山东省优秀中青年科学家科研奖励基金(BS2009NY023)
- 作品数:3 被引量:12H指数:2
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- 相关机构:青岛农业大学更多>>
- 发文基金:青岛市科技发展计划项目山东省优秀中青年科学家科研奖励基金国家苹果产业技术体系建设专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 柱型苹果MdLAS基因的克隆与转化苹果和烟草的研究
- 柱型苹果(Columnar apple),又称芭蕾苹果(Ballerina apple),最早来自于‘旭’(McIntosh)的一个突变体‘旭威赛克’(McIntosh Wijcik),具有"树冠极紧凑,近似圆柱体,节间...
- 张玉刚韩菲Song Guo-qingWalworth Aaron戴洪义
- 关键词:苹果柱型苹果基因克隆
- 文献传递
- 柱型苹果MADS-box家族的2个同源基因克隆与生物信息学分析被引量:7
- 2012年
- 基于笔者前期进行的柱型苹果转录组测序(RNA-seq)结果,采用RT-PCR方法,从柱型苹果花芽中克隆了MADS-box基因家族的2个同源基因,分别命名为MdSOCla和MdSOClb。分析结果表明,MdSOCla开放阅读框长度为708 bp,编码235个氨基酸,蛋白质分子量为26.95 kDa,等电点为9.13;MdSOClb开放阅读框长度为717 bp,编码238个氨基酸,蛋白质分子量为27.49 kDa,等电点为9.61。MdSOCla和MdSOClb的编码区碱基序列相似性为83.49%,氨基酸的相似性为73.72%。MdSOCla和MdSOClb的第1~75个氨基酸为高度保守的MADS盒结构域,第105~170个为K盒结构域。在构建的SOC1系统进化树中,MdSOCla与MdSOClb与苹果SOC1关系最近,其次为橙SOC1,与拟南芥SOC1同源基因进化关系最远。苹果、橙、大岩桐关系较近而聚为一类,而大豆、豇豆、葡萄、拟南芥、草莓和玉兰聚为一类。蛋白质二级结构预测显示,MdSOCla蛋白有8个α-螺旋,5个β折叠区,13个β-转角;而MdSOClb蛋白有11个α-螺旋,7个β折叠区,11个β-转角。推测二者在花的发育中可能起不同的调控作用。
- 孙晓茜戴洪义张玉刚
- 关键词:柱型苹果MADS-BOX基因克隆
- 柱型苹果GRAS基因家族MdSCR的克隆与生物信息学分析被引量:1
- 2012年
- 以"富士×特拉蒙"杂交后代柱型株系新梢为试材,用同源克隆方法,得到了柱型苹果GRAS基因家族的MdSCR基因,开放阅读框(ORF)长度为1458bp,编码486个氨基酸,推测其蛋白质分子质量为54.894kD,等电点(pI)为5.96,具有GRAS基因家族典型结构域。MdSCR基因与毛果杨(Populus trichocarpa)GRAS转录因子的氨基酸序列具有67.8%的相似性,与江南卷柏(Selaginella moellendorffii)、葡萄(Vitis vinifera)、大豆(Glycine max)的SCARECROW-like氨基酸序列均有58.5%以上的相似性。氨基酸聚类分析表明,苹果和毛果杨、江南卷柏聚类关系最近,其次是葡萄,关系最远的是欧洲赤松;生物信息学分析表明,MdSCR的蛋白质二级结构有208个α-螺旋,54个延伸链和224个无规则折叠区。
- 韩菲戴洪义张玉刚
- 关键词:柱型苹果
- 授粉品种对长富2号苹果果实品质及果汁色值的影响被引量:4
- 2012年
- 采用果实着色面积、硬度和耐贮性均不同的3个苹果品种(系)粉红女士、金冠、94-15为长富2号苹果授粉。结果表明,长富2号苹果果实的单果重、果柄长度和粗度、着色面积与着色程度,贮藏期间的果实硬度、可溶性固形物含量、总糖含量、可滴定酸含量以及果汁的吸光度值、透光率、黄色色差和总色差等各项指标均与授粉品种接近,而果形指数与授粉品种无关。
- 张玉刚戴洪义
- 关键词:苹果长富2号授粉品种果实
- 利用RNA-Seq分析柱型和普通型苹果转录水平差异
- 柱型苹果具有的"独干、节间极短、高萌芽率、极短枝、极紧凑"的树型,特别适合密植栽培和机械化管理,是苹果紧凑树型遗传改良的宝贵资源。因此,挖掘柱型苹果株型形成的相关基因,对于研究苹果株型形成的分子机理,以及通过基因工程改良...
- 张玉刚祝军梁美霞戴洪义
- 关键词:苹果柱型苹果转录组RNA-SEQ
- 文献传递