国家自然科学基金(31070119)
- 作品数:5 被引量:10H指数:2
- 相关作者:李妍姜茵宁云山奚月何殿殿更多>>
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- 幽门杆菌Catalase/GST融合蛋白的表达、标签切除及鉴定被引量:6
- 2012年
- 旨在利用GST融合基因表达系统表达幽门螺杆菌Catalase融合蛋白,并利用凝血酶切除GST标签。将重组质粒Catalase/pGEX-4T-1转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态中,用IPTG进行诱导表达,菌体经反复冻融、溶菌酶裂解及超声破菌后,Catalase/GST融合蛋白以部分可溶性的形式表达在上清中。采用谷胱甘肽琼脂糖树脂Glutathione Sepharose 4B对其进行纯化,得到Catalase/GST融合蛋白,再用凝血酶进行GST标签的切除,所得产物进行Western blotting鉴定。高效表达出Catalase/GST融合蛋白的相对分子质量约85 kD,凝血酶成功地切除了GST标签,Western blotting证实Catalase蛋白能被鼠抗Catalase单克隆抗体识别。
- 姜茵奚月李妍
- 关键词:幽门螺杆菌CATALASE纯化
- 柱上切除GST标签制备幽门螺杆菌Lpp20蛋白被引量:1
- 2012年
- 目的表达幽门螺杆菌Lpp20-GST融合蛋白,获取切除GST标签的重组蛋白。方法采用异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导重组表达质粒Lpp20/pGEX-4T-1在大肠埃希菌BL21(DE3)中表达,收集菌体并采用反复冻融、溶菌酶裂解及超声破菌3种细胞破碎方法,表达产物在谷胱甘肽琼脂糖树脂4B柱上纯化,利用凝血酶切除GST标签,用鼠抗Lpp20单克隆抗体进行纯化产物western blot鉴定。结果高效表达出Lpp20-GST融合蛋白,相对分子质量约为4.5 kDa,产物以部分可溶性形式表达,凝血酶成功切除GST标签,纯化产物能被鼠抗Lpp20单克隆抗体识别。结论凝血酶柱上切除GST标签获得目的蛋白。
- 姜茵王小平何殿殿李妍
- 关键词:幽门螺杆菌LPP20凝血酶纯化
- 基于Mimox工具分析幽门螺杆菌Catalase模拟表位
- 2012年
- 目的利用Mimox软件分析幽门螺杆菌Catalase蛋白模拟表位的性质,并与手工比对结果进行比较。方法将源于噬菌体随机肽库筛选技术获得的5个Catalase模拟表位输入Mimox网站,参数设定为默认值,进行模拟表位的比对,寻找共同序列并分析其性质。结果从ClustalW界面比对结果看,氨基酸P、T、S、L、A出现频率较高,通过统计学的方法推导出的共同序列为-[HST]X[DST]FRPXA[TNQ][LV][Fw]T-,其中氨基酸P(80%)和A(60%)的出现频率较高。通过JalView界面推导出的共同序列为-H—DFRP—AT—T-,保守性上氨基酸T(分值8)、P(分值6)、D(分值5)比较高;特性上氨基酸T(分值2.4595077)、P(分值2.235784)、R(分值2.1615076)比较高;共同性(consensus)上氨基酸P(80%)、A(60%)、T(60%)比较高,与先前手工比对得出的结论基本相符。结论结合噬菌体筛选技术和生物信息学Mimox工具对模拟表位进行分析,可以获得较全面的表位信息。
- 李妍曾爽宁云山
- 关键词:模拟表位幽门螺杆菌CATALASE
- 基于Mimox工具分析幽门螺杆菌Lpp20蛋白模拟表位
- 2013年
- 目的利用Mimox软件分析幽门螺杆菌Lpp20蛋白模拟表位的性质。方法将源于噬菌体随机肽库筛选技术获得的6个Lpp20模拟表位输入Mimox网站,参数设为默认值,进行模拟表位的比对,寻找其共同序列并分析其性质。结果从ClustalW界面比对结果看,氨基酸D、A、S、G、L在模拟表位中出现的频率较高。通过统计学的方法推导出的共同序列为-[-W][PST][LDE]H[SDE][DM]ASG-[LT][YFW][-R]-,第2位置氨基酸W(50%),第7位置氨基酸D(67%),第8位置氨基酸A(50%),第9位置氨基酸S(50%),第12位置氨基酸L(50%)的出现频率较高。通过JalView界面推导出的共同序列为-WPLHSDASG-LYR-,保守性上第6位置S(分值6)、第7位置D(分值5)、第12位置L(分值5)比较高;特异性上第6位置S(分值2.067 059)、第12位置L(分值2.529 612)、第10位置G(分值1.805 491 4)、第3位置P(分值1.761 471 6)比较高;共同性上第7位置D(66%)、第8位置A(50%)、第9位置S(50%)、第10位置G(66%)比较高。结论结合噬菌体筛选技术和生物信息学Mimox工具对抗原模拟表位进行分析并获得较全面的表位信息,为进一步确定抗原表位及研制新型表位疫苗奠定基础。
- 李妍温月媚曾爽陈中标陈艳宁云山
- 关键词:模拟肽幽门螺杆菌LPP20