,探讨用代谢组学方法快速鉴定口腔细菌的可能性。方法分别在BHI液体培养基中接种相同密度的牙龈卟啉单胞菌、中间普氏菌和具核梭杆菌,采用比浊法绘制生长曲线。取3种细菌生长稳定期的培养液进行核磁共振氢谱(1H-NMR)测定,用主成分分析法进行数据分析。结果主成分分析显示3组数据各自有较为集中的类聚关系,可以区分这3种细菌。结论代谢组学是一种具有良好应用前景的口腔细菌分类鉴定方法。
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- 关键词:代谢组学核磁共振细菌
- 链球菌和放线菌的胞外代谢物代谢组学鉴定被引量:9
- 2011年
- 目的检测不同口腔细菌的细胞外代谢产物,发掘各种细菌的特征性代谢谱图,探讨代谢组学在口腔细菌鉴定中的作用。方法取3组细菌生长对数后期培养液,行磁共振氢谱仪检测和主成分分析(PCA)及最小偏二乘法判别分析(PLS-DA),鉴别各个细菌间的代谢产物。结果 3组细菌的代谢产物明显不同,各自聚集、分布区域明显分开;PLS-DA区分效果好于PCA。结论细菌细胞外代谢产物的代谢组学研究,有望成为口腔细菌鉴定和分析的新技术。
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- 关键词:代谢组学模式识别口腔细菌
- 口腔常见链球菌代谢组学鉴定的研究被引量:3
- 2009年
- 目的通过比较血链球菌和远缘链球菌的代谢物图谱,初步将基于核磁共振的代谢组学方法应用于口腔常见链球菌的快速鉴定。方法在液体TPY培养基中分别接种相同密度的血链球菌和远缘链球菌菌悬液,用比浊法测定菌悬液密度,绘制生长曲线。取2种细菌生长稳定期的培养液检测核磁共振图谱,进行主成分分析。结果主成分分析表明2种细菌的数据内部具有集中的聚类关系,该方法可以区分这2种细菌。结论代谢组学方法在口腔链球菌的快速鉴定中具有良好的应用前景。
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- 关键词:代谢组学核磁共振细菌