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基于TCGA数据集分析CDCA5在肺腺癌中的临床意义与分子机制被引量：5: 2020年; 目的研究细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)在肺腺癌中的表达、临床意义和分子作用机制。方法在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载肺腺癌RNA测序数据和患者的临床资料,使用R 3.6.1软件提取并分析CDCA5在肺腺癌组织和正常肺组织中的表达量,探究CDCA5表达与患者临床病理特征的联系。结合患者的生存资料,利用cox回归分析CDCA5在肺腺癌患者中的预后作用。使用基因集富集分析(GSEA)探索CDCA5在肺腺癌中的分子作用机制。结果在TCGA肺腺癌数据集(TCGA-LUAD)中,CDCA5在肺腺癌组织中的表达水平显著高于正常肺组织,差异具有统计学意义(P<0.05)。高表达的CDCA5与肺腺癌患者的TNM分期(P=0.003)和淋巴结浸润(P=0.016)显著相关。多因素cox回归分析显示,CDCA5可以作为肺腺癌的独立预后指标(HR=1.28,95%CI:1.06~1.54,P=0.010)。GSEA分析结果表明,高表达的CDCA5主要参与细胞周期、DNA复制、错配修复、同源重组、RNA降解以及P53信号通路等。结论 CDCA5在肺腺癌组织中表达明显上调,并且与肺腺癌患者的恶性进展特征相关,CDCA5可作为预测肺腺癌预后的新型分子标志物。; 王萍黄奔范维柳家翠程庆元段怡萍陈梁玥马甜甜喻明霞; 关键词：肺腺癌预后因子

乳腺癌中NF-κB蛋白表达及其与TNF-α相关性研究被引量：4: 2013年; 目的:研究乳腺癌中细胞核因子-κB(nuclear factor-kappa B,NF-κB)的表达及其与肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factorα,TNF-α)的相关性。方法:采用免疫组织化学的方法检测67例原发乳腺癌组织中NF-κB和TNF-α的表达,检测NF-κB在癌旁正常组织、乳腺增生和乳腺癌中的表达情况,并分析NF-κB的表达与乳腺癌临床病理特征的关系以及NF-κB与TNF-α的相关性。结果:1)NF-κB在癌旁正常组织、乳腺增生和乳腺癌中表达的阳性率分别为20%(3/15)、33.3%(5/15)、79.1%(53/67);2)NF-κB的表达与年龄、肿瘤大小、组织学类型均无相关性(P>0.05),与淋巴转移的有无及组织学分期有显著相关性(P<0.05);3)NF-κB的表达与TNF-α呈显著正相关(P<0.05)。结论:乳腺癌中NF-κB的表达显著增加且与其淋巴转移的有无及肿瘤组织学分期有显著相关性,与TNF-α呈显著正相关,对乳腺癌良恶性判断、诊断、靶向治疗及预后提供重要参考依据。; 杨桂喻明霞范维徐婷陈浩; 关键词：乳腺癌 NF-ΚB TNF-Α

基于TCGA数据库分析细胞分裂周期相关蛋白3在肺腺癌中的表达与临床意义被引量：2: 2020年; 目的:研究细胞分裂周期相关蛋白3(CDCA3)在肺腺癌中的表达,分析CDCA3的表达与临床病理特征、预后的关系,探索CDCA3在肺腺癌发生发展中的作用机制。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库官方网站上下载肺腺癌的RNA-seq数据,提取CDCA3在肺腺癌组织和正常组织样本中的表达数据,使用Mann-Whitney U检验分析两组之间的表达差异。根据CDCA3在肺腺癌样本中表达水平的中位值,将肺腺癌患者划分为高、低表达两组,使用卡方检验分析CDCA3表达与患者临床病理特征的联系,利用Kaplan-Meier法分析CDCA3表达与患者预后的相关性。使用单因素和多因素Cox回归分析其预后价值。利用基因集富集分析探索CDCA3在肺腺癌中参与的信号途径。结果:与正常组织相比,CDCA3在肺腺癌样本中表达显著上调(P<0.001),CDCA3的表达与患者的TNM stage分期显著相关(P=0.007)。Kaplan-Meier分析显示高表达组患者的总体生存率显著低于低表达组患者(P=0.002)。多因素Cox回归分析显示,CDCA3可以作为肺腺癌患者的独立预后因素(HR=1.40,95%CI:1.10~1.77,P=0.006)。GSEA富集分析结果提示,CDCA3主要参与细胞周期、DNA复制、RNA降解、错配修复、P53信号传导途径等信号通路。结论:CDCA3在肺腺癌中表达上调,可作为肺腺癌患者的独立预后因素,是肺腺癌的新型分子标志物。; 黄奔柳家翠程庆元段怡平陈梁玥蔡伟国喻明霞; 关键词：肺腺癌预后

LINC00634基因在结直肠癌中表达及与预后的相关性分析被引量：2: 2021年; 目的探究LINC00634在结直肠癌(CRC)中的表达及其与临床病理特征、免疫浸润以及预后的关系。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库官方网站上下载CRC的RNA-seq数据及患者的临床病理信息,使用Mann-Whitney U检验分析CRC组织与正常组织之间的表达差异。分析LINC00634表达与患者临床病理特征的关系,利用Kaplan-Meier法分析LINC00634表达与患者预后的相关性。使用单因素和多因素Cox回归分析LINC00634表达与CRC患者临床预后关系。利用基因富集分析(GSEA)探索LINC00634在CRC中参与的信号途径。使用R 4.0.2软件评估LINC00634表达与肿瘤细胞免疫浸润丰度的相关性。结果CRC样本中LINC00634表达水平显著高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.05),LINC00634的表达与患者的年龄、临床分期和淋巴结转移分期显著相关(X^(2)=4.326、4.666、6.513,P<0.05)。LINC00634高表达组患者的总体生存率显著低于低表达组患者,差异有统计学意义(P<0.05)。多因素Cox回归分析显示,LINC00634可以作为CRC患者的独立预后因素(HR=5.377,95%CI:2.218~13.031,P<0.05)。GSEA富集分析结果提示,LINC00634主要参与DNA损伤修复、多条生化代谢通路,TGF信号通路,ECM受体相互作用通路等。LINC00634表达与CD8+T细胞、CD4+记忆T细胞呈正相关(R>0,P<0.05),而与嗜酸性粒细胞呈负相关(R<0,P<0.05)。结论LINC00634在CRC中表达上调,参与多种癌症信号通路,可作为CRC患者的独立预后因素,是CRC新型分子标志物。; 马甜甜柳家翠段怡平陈梁玥朱翠雯邹晓沨; 关键词：CRC 预后分析

支气管哮喘的靶向药物治疗被引量：8: 2019年; 尽管过去几十年针对支气管哮喘的治疗取得了巨大的进步,尤其是糖皮质激素的应用,当前哮喘仍是严重威胁人类健康的疾病,其发病率仍在不断上升。支气管哮喘患者大部分通过常规药物规范化的治疗能得到良好的控制,但是对于难治性哮喘,常规治疗难以凑效。自奥马珠单抗作为哮喘的靶向药物最先于2003年被美国食品和药品监督管理局(Food and Drug Administration,FDA)批准用于中重度过敏性支气管哮喘以来,不断的有新的分子靶向药物问世以及进行临床试验,使哮喘的治疗,尤其是重度哮喘的治疗开启了一个新的时代。本文对支气管哮喘治疗的靶向药物进行综述,以为哮喘的治疗提供新的思路。; 甘辉刘光辉喻明霞; 关键词：支气管哮喘靶向治疗新型药物重度哮喘

乳腺癌中人类表皮生长因子受体-2的表达及其与肿瘤坏死因子-α的相关性研究被引量：5: 2011年; 目的研究人类表皮生长因子受体-2（HER-2）在乳腺癌中的表达及其与肿瘤坏死因子-α（TNF—α）的相关性。方法HER-2是武汉大学中南医院乳腺癌患者常规检测项目。我们采用免疫组化SABC法检测112例原发性乳腺癌组织中TNF-α的表达，分析HER-2在乳腺癌中的表达、HER-2与乳腺癌临床病理特征的关系以及HER-2和TNF—α的相关性。结果（1）乳腺癌中HER-2的阳性表达率为35．71％（40／112），其中在97例浸润性导管癌中的阳性表达率为35．05％（34／97），在浸润性小叶癌中的阳性表达率为33．33％（2／6），在黏液腺癌中的阳性表达率为25．00％（1／4），在导管内癌中的阳性表达率为50．00％（2／4），1例小叶原位癌为HER-2阳性。HER-2在各类型乳腺癌中的差异无统计学意义（P〉0．05）。（2）HER-2在乳腺癌中的表达与TNM分期、年龄、初潮年龄、是否绝经、孕次、产次、肿瘤家族史均无相关性（P均〉0．05）。（3）HER-2阴性时TNF—α的阳性率为23．61％（17／72），HER-2阳性时TNF-α的阳性率为52．50％（21／40）。HER-2和TNF-α在乳腺癌中的表达有显著正相关性（r=0．881，P〈0．05）。结论HER-2与TNF-α在乳腺癌中的表达有显著正相关性，具体机制有待更多研究。; 张蒂涂建成胡汉宁杨桂李晓改喻明霞; 关键词：乳腺癌人类表皮生长因子受体-2 肿瘤坏死因子-Α

基于生物信息学分析F2R基因在胃癌中表达与免疫浸润的临床意义被引量：2: 2021年; 目的探究凝血因子II(凝血酶)受体(F2R)的在胃癌中的表达与免疫细胞浸润情况,探索F2R在胃癌中预后价值及其生物学功能。方法从TCGA数据库中下载胃癌中F2R基因表达谱数据及患者的临床病理信息,使用R4.0.2软件提取F2R在胃癌组及正常对照组的表达量数据,比较两组间F2R的表达差异。利用Kaplan-Meier法分析F2R表达与患者预后的相关性,并利用GEPIA对此进行验证。使用Cox回归分析F2R表达与胃癌患者临床预后相关性。利用GSEA富集分析预测F2R在胃癌中参与的信号通路。使用TIMER2.0分析了F2R表达与免疫浸润之间的关系。结果 F2R在胃癌样本中表达显著上调(P<0.05);生存分析显示F2R高表达组的总体生存率显著高于低表达组,差异均有统计学意义(P<0.05);F2R的表达也与肿瘤组织学分级、临床分期和及肿瘤状态相关,是胃癌的独立预后因素(HR=1.303,95%CI:1.076~1.578,P<0.05)。富集分析结果显示,F2R基因主要富集在MTOR信号通路、MAPK信号通路和癌症通路等。免疫浸润分析结果显示F2R表达与CD4+T细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞相关(Rho>0.5,P<0.05)。结论 F2R在胃癌中表达显著上调,可作为胃癌患者的独立预后因子,且与免疫浸润有关。; 陈梁玥段怡平柳家翠马甜甜朱翠雯邹晓沨; 关键词：胃癌生物信息学

增强子RNA RASSF8-AS1在胃腺癌中的临床意义与分子机制: 2023年; 目的探究增强子RNA RASSF8-AS1在胃腺癌(STAD)中的表达和关键靶基因预测,分析RASSF8-AS1与临床病理特征、预后的关系,探索RASSF8-AS1在STAD发生发展中的作用机制。方法在UCSC Xena数据库中下载33类肿瘤的表达数据、生存数据和临床数据。采用Kaplan-Meier生存分析和相关性分析确定关键eRNA及其调控基因为e RNA-靶基因对。使用R语言ggboxplot命令分析RASSF8-AS1表达与患者临床病理的相关性,利用GO和KEGG富集分析探索RASSF8-AS1在STAD中参与的信号途径。使用逆转录聚合酶链式反应(RT-qPCR)验证RASSF8-AS1在正常和胃腺癌细胞系中的表达量。结果RASSF8-AS1的表达水平与患者的年龄、临床分级、临床分期显著相关(χ^(2)=4.356、4.166、6.452,P均<0.05)。RT-qPCR结果表明,与正常细胞相比,胃癌细胞中RASSF8-AS1和RASSF8的表达水平显著降低,差异有统计学意义(HR=0.044,95%CI:0.032~0.056,P<0.05)。RASSF8-AS1高表达组患者的总体生存率显著低于低表达组患者,差异有统计学意义(P<0.05)。GO分析结果表明,RASSF8-AS1参与了细胞外基质组织构建、细胞黏附、化学突触传递的调节、胶原代谢等多种生物过程。KEGG通路分析中,间质发展、细胞外基质组织、膜电位的调节等信号途径被富集。结论RASSF8-AS1是胃癌中与生存相关的关键eRNA,可能成为胃癌患者早期诊断的潜在生物标志物和潜在的治疗靶点。; 马甜甜朱翠雯李东旭张晓洋喻明霞; 关键词：胃腺癌预后

肿瘤坏死因子-α在乳腺癌中的研究进展被引量：4: 2010年; 作为一种多功能细胞因子,肿瘤坏死因子-α(TNF-α)与乳腺癌关系密切。近期国内外研究表明,在实验性乳腺癌研究方面,TNF-α通过调节血管形成、活性氧、趋化因子、NF-κB等多种途径在乳腺癌的侵袭和转移中发挥重要作用;临床应用方面,TNF-α在乳腺癌治疗中存在争议,但有潜力应用于乳腺癌预后检测。; 张蒂李晓改胡汉林徐祥涂建成喻明霞; 关键词：肿瘤坏死因子Α 乳腺癌

胃癌中HER-2蛋白和NF-κB蛋白的表达及其临床意义被引量：1: 2012年; 目的：探究人类表皮生长因子受体-2（HER-2）和核因子．KB（NF-KB）在胃癌中的表达及二者之间的关系。方法：收集检测武汉大学附属中南医院2007年1月-2009年12月75例胃癌手术切除的组织和22例癌旁正常胃组织，HER-2和NF—KB的表达检测采用免疫组织化学sP法；分析其与胃癌临床病理特征的关系以及二者之间的相关性。结果：胃癌中HER-2和NF-KB的阳性率分别为24．00％（18／75）和62．67％（47／75）；两者与年龄、性别均无相关性，而与分期、分级和是否转移相关（P〈0．05）；HER-2与肿瘤大小无相关性，但NF—KB与肿瘤大小相关（P〈0．01）。HER-2阳性时NF-KB的阳性率为94．44％（17／18），HER-2阴性时NF-KB的阳性率为52．63％（30／57），两者的表达有显著相关性（x2=8．514，P〈0．01）。结论：胃癌中NF-KB、HER-2蛋白的表达具有相关性，在胃癌的发生发展中具有重要作用。; 徐智高杨桂芳喻明霞杨国春龚玲玲; 关键词：胃癌人类表皮生长因子受体 NF-ΚB 免疫组织化学

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国家自然科学基金(30901308)

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