北京市自然科学基金(5092004) 作品数:6 被引量:64 H指数:5 相关作者: 宋未 刘洋 邹媛媛 刘琳 王建华 更多>> 相关机构: 首都师范大学 中国农业大学 国家杂交水稻工程技术研究中心 更多>> 发文基金: 北京市自然科学基金 国家自然科学基金 国家教育部博士点基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 交通运输工程 轻工技术与工程 更多>>
不同水稻品种种子固有细菌群落的多样性 被引量:17 2012年 种子固有细菌是植物内生细菌的重要来源,对植物的健康以及接种细菌的定殖能产生重要影响。该文以杂交水稻(Oryza sativa)种子为研究对象,比较研究了不同品种水稻种子中固有细菌群落的多样性。利用799f和1492r这对引物成功地从水稻种子中扩增出固有细菌16SrDNA片段;通过构建16SrDNA文库和扩增核糖体RNA基因酶切分型(ARDRA)的方法,对杂交水稻‘丰优611’(‘丰源A’ב远恢611’)、‘金优611’(‘金23A’ב远恢611’)和‘金23A/09H013’(‘金23A’ב09H013’)3个组合的子代及其各自亲本的种子固有细菌群落结构的多样性进行了研究。构建的7个克隆文库中,每个文库含有200–300个克隆,30–40个操作分类单元(OTU),对ARDRA分型得到的代表序列进行分析,在16SrDNA文库中发现多种细菌类群,包括α变形杆菌(α-Proteobacteria)、β变形杆菌、γ变形杆菌、放线菌(Actinobacteria)、厚壁菌(Firmicutes)和拟菌(Bacteroidetes),优势菌属是泛菌属(Pantoea)和芽孢杆菌属(Bacillus)。不同品种的水稻种子固有细菌群落结构不同,而杂交子代种子中的优势菌与亲本种子中的优势菌在种类和数量上都具有一定的相关性。此外,子代种子中丰度5%以上的细菌也能在各自父本或母本中检测到。 邹媛媛 刘琳 刘洋 赵亮 邓启云 吴俊 庄文 宋未关键词:群落多样性 杂交水稻 亲本 子代 种子微生物生态学研究进展 植物种子微生物生态学是研究与种子相联合的微生物的组成﹑功能﹑演替、它们之间关系及其与宿主之间相互关系的科学。种子中蕴含着丰富的微生物资源,它们对种子以及植物的健康具有重要的影响。不同种类植物种子联合的微生物群落由于受到种... 邹媛媛 刘洋 王建华 宋未关键词:微生物群落 基因型 文献传递 水稻内生粘着剑菌的分子系统发育分析 被引量:2 2010年 通过16S rRNA基因和看家基因recA、atpD、rpoB的序列测定与分析,及(G+C)mol%测定等技术,对分离自河北省滦南县水稻根内的两株细菌进行分子系统发育学研究.根据系统进化树构建及其同源性分析,可确定所分离的两株水稻内生细菌属于剑菌属(Ensifer)系统发育分支;供试菌株的各保守序列与粘着剑菌(E.adhaerens)模式菌种同源性最高,除recA为97.2%外,其他均为99%~100%,可以确定供试菌属于E.adhaerens;对所分离的菌株与大豆、菜豆、三叶草、苜蓿等4种豆科植物进行结瘤试验,结果显示其中一株J3-N55可与苜蓿结瘤.野生型的E.adhaerens菌株与豆科植物结瘤的报道尚为鲜见;本文首次报道从水稻植株内分离到E.adhaerens菌株. 张晓霞 邱服斌 孙磊 马晓彤 姜瑞波 宋未关键词:系统发育分析 种子微生物生态学研究进展 被引量:10 2011年 植物种子微生物生态学是研究与种子相联合的微生物的组成?功能?演替、它们之间关系及其与宿主之间相互关系的科学。种子中蕴含着丰富的微生物资源,它们对种子以及植物的健康具有重要的影响。不同种类植物种子联合的微生物群落由于受到种子本身及外界环境因素的影响而有所差异。论述了种子微生物生态学的概念、主要研究方法、种子微生物生态系统中的微生物种类、相关影响因素,以及种子微生物生态学研究的发展方向。种子微生物生态学的研究对生产实践有重要意义,同时也将丰富种子生物学的内容,对种子科学的发展起到促进作用。 邹媛媛 刘洋 王建华 宋未关键词:微生物群落 基因型 PCR-DGGE技术及其在植物微生态研究中的应用 被引量:12 2009年 植物中微生物种类较为丰富,在植物微生态系统中发挥重要作用。变性梯度凝胶电泳(denaturinggradient gel electrophoresis,DGGE)技术作为研究微生物物种多样性和种群动态变化的分子检测工具之一,广泛应用于植物微生物群落多样性和群落动态变化研究中。概述了DGGE技术的原理,及其在植物微生物生态学中的应用以及在该领域研究中导致DGGE偏差的因素和相应解决方法,对DGGE检测结果的分析提供参考,为进一步研究植物微生物相互作用提供帮助。 刘琳 刘洋 宋未与植物联合的细菌生物膜及其形成机制的研究进展 被引量:7 2009年 自然界中大多数微生物保持附着在生物或非生物体表面,处在一种具有结构的生物膜生态系统中,而不是自由游动状态.与植物联合的细菌在植物组织表面形成生物膜的能力是它们有效定殖和发挥促生作用的前提,与植物联合的细菌生物膜的研究已成为植物微生态研究领域的热点.文中系统介绍了与植物相联合的细菌生物膜的概念、形成机制及其基质组成成分,并提出了研究过程中应注意的主要问题. 刘洋 刘琳 邹媛媛 宋未杂交玉米农大108及其亲本种子内生细菌群落的多样性 被引量:26 2011年 【目的】研究不同基因型玉米对其种子内生细菌群落结构的影响。【方法】通过构建16S rDNA文库的非培养方法,对杂交玉米组合农大108正、反交及其亲本种子内生细菌群落多样性进行研究。【结果】两后代种子内生细菌分别含46和42个OTU,第一优势菌属均为Pseudomonas,丰度分别为34.29%和34.00%;亲本玉米黄C和178种子内生细菌分别含17和11个OTU,第一优势菌属分别为Enterobacter及Burkholderia,丰度分别为49.13%和89.72%。母本玉米黄C种子内生细菌群落中Roseateles、Enterobacter、Pseudomonas及Sphingomonas4个菌属与父本178种子内生细菌群落中Pseudomonas、Ralstonia、Paenibacillus及Bacillus 4个菌属存在其正交后代种子中。母本178种子内生细菌群落中Acinetobacter、Pseudomonas、Ralstonia、Paenibacillus及Bacillus 5个菌属与父本黄C种子内生细菌群落中Roseateles、Citrobacter、Pantoea、Pseudomonas、Stenotrophomonas及Escherichia 6个菌属存在其反交后代种子中。【结论】遗传相关的杂交玉米农大108正、反交后代其亲本在内生细菌群落结构具有一定的关联性。 刘洋 左山 邹媛媛 王建华 宋未关键词:杂交玉米 农大108 群落多样性 非培养方法