国家高技术研究发展计划(2008AA101009-11)
- 作品数：1 被引量：1H指数：1
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- 山羊SDHD基因cDNA编码序列的克隆与分析被引量：1
- 2010年
- 利用NCBI中GenBank里查询到已登录的人、猪、牛和绵羊的SDHD mRNA序列,通过多重同源比较,从而获得高度保守区域序列,设计了同源引物,并首次对山羊SDHD编码序列进行了分子克隆。经过PCR扩增和测序,获得山羊SDHD基因共4段cDNA序列,分别为:451 bp4、20 bp5、29 bp和698 bp。所获得的四段序列测序结果经La-sergene7.0软件SeqMan拼接后,获得一条1238 bp长的cDNA序列。在GenBank数据库中进行BLAST/nr比对,发现其与绵羊、牛、猪和人相应序列相似性分别达98%、97%、85%和81%。用NCBI的ORF Finder软件对已经克隆的山羊SDHD基因cDNA进行开放阅读框分析,发现该序列包含一个480 bp的开放阅读框,编码159个氨基酸残基,计算机分析表明(Compute pI/Mw tool),该蛋白的分子量约为17 224.11 Da,等电点为8.92。通过DNAMAN软件分析发现,山羊SDHD蛋白保守性很高,其与绵羊、牛、猪和人SDHD蛋白在氨基酸序列上的相似性分别达到97%、96%、87%和85%。此山羊SDHD基因cDNA序列和SDHD蛋白质序列已于2010年1月31日登录在NCBI的GenBank上,登录号为GU338978和ADB92501。本项研究为进一步研究山羊的SDHD基因作为山羊肉品质性状候选基因,提供了相应的序列信息。
- 李武峰岳文斌
- 关键词：山羊分子克隆
- 鸡PepT1基因SNP位点影响其在小肠中的表达
- 引言Pep T1主要在肠道中表达,对于大多数二肽和三肽都具有很高的转运活性。Pep T1基因中不同部位碱基的突变可能会影响转录因子的结合,酶的结合以及蛋白质的结构从而对肽的吸收产生影响。
- 李丽李超凡李武峰李慧锋
- 文献传递
